seq1 = pF1KB5447.tfa, 1239 bp
seq2 = pF1KB5447/gi568815588r_99297550.tfa (gi568815588r:99297550_99530565), 233016 bp

>pF1KB5447 1239
>gi568815588r:99297550_99530565 (Chr10)

(complement)

1-118  (100001-100118)   100% ->
119-300  (109761-109942)   100% ->
301-424  (123717-123840)   100% ->
425-537  (124317-124429)   100% ->
538-642  (124706-124810)   100% ->
643-793  (126692-126842)   100% ->
794-959  (126932-127097)   100% ->
960-1102  (127844-127986)   100% ->
1103-1239  (132880-133016)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCACCTCCGTCAGTCTTTGCCGAGGTTCCGCAGGCCCAGCCTGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCACCTCCGTCAGTCTTTGCCGAGGTTCCGCAGGCCCAGCCTGTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTCTTCAAGCTCACTGCCGACTTCAGGGAGGATCCGGACCCCCGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTCTTCAAGCTCACTGCCGACTTCAGGGAGGATCCGGACCCCCGCAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAACCTGGGAGTGGGAG         CATATCGCACGGATGACTGCCAT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100101 TCAACCTGGGAGTGGGAGGTA...CAGCATATCGCACGGATGACTGCCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCTGGGTTTTGCCAGTAGTGAAGAAAGTGGAGCAGAAGATTGCTAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109784 CCCTGGGTTTTGCCAGTAGTGAAGAAAGTGGAGCAGAAGATTGCTAATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAATAGCCTAAATCACGAGTATCTGCCAATCCTGGGCCTGGCTGAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109834 CAATAGCCTAAATCACGAGTATCTGCCAATCCTGGGCCTGGCTGAGTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGAGCTGTGCTTCTCGTCTTGCCCTTGGGGATGACAGCCCAGCACTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109884 GGAGCTGTGCTTCTCGTCTTGCCCTTGGGGATGACAGCCCAGCACTCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGAAGCGG         GTAGGAGGTGTGCAATCTTTGGGGGGAACAGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 109934 GAGAAGCGGGTA...CAGGTAGGAGGTGTGCAATCTTTGGGGGGAACAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCACTTCGAATTGGAGCTGATTTCTTAGCGCGTTGGTACAATGGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123749 TGCACTTCGAATTGGAGCTGATTTCTTAGCGCGTTGGTACAATGGAACAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACAACAAGAACACACCTGTCTATGTGTCCTCACCAACCTGGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 123799 ACAACAAGAACACACCTGTCTATGTGTCCTCACCAACCTGGGGTG...CA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    425  AGAATCACAATGCTGTGTTTTCCGCTGCTGGTTTTAAAGACATTCGGTC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124316 GAGAATCACAATGCTGTGTTTTCCGCTGCTGGTTTTAAAGACATTCGGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTATCGCTACTGGGATGCAGAGAAGAGAGGATTGGACCTCCAGGGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124366 CTATCGCTACTGGGATGCAGAGAAGAGAGGATTGGACCTCCAGGGCTTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGAATGATCTGGAG         AATGCTCCTGAGTTCTCCATTGTTGTC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 124416 TGAATGATCTGGAGGTG...CAGAATGCTCCTGAGTTCTCCATTGTTGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTCCACGCCTGTGCACACAACCCAACTGGGATTGACCCAACTCCGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124733 CTCCACGCCTGTGCACACAACCCAACTGGGATTGACCCAACTCCGGAGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GTGGAAGCAGATTGCTTCTGTCATGAAG         CACCGGTTTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 124783 GTGGAAGCAGATTGCTTCTGTCATGAAGGTA...CAGCACCGGTTTCTGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCCCCTTCTTTGACTCAGCCTATCAGGGCTTCGCATCTGGAAACCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126705 TCCCCTTCTTTGACTCAGCCTATCAGGGCTTCGCATCTGGAAACCTGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGAGATGCCTGGGCCATTCGCTATTTTGTGTCTGAAGGCTTCGAGTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126755 AGAGATGCCTGGGCCATTCGCTATTTTGTGTCTGAAGGCTTCGAGTTCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTGTGCCCAGTCCTTCTCCAAGAACTTCGGGCTCTACA         ATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 126805 CTGTGCCCAGTCCTTCTCCAAGAACTTCGGGCTCTACAGTG...TAGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGAGAGTCGGGAATCTGACTGTGGTTGGAAAAGAACCTGAGAGCATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126935 AGAGAGTCGGGAATCTGACTGTGGTTGGAAAAGAACCTGAGAGCATCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAAGTCCTTTCCCAGATGGAGAAGATCGTGCGGATTACTTGGTCCAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126985 CAAGTCCTTTCCCAGATGGAGAAGATCGTGCGGATTACTTGGTCCAATCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCCCGCCCAGGGAGCACGAATTGTGGCCAGCACCCTCTCTAACCCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127035 CCCCGCCCAGGGAGCACGAATTGTGGCCAGCACCCTCTCTAACCCTGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCTTTGAGGAATG         GACAGGTAATGTGAAGACAATGGCTGAC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 127085 TCTTTGAGGAATGGTA...CAGGACAGGTAATGTGAAGACAATGGCTGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CGGATTCTGACCATGAGATCTGAACTCAGGGCACGACTAGAAGCCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127872 CGGATTCTGACCATGAGATCTGAACTCAGGGCACGACTAGAAGCCCTCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AACCCCTGGGACCTGGAACCACATCACTGATCAAATTGGCATGTTCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127922 AACCCCTGGGACCTGGAACCACATCACTGATCAAATTGGCATGTTCAGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCACTGGGTTGAACC         CCAAGCAGGTTGAGTATCTGGTCAAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 127972 TCACTGGGTTGAACCGTA...CAGCCAAGCAGGTTGAGTATCTGGTCAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GAAAAGCACATCTACCTGCTGCCAAGTGGTCGAATCAACGTGAGTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132906 GAAAAGCACATCTACCTGCTGCCAAGTGGTCGAATCAACGTGAGTGGCTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AACCACCAAAAATCTAGATTACGTGGCCACCTCCATCCATGAAGCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132956 AACCACCAAAAATCTAGATTACGTGGCCACCTCCATCCATGAAGCAGTCA

   1300     .    :
   1229 CCAAAATCCAG
        |||||||||||
 133006 CCAAAATCCAG