seq1 = pF1KB5396.tfa, 1899 bp
seq2 = pF1KB5396/gi568815597r_23210457.tfa (gi568815597r:23210457_23441008), 230552 bp

>pF1KB5396 1899
>gi568815597r:23210457_23441008 (Chr1)

(complement)

1-157  (100001-100157)   100% ->
158-276  (102401-102519)   100% ->
277-384  (103148-103255)   100% ->
385-498  (107378-107491)   100% ->
499-675  (117277-117453)   100% ->
676-811  (119346-119481)   100% ->
812-1017  (122321-122526)   100% ->
1018-1167  (127307-127456)   100% ->
1168-1289  (129687-129808)   100% ->
1290-1899  (129943-130552)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTAATCAGGTGAATGGTAATGCGGTACAGTTAAAAGAAGAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTAATCAGGTGAATGGTAATGCGGTACAGTTAAAAGAAGAGGAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCAATGGATACTTCCAGTGTAACTCACACAGAACACTACAAGACACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACCAATGGATACTTCCAGTGTAACTCACACAGAACACTACAAGACACTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAGAGGCAGGCCTCCCACAGAAGGTGGCAGAAAGACTTGATGAAATATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TAGAGGCAGGCCTCCCACAGAAGGTGGCAGAAAGACTTGATGAAATATTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGACAG         GATTGGTAGCTTATGTCGATCTTGATGAAAGAGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGACAGGTA...TAGGATTGGTAGCTTATGTCGATCTTGATGAAAGAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AATTGATGCTCTCAGGGAATTTAATGAAGAAGGAGCTCTGTCTGTACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102435 AATTGATGCTCTCAGGGAATTTAATGAAGAAGGAGCTCTGTCTGTACTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCAGTTCAAGGAAAGTGACTTATCACATGTTCAG         AACAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 102485 AGCAGTTCAAGGAAAGTGACTTATCACATGTTCAGGTA...TAGAACAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGTGCATTTTTATGTGGAGTTATGAAGACCTACAGGCAGAGAGAGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103154 AGTGCATTTTTATGTGGAGTTATGAAGACCTACAGGCAGAGAGAGAAACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGGGAGCAAGGTGCAAGAGTCCACAAAGGGACCTGATGAAGCGAAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103204 GGGGAGCAAGGTGCAAGAGTCCACAAAGGGACCTGATGAAGCGAAGATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AG         GCCTTGCTTGAGAGAACTGGTTATACTCTGGATGTAACC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103254 AGGTA...TAGGCCTTGCTTGAGAGAACTGGTTATACTCTGGATGTAACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACAGGACAGAGGAAGTATGGTGGTCCTCCACCAGACAGTGTGTACTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107417 ACAGGACAGAGGAAGTATGGTGGTCCTCCACCAGACAGTGTGTACTCTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CGTGCAACCTGGAATTGGAACGGAG         GTATTTGTAGGCAAAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 107467 CGTGCAACCTGGAATTGGAACGGAGGTA...CAGGTATTTGTAGGCAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TACCAAGGGATTTATATGAGGATGAGTTGGTGCCCCTTTTTGAGAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117293 TACCAAGGGATTTATATGAGGATGAGTTGGTGCCCCTTTTTGAGAAGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGACCCATTTGGGATCTACGTCTTATGATGGATCCACTGTCCGGTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117343 GGACCCATTTGGGATCTACGTCTTATGATGGATCCACTGTCCGGTCAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TAGAGGGTATGCATTTATCACCTTCTGTGGAAAGGAAGCTGCACAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117393 TAGAGGGTATGCATTTATCACCTTCTGTGGAAAGGAAGCTGCACAGGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCGTGAAACTG         TGTGACAGCTATGAAATTCGCCCTGGTAAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 117443 CCGTGAAACTGGTA...CAGTGTGACAGCTATGAAATTCGCCCTGGTAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CACCTTGGAGTGTGCATTTCTGTGGCAAACAACAGACTTTTTGTTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119376 CACCTTGGAGTGTGCATTTCTGTGGCAAACAACAGACTTTTTGTTGGATC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CATTCCGAAGAATAAGACTAAAGAAAACATTTTGGAAGAATTCAGTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119426 CATTCCGAAGAATAAGACTAAAGAAAACATTTTGGAAGAATTCAGTAAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCACAG         AGGGTTTGGTGGACGTTATTCTCTATCATCAACCC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119476 TCACAGGTA...CAGAGGGTTTGGTGGACGTTATTCTCTATCATCAACCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GATGACAAAAAGAAGAATCGGGGGTTCTGCTTCCTTGAATATGAGGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122356 