seq1 = pF1KB5445.tfa, 813 bp
seq2 = pF1KB5445/gi568815589f_131189998.tfa (gi568815589f:131189998_131408284), 218287 bp

>pF1KB5445 813
>gi568815589f:131189998_131408284 (Chr9)

1-451  (100001-100451)   100% ->
452-813  (117926-118287)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAGCTTCCCAGAGCCGGGCCCGTGCCCGGGACCGCAACAACGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCAGCTTCCCAGAGCCGGGCCCGTGCCCGGGACCGCAACAACGTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACCGGGCTGAGTTCCTGTCCCTGAACCAGCCCCCCAAGGGGGGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAACCGGGCTGAGTTCCTGTCCCTGAACCAGCCCCCCAAGGGGGGCCCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCCCCGCAGCTCGGGCAGAAAGGCCTCGGGCCCATCAGCACAGCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCCCCGCAGCTCGGGCAGAAAGGCCTCGGGCCCATCAGCACAGCCCCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCTGCTGGTGACGGGGCCAGAGAGCGACGCCAGTCACAGCAGCTGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCTGCTGGTGACGGGGCCAGAGAGCGACGCCAGTCACAGCAGCTGCCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAGGACTGCATGCAGCTGAACCCCTCCTTCAAGGGCATCGCCTTCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAGGACTGCATGCAGCTGAACCCCTCCTTCAAGGGCATCGCCTTCAACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCTGCTGGCCATCGATATCTGTATGTCCAAGCGGCTGGGGGTGTGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCCTGCTGGCCATCGATATCTGTATGTCCAAGCGGCTGGGGGTGTGCGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCCGGGCGGCGTCCTGGGCCAGTGCCCGCTCCATGGTCAAGCTCATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCCGGGCGGCGTCCTGGGCCAGTGCCCGCTCCATGGTCAAGCTCATCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATCACGGGCCACGGCATCCCCTGGATCGGAGGCACCATCCTCTGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATCACGGGCCACGGCATCCCCTGGATCGGAGGCACCATCCTCTGCCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGAAGAGCAGCACACTGGCCGGCCAGGAGGTGCTCATGAATCTGCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGAAGAGCAGCACACTGGCCGGCCAGGAGGTGCTCATGAATCTGCTCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 G         CCCTGCTCCTGGACATCATGACGGTGGCCGGCGTGCAGAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGTG...CAGCCCTGCTCCTGGACATCATGACGGTGGCCGGCGTGCAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCTCATCAAGCGGCGCGGCCCGTACGAGATGAGCCCCAGCCTCCTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 117966 GCTCATCAAGCGGCGCGGCCCGTACGAGACGAGCCCCAGCCTCCTGGACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACCTCACCATGGACATCTACGCCTTCCCGGCCGGGCACGCCAGCCGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118016 ACCTCACCATGGACATCTACGCCTTCCCGGCCGGGCACGCCAGCCGCGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCCATGGTGTCCAAGTTCTTCCTCAGCCACCTGGTGCTGGCGGTGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118066 GCCATGGTGTCCAAGTTCTTCCTCAGCCACCTGGTGCTGGCGGTGCCCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCGCGTGCTGCTGGTGCTCTGGGCCCTCTGCGTGGGCCTGTCCCGCGTGA
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118116 GCGTGTGCTGCTGGTGCTCTGGGCCCTCTGCGTGGGCCTGTCCCGCGTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGATCGGCCGCCACCACGTCACGGACGTCCTCTCCGGCTTTGTCATCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118166 TGATCGGCCGCCACCACGTCACGGACGTCCTCTCCGGCTTTGTCATCGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TACCTCCAGTTCCGTCTGGTGGAGCTGGTCTGGATGCCCTCCAGCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118216 TACCTCCAGTTCCGTCTGGTGGAGCTGGTCTGGATGCCCTCCAGCACCTG

    800     .    :    .    :
    792 CCAGATGCTCATCTCTGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||
 118266 CCAGATGCTCATCTCTGCCTGG