seq1 = pF1KB5448.tfa, 579 bp
seq2 = pF1KB5448/gi568815595r_49260212.tfa (gi568815595r:49260212_49475589), 215378 bp

>pF1KB5448 579
>gi568815595r:49260212_49475589 (Chr3)

(complement)

1-156  (100001-100156)   100% ->
157-277  (107042-107162)   100% ->
278-408  (112964-113094)   100% ->
409-579  (115208-115378)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCCATCCGGAAGAAACTGGTGATTGTTGGTGATGGAGCCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCCATCCGGAAGAAACTGGTGATTGTTGGTGATGGAGCCTGTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAAGACATGCTTGCTCATAGTCTTCAGCAAGGACCAGTTCCCAGAGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAAGACATGCTTGCTCATAGTCTTCAGCAAGGACCAGTTCCCAGAGGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGTGCCCACAGTGTTTGAGAACTATGTGGCAGATATCGAGGTGGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGTGCCCACAGTGTTTGAGAACTATGTGGCAGATATCGAGGTGGATGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGCAG         GTAGAGTTGGCTTTGTGGGACACAGCTGGGCAGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGCAGGTG...CAGGTAGAGTTGGCTTTGTGGGACACAGCTGGGCAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGATTATGATCGCCTGAGGCCCCTCTCCTACCCAGATACCGATGTTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107077 AGATTATGATCGCCTGAGGCCCCTCTCCTACCCAGATACCGATGTTATAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGATGTGTTTTTCCATCGACAGCCCTGATAGTTTAG         AAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 107127 TGATGTGTTTTTCCATCGACAGCCCTGATAGTTTAGGTG...CAGAAAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATCCCAGAAAAGTGGACCCCAGAAGTCAAGCATTTCTGTCCCAACGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112969 ATCCCAGAAAAGTGGACCCCAGAAGTCAAGCATTTCTGTCCCAACGTGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATCATCCTGGTTGGGAATAAGAAGGATCTTCGGAATGATGAGCACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113019 CATCATCCTGGTTGGGAATAAGAAGGATCTTCGGAATGATGAGCACACAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGCGGGAGCTAGCCAAGATGAAGCAG         GAGCCGGTGAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 113069 GGCGGGAGCTAGCCAAGATGAAGCAGGCA...TAGGAGCCGGTGAAACCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAGAAGGCAGAGATATGGCAAACAGGATTGGCGCTTTTGGGTACATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115223 GAAGAAGGCAGAGATATGGCAAACAGGATTGGCGCTTTTGGGTACATGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTGTTCAGCAAAGACCAAAGATGGAGTGAGAGAGGTTTTTGAAATGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115273 GTGTTCAGCAAAGACCAAAGATGGAGTGAGAGAGGTTTTTGAAATGGCTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CGAGAGCTGCTCTGCAAGCTAGACGTGGGAAGAAAAAATCTGGGTGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115323 CGAGAGCTGCTCTGCAAGCTAGACGTGGGAAGAAAAAATCTGGGTGCCTT

    600     .
    574 GTCTTG
        ||||||
 115373 GTCTTG