GATGACAAAAAGAAGAATCGGGGGTTCTGCTTCCTTGAATATGAGGATCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CAAGTCAGCAGCACAAGCCAGACGCCGGCTGATGAGTGGAAAAGTAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122406 CAAGTCAGCAGCACAAGCCAGACGCCGGCTGATGAGTGGAAAAGTAAAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGTGGGGAAATGTAGTTACAGTTGAATGGGCTGACCCTGTGGAAGAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122456 TGTGGGGAAATGTAGTTACAGTTGAATGGGCTGACCCTGTGGAAGAACCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GATCCAGAAGTCATGGCTAAG         GTAAAAGTTTTGTTTGTGAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 122506 GATCCAGAAGTCATGGCTAAGGTA...TAGGTAAAAGTTTTGTTTGTGAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AAACTTGGCTACTACGGTGACAGAAGAAATATTGGAAAAGTCATTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127327 AAACTTGGCTACTACGGTGACAGAAGAAATATTGGAAAAGTCATTTTCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AATTTGGAAAACTCGAAAGAGTAAAGAAGTTGAAAGATTATGCATTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127377 AATTTGGAAAACTCGAAAGAGTAAAGAAGTTGAAAGATTATGCATTTGTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CATTTTGAAGACAGAGGAGCAGCTGTTAAG         GCTATGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 127427 CATTTTGAAGACAGAGGAGCAGCTGTTAAGGTA...TAGGCTATGGATGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AATGAATGGCAAAGAAATAGAAGGGGAAGAAATTGAAATAGTCTTAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129698 AATGAATGGCAAAGAAATAGAAGGGGAAGAAATTGAAATAGTCTTAGCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AGCCACCAGACAAGAAAAGGAAAGAGCGCCAAGCTGCTAGACAGGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129748 AGCCACCAGACAAGAAAAGGAAAGAGCGCCAAGCTGCTAGACAGGCCTCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 AGAAGCACTGC         GTATGAAGATTATTACTACCACCCTCCTCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 129798 AGAAGCACTGCGTG...TAGGTATGAAGATTATTACTACCACCCTCCTCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TCGCATGCCACCTCCAATTAGAGGTCGGGGTCGTGGTGGGGGGAGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129973 TCGCATGCCACCTCCAATTAGAGGTCGGGGTCGTGGTGGGGGGAGAGGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GATATGGCTACCCTCCAGATTACTACGGCTATGAAGATTACTATGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130023 GATATGGCTACCCTCCAGATTACTACGGCTATGAAGATTACTATGATGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TACTATGGTTATGATTATCACGACTATCGTGGAGGCTATGAAGATCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130073 TACTATGGTTATGATTATCACGACTATCGTGGAGGCTATGAAGATCCCTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CTACGGCTATGATGATGGCTATGCAGTAAGAGGAAGAGGAGGAGGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130123 CTACGGCTATGATGATGGCTATGCAGTAAGAGGAAGAGGAGGAGGAAGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 GAGGGCGAGGTGCTCCACCACCACCAAGGGGGAGGGGAGCACCACCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130173 GAGGGCGAGGTGCTCCACCACCACCAAGGGGGAGGGGAGCACCACCTCCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 AGAGGTAGAGCTGGCTATTCACAGAGGGGGGCACCTTTGGGACCACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130223 AGAGGTAGAGCTGGCTATTCACAGAGGGGGGCACCTTTGGGACCACCAAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 AGGCTCTAGGGGTGGCAGAGGGGGTCCTGCTCAACAGCAGAGAGGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130273 AGGCTCTAGGGGTGGCAGAGGGGGTCCTGCTCAACAGCAGAGAGGCCGTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 GTTCCCGTGGATCTCGGGGCAATCGTGGGGGCAATGTAGGAGGCAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130323 GTTCCCGTGGATCTCGGGGCAATCGTGGGGGCAATGTAGGAGGCAAGAGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 AAGGCAGATGGGTACAACCAGCCTGATTCCAAGCGTCGTCAGACCAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130373 AAGGCAGATGGGTACAACCAGCCTGATTCCAAGCGTCGTCAGACCAACAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 CCAACAGAACTGGGGTTCCCAACCCATCGCTCAGCAGCCGCTTCAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130423 CCAACAGAACTGGGGTTCCCAACCCATCGCTCAGCAGCCGCTTCAGCAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 GTGGTGACTATTCTGGTAACTATGGTTACAATAATGACAACCAGGAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130473 GTGGTGACTATTCTGGTAACTATGGTTACAATAATGACAACCAGGAATTT

   1950     .    :    .    :    .    :
   1870 TATCAGGATACTTATGGGCAACAGTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 130523 TATCAGGATACTTATGGGCAACAGTGGAAG