seq1 = pF1KB5443.tfa, 579 bp
seq2 = pF1KB5443/gi568815582r_49179407.tfa (gi568815582r:49179407_49381465), 202059 bp

>pF1KB5443 579
>gi568815582r:49179407_49381465 (Chr16)

(complement)

1-264  (100001-100264)   100% ->
265-384  (100424-100543)   100% ->
385-579  (101865-102059)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGGCGTCCTGGAGCTGCTGCTGCTGGGGGCTGCGTGGCTGGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGGCGTCCTGGAGCTGCTGCTGCTGGGGGCTGCGTGGCTGGCGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCGGCCCGCGGGCAGAATGAGACGGAGCCCATCGTGCTGGAGGGCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCGGCCCGCGGGCAGAATGAGACGGAGCCCATCGTGCTGGAGGGCAAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTGGTGGTGTGCGACTCCAACCCCACGTCCGACCCCACGGGCACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTGGTGGTGTGCGACTCCAACCCCACGTCCGACCCCACGGGCACTGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGGCATCTCTGTGCGCTCTGGCAGCGCCAAGGTGGCTTTCTCTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGGCATCTCTGTGCGCTCTGGCAGCGCCAAGGTGGCTTTCTCTGCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGGAGCACCAACCACGAGCCGTCCGAGATGAGTAATCGCACCATGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGGAGCACCAACCACGAGCCGTCCGAGATGAGTAATCGCACCATGATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTACTTCGACCAG         GTACTAGTGAACATTGGGAACAACTTT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTACTTCGACCAGGTG...TAGGTACTAGTGAACATTGGGAACAACTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GATTCAGAACGCAGCACTTTCATCGCCCCGCGCAAAGGGATCTACAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GATTCAGAACGCAGCACTTTCATCGCCCCGCGCAAAGGGATCTACAGTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TAACTTCCACGTGGTAAAAGTCTACAACAGACAAACCATACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100501 TAACTTCCACGTGGTAAAAGTCTACAACAGACAAACCATACAGGTC...C

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    385   GTGAGCCTCATGCTAAACGGGTGGCCGGTGATTTCAGCCTTCGCTGGT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101863 AGGTGAGCCTCATGCTAAACGGGTGGCCGGTGATTTCAGCCTTCGCTGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GACCAGGACGTGACCCGGGAGGCCGCCAGCAACGGAGTCCTAATCCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101913 GACCAGGACGTGACCCGGGAGGCCGCCAGCAACGGAGTCCTAATCCAAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGAGAAAGGCGACCGAGCATACCTCAAGCTGGAGCGGGGAAACTTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101963 GGAGAAAGGCGACCGAGCATACCTCAAGCTGGAGCGGGGAAACTTGATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    533 GGGGCTGGAAGTACTCGACCTTCTCCGGATTCCTGGTGTTTCCTCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102013 GGGGCTGGAAGTACTCGACCTTCTCCGGATTCCTGGTGTTTCCTCTC