seq1 = pF1KB5418.tfa, 1452 bp
seq2 = pF1KB5418/gi568815596r_200753309.tfa (gi568815596r:200753309_200961862), 208554 bp

>pF1KB5418 1452
>gi568815596r:200753309_200961862 (Chr2)

(complement)

1-161  (100001-100161)   100% ->
162-390  (100397-100625)   100% ->
391-481  (101648-101738)   100% ->
482-548  (102117-102183)   100% ->
549-665  (103774-103890)   100% ->
666-832  (103979-104145)   100% ->
833-927  (104878-104972)   100% ->
928-1057  (105052-105181)   100% ->
1058-1140  (106777-106859)   100% ->
1141-1220  (107168-107247)   100% ->
1221-1311  (107870-107960)   100% ->
1312-1452  (108414-108554)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGACACTCAAAGAGAACTTACTGTCCTGATTGGGATGACAAGGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGACACTCAAAGAGAACTTACTGTCCTGATTGGGATGACAAGGATTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGATTATGGAAAATGGAGGAGCAGCAGCAGTCATAAAAGAAGGAAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGATTATGGAAAATGGAGGAGCAGCAGCAGTCATAAAAGAAGGAAGAGAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CACATAGCAGTGCCCAGGAGAACAAGCGCTGCAAATACAATCACTCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CACATAGCAGTGCCCAGGAGAACAAGCGCTGCAAATACAATCACTCTAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGTGTGATAG         CCATTATTTGGAAAGCAGGTCTATAAATGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGTGTGATAGGTA...TAGCCATTATTTGGAAAGCAGGTCTATAAATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAAGATTATCATAGTCGACGCTACATTGATGAGTACAGAAATGACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100427 GAAAGATTATCATAGTCGACGCTACATTGATGAGTACAGAAATGACTACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTCAAGGATGTGAACCTGGACATCGCCAAAGAGACCATGAAAGCCGGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100477 CTCAAGGATGTGAACCTGGACATCGCCAAAGAGACCATGAAAGCCGGTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGAACCATAGTAGCAAGTCTTCTGGTAGAAGTGGAAGAAGTAGTTATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100527 CAGAACCATAGTAGCAAGTCTTCTGGTAGAAGTGGAAGAAGTAGTTATAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AAGCAAACACAGGATTCACCACAGTACTTCACATCGTCGTTCACATGGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100577 AAGCAAACACAGGATTCACCACAGTACTTCACATCGTCGTTCACATGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    391         AAGAGTCACCGAAGGAAAAGAACCAGGAGTGTAGAGGATGAT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100627 TA...CAGAAGAGTCACCGAAGGAAAAGAACCAGGAGTGTAGAGGATGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGGAGGGTCACCTGATCTGTCAGAGTGGAGACGTACTAAGTGCAAGAT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 101690 GAGGAGGGTCACCTGATCTGTCAGAGTGGAGACGTACTAAGTGCAAGATG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    482         ATGAAATTGTTGATACTTTAGGTGAAGGAGCTTTTGGAAAAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101740 TA...TAGATGAAATTGTTGATACTTTAGGTGAAGGAGCTTTTGGAAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTGTGGAGTGCATCGATCATAAAGC         GGGAGGTAGACATGTA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102159 TTGTGGAGTGCATCGATCATAAAGCGTA...CAGGGGAGGTAGACATGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCAGTAAAAATAGTTAAAAATGTGGATAGATACTGTGAAGCTGCTCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103790 GCAGTAAAAATAGTTAAAAATGTGGATAGATACTGTGAAGCTGCTCGCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGAAATACAAGTTCTGGAACATCTGAATACAACAGACCCCAACAGTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103840 AGAAATACAAGTTCTGGAACATCTGAATACAACAGACCCCAACAGTACTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 T         CCGCTGTGTCCAGATGTTGGAATGGTTTGAGCATCATGGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103890 TGTA...TAGCCGCTGTGTCCAGATGTTGGAATGGTTTGAGCATCATGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CACATTTGCATTGTTTTTGAACTATTGGGACTTAGTACTTACGACTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104019 CACATTTGCATTGTTTTTGAACTATTGGGACTTAGTACTTACGACTTCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TAAAGAAAATGGTTTTCTACCATTTCGACTGGATCATATCAGAAAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104069 TAAAGAAAATGGTTTTCTACCATTTCGACTGGATCATATCAGAAAGATGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CATATCAGATATGCAAGTCTGTGAATT         TTTTGCACAGTAAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 104119 CATATCAGATATGCAAGTCTGTGAATTGTA...CAGTTTTGCACAGTAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AAGTTGACTCACACAGACTTAAAGCCTGAAAACATCTTATTTGTGCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104892 AAGTTGACTCACACAGACTTAAAGCCTGAAAACATCTTATTTGTGCAGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGACTACACAGAGGCGTATAATCCCAAAATA         AAACGTGATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 104942 TGACTACACAGAGGCGTATAATCCCAAAATAGTA...CAGAAACGTGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AACGCACCTTAATAAATCCAGATATTAAAGTTGTAGACTTTGGTAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105062 AACGCACCTTAATAAATCCAGATATTAAAGTTGTAGACTTTGGTAGTGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ACATATGATGACGAACATCACAGTACATTGGTATCTACAAGACATTATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105112 ACATATGATGACGAACATCACAGTACATTGGTATCTACAAGACATTATAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AGCACCTGAAGTTATTTTAG         CCCTAGGGTGGTCCCAACCAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 105162 AGCACCTGAAGTTATTTTAGGTG...CAGCCCTAGGGTGGTCCCAACCAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GTGATGTCTGGAGCATAGGATGCATTCTTATTGAATACTATCTTGGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106798 GTGATGTCTGGAGCATAGGATGCATTCTTATTGAATACTATCTTGGGTTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 ACCGTATTTCCA         ACACACGATAGTAAGGAGCATTTAGCAAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 106848 ACCGTATTTCCAGTA...TAGACACACGATAGTAAGGAGCATTTAGCAAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GATGGAAAGGATTCTTGGACCTCTACCAAAACATATGATACAGAAAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107197 GATGGAAAGGATTCTTGGACCTCTACCAAAACATATGATACAGAAAACCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 G         GAAACGTAAATATTTTCACCACGATCGATTAGACTGGGAT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107247 GGTA...TAGGAAACGTAAATATTTTCACCACGATCGATTAGACTGGGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GAACACAGTTCTGCCGGCAGATATGTTTCAAGACGCTGTAAACCTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107910 GAACACAGTTCTGCCGGCAGATATGTTTCAAGACGCTGTAAACCTCTGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 G         GAATTTATGCTTTCTCAAGATGTTGAACATGAGCGTCTCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107960 GGTA...CAGGAATTTATGCTTTCTCAAGATGTTGAACATGAGCGTCTCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 TTGACCTCATTCAGAAAATGTTGGAGTATGATCCAGCCAAAAGAATTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108454 TTGACCTCATTCAGAAAATGTTGGAGTATGATCCAGCCAAAAGAATTACT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CTCAGAGAAGCCTTAAAGCATCCTTTCTTTGACCTTCTGAAGAAAAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108504 CTCAGAGAAGCCTTAAAGCATCCTTTCTTTGACCTTCTGAAGAAAAGTAT

   1550 
   1452 A
        |
 108554 A