seq1 = pF1KB5427.tfa, 1134 bp
seq2 = pF1KB5427/gi568815592r_161036543.tfa (gi568815592r:161036543_161332213), 295671 bp

>pF1KB5427 1134
>gi568815592r:161036543_161332213 (Chr6)

(complement)

1-178  (100001-100178)   100% ->
179-348  (165797-165966)   100% ->
349-510  (177904-178065)   100% ->
511-664  (178715-178868)   100% ->
665-767  (182925-183027)   100% ->
768-843  (185615-185690)   100% ->
844-1042  (192594-192792)   100% ->
1043-1134  (195580-195671)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCTCGCGGGACTGCTGAAGTCTCAGTTCCTGTGCCACCTGGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACCTCGCGGGACTGCTGAAGTCTCAGTTCCTGTGCCACCTGGTCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCTACGTCTTTATTGCCTCAGGGCTAATCATCAACACCATTCAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGCTACGTCTTTATTGCCTCAGGGCTAATCATCAACACCATTCAGCTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCACTCTCCTCCTCTGGCCCATTAACAAGCAGCTCTTCCGGAAGATCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCACTCTCCTCCTCTGGCCCATTAACAAGCAGCTCTTCCGGAAGATCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGCAGACTGTCCTATTGCATCTCAAGCC         AGCTGGTGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100151 TGCAGACTGTCCTATTGCATCTCAAGCCGTA...CAGAGCTGGTGATGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGGAGTGGTGGTCGGGCACGGAATGCACCATCTTCACGGACCCGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165810 GCTGGAGTGGTGGTCGGGCACGGAATGCACCATCTTCACGGACCCGCGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTACCTCAAGTATGGGAAGGAAAATGCCATCGTGGTTCTCAACCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165860 CCTACCTCAAGTATGGGAAGGAAAATGCCATCGTGGTTCTCAACCACAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTTGAAATTGACTTTCTGTGTGGCTGGAGCCTGTCCGAACGCTTTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165910 TTTGAAATTGACTTTCTGTGTGGCTGGAGCCTGTCCGAACGCTTTGGGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GTTAGGG         GGCTCCAAGGTCCTGGCCAAGAAAGAGCTGGCCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165960 GTTAGGGGTA...CAGGGCTCCAAGGTCCTGGCCAAGAAAGAGCTGGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGTCCCAATTATCGGCTGGATGTGGTACTTCACCGAGATGGTCTTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177938 ATGTCCCAATTATCGGCTGGATGTGGTACTTCACCGAGATGGTCTTCTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCGCGCAAGTGGGAGCAGGATCGCAAGACGGTTGCCACCAGTTTGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177988 TCGCGCAAGTGGGAGCAGGATCGCAAGACGGTTGCCACCAGTTTGCAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCTCCGGGACTACCCCGAGAAGTATTTT         TTCCTGATTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 178038 CCTCCGGGACTACCCCGAGAAGTATTTTGTA...CAGTTCCTGATTCACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GTGAGGGCACACGGTTCACGGAGAAGAAGCATGAGATCAGCATGCAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178728 GTGAGGGCACACGGTTCACGGAGAAGAAGCATGAGATCAGCATGCAGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCCCGGGCCAAGGGGCTGCCTCGCCTCAAGCATCACCTGTTGCCACGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178778 GCCCGGGCCAAGGGGCTGCCTCGCCTCAAGCATCACCTGTTGCCACGAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAAGGGCTTCGCCATCACCGTGAGGAGCTTGAGAAATGTAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 178828 CAAGGGCTTCGCCATCACCGTGAGGAGCTTGAGAAATGTAGGTA...TAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TTTCAGCTGTATATGACTGTACACTCAATTTCAGAAATAATGAAAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182925 TTTCAGCTGTATATGACTGTACACTCAATTTCAGAAATAATGAAAATCCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ACACTGCTGGGAGTCCTAAACGGAAAGAAATACCATGCAGATTTGTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182975 ACACTGCTGGGAGTCCTAAACGGAAAGAAATACCATGCAGATTTGTATGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TAG         GAGGATCCCACTGGAAGACATCCCTGAAGACGATGACG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183025 TAGGTA...CAGGAGGATCCCACTGGAAGACATCCCTGAAGACGATGACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGTGCTCGGCCTGGCTGCACAAGCTCTACCAGGAGAAG         GAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 185653 AGTGCTCGGCCTGGCTGCACAAGCTCTACCAGGAGAAGGTC...CAGGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GCCTTTCAGGAGGAGTACTACAGGACGGGCACCTTCCCAGAGACGCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192597 GCCTTTCAGGAGGAGTACTACAGGACGGGCACCTTCCCAGAGACGCCCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGTGCCCCCCCGGCGGCCCTGGACCCTCGTGAACTGGCTGTTTTGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192647 GGTGCCCCCCCGGCGGCCCTGGACCCTCGTGAACTGGCTGTTTTGGGCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CGCTGGTGCTCTACCCTTTCTTCCAGTTCCTGGTCAGCATGATCAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192697 CGCTGGTGCTCTACCCTTTCTTCCAGTTCCTGGTCAGCATGATCAGGAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GGGTCTTCCCTGACGCTGGCCAGCTTCATCCTCGTCTTCTTTGTGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 192747 GGGTCTTCCCTGACGCTGGCCAGCTTCATCCTCGTCTTCTTTGTGGGTG.

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1043      CCTCTGTGGGAGTTCGATGGATGATTGGTGTGACGGAAATTGACA
        ..>>>|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192797 ..CAGCCTCCGTGGGAGTTCGATGGATGATTGGTGTGACGGAAATTGACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1088 AGGGCTCTGCCTACGGCAACTCTGACAGCAAGCAGAAACTGAATGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195625 AGGGCTCTGCCTACGGCAACTCTGACAGCAAGCAGAAACTGAATGAC