seq1 = pF1KB5389.tfa, 1437 bp
seq2 = pF1KB5389/gi568815582f_70199298.tfa (gi568815582f:70199298_70471983), 272686 bp

>pF1KB5389 1437
>gi568815582f:70199298_70471983 (Chr16)

1-57  (100001-100057)   100% ->
58-106  (113312-113360)   100% ->
107-160  (115605-115658)   100% ->
161-296  (116672-116807)   100% ->
297-389  (118199-118291)   100% ->
390-492  (125288-125390)   100% ->
493-607  (126277-126391)   100% ->
608-785  (129995-130172)   100% ->
786-1023  (130534-130771)   100% ->
1024-1186  (132425-132587)   100% ->
1187-1378  (133671-133862)   100% ->
1379-1437  (134224-134282)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACTGACTCATGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAAGCTGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCACTGACTCATGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAAGCTGCGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAGTCG         TTGAGCAACTTGCATCTTAAGGAAGAGAAAATCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGAGTCGGTG...TAGTTGAGCAACTTGCATCTTAAGGAAGAGAAAATCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AACCAGATACCAATG         GTGCTGTTGTCAAGACCAATGCCAAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 113346 AACCAGATACCAATGGTA...AAGGTGCTGTTGTCAAGACCAATGCCAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GCAGAGAAGACAGATGAAGAAGAGAAAG         AGGACAGAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 115631 GCAGAGAAGACAGATGAAGAAGAGAAAGGTA...CAGAGGACAGAGCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 CCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116685 CCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ACCAAGTGGAAGTCCTGCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116735 ACCAAGTGGAAGTCCTGCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAGTCTTTTGAAGAGCTTCGGCT         GAAACCACAGCTTCTCCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 116785 AAGTCTTTTGAAGAGCTTCGGCTGTG...TAGGAAACCACAGCTTCTCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 AGGAGTCTATGCCATGGGTTTCAATCGTCCATCCAAGATACAAGAGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118217 AGGAGTCTATGCCATGGGTTTCAATCGTCCATCCAAGATACAAGAGAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CATTGCCACTGATGCTTGCTGAGCC         CCCACAGAACTTAATT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 118267 CATTGCCACTGATGCTTGCTGAGCCGTA...CAGCCCACAGAACTTAATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GCCCAATCTCAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCCTTCGTGCTGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125304 GCCCAATCTCAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCCTTCGTGCTGGCCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAG         TGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 125354 GCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGGTA...CAGTGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TATGTCTCTCCCCAACGTATGAGCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126281 TATGTCTCTCCCCAACGTATGAGCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTGTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126331 GAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTGTTCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AGGCAATAAAT         TGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 126381 AGGCAATAAATGTG...CAGTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTGCTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130025 TTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTGCTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 TTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130075 TTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 130125 CATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    786        GATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCCGCCACC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130175 A...CAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCCGCCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130577 TTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CGTTATCAAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130627 CGTTATCAAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCAGGCCTTGTGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130677 ACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCAGGCCTTGTGTAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCAT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 130727 CTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATGTG..

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024     ACTCGCAAAACAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130777 .CAGACTCGCAAAACAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAACAGAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132471 GCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAACAGAGGGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132521 GCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CAACGTGTGTGCCCGCG         GCATTGATGTTGAACAAGTGTCTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 132571 CAACGTGTGTGCCCGCGGTG...CAGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133695 TCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133745 GAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CCTGGCAGTGAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133795 CCTGGCAGTGAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GAATCCAGGAGCATTTTA         ATAAGAAGATAGAAAGATTGGAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 133845 GAATCCAGGAGCATTTTAGTG...CAGATAAGAAGATAGAAAGATTGGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .
   1402 ACAGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134247 ACAGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC