seq1 = pF1KB5387.tfa, 1629 bp
seq2 = pF1KB5387/gi568815591r_99992935.tfa (gi568815591r:99992935_100199076), 206142 bp

>pF1KB5387 1629
>gi568815591r:99992935_100199076 (Chr7)

(complement)

1-54  (100001-100054)   100% ->
55-192  (100362-100499)   100% ->
193-342  (100787-100936)   100% ->
343-457  (101129-101243)   100% ->
458-589  (101332-101463)   100% ->
590-673  (101693-101776)   100% ->
674-1067  (102910-103303)   100% ->
1068-1151  (103607-103690)   98% ->
1152-1320  (104736-104904)   100% ->
1321-1430  (105676-105785)   100% ->
1431-1629  (105944-106142)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGGTGGCCACTTACACTTGTGACCAGTGTGGGGCAGAGACCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGGTGGCCACTTACACTTGTGACCAGTGTGGGGCAGAGACCTACCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCG         ATCCAGTCTCCCACTTTCATGCCTCTGATCATGTGCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCGGTA...TAGATCCAGTCTCCCACTTTCATGCCTCTGATCATGTGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAAGCCAGGAGTGCCAAACCAACCGCTCAGGAGGGCGGCTGTATCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100399 CAAGCCAGGAGTGCCAAACCAACCGCTCAGGAGGGCGGCTGTATCTGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACACGGGGCTCCAGATTCATCAAATTCCAGGAGATGAAGATGCAAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100449 ACACGGGGCTCCAGATTCATCAAATTCCAGGAGATGAAGATGCAAGAACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 T         AGTGATCAGGTGCCTGTGGGAAATATCCCTCGTAGTATCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100499 TGTG...TAGAGTGATCAGGTGCCTGTGGGAAATATCCCTCGTAGTATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CGGTGCTGGTAGAAGGAGAGAACACAAGGATTGCCCAGCCTGGAGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100827 CGGTGCTGGTAGAAGGAGAGAACACAAGGATTGCCCAGCCTGGAGACCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTCAGCGTCACTGGTATTTTCTTGCCAATCCTGCGCACTGGGTTCCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100877 GTCAGCGTCACTGGTATTTTCTTGCCAATCCTGCGCACTGGGTTCCGACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGTGGTACAG         GGTTTACTCTCAGAAACCTACCTGGAAGCCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100927 GGTGGTACAGGTA...AAGGGTTTACTCTCAGAAACCTACCTGGAAGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATCGGATTGTGAAGATGAACAAGAGTGAGGATGATGAGTCTGGGGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101160 ATCGGATTGTGAAGATGAACAAGAGTGAGGATGATGAGTCTGGGGCTGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGCTCACCAGGGAGGAGCTGAGGCAAATTGCAG         AGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101210 GAGCTCACCAGGGAGGAGCTGAGGCAAATTGCAGGTG...CAGAGGAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTTCTACGAAAAGCTGGCAGCTTCAATCGCCCCAGAAATATACGGGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101339 TTTCTACGAAAAGCTGGCAGCTTCAATCGCCCCAGAAATATACGGGCATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAGATGTGAAGAAGGCACTGCTGCTCCTGCTAGTCGGGGGTGTGGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101389 AAGATGTGAAGAAGGCACTGCTGCTCCTGCTAGTCGGGGGTGTGGACCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCTCCTCGAGGCATGAAAATCCGGG         GCAACATCAACATCTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 101439 TCTCCTCGAGGCATGAAAATCCGGGGTA...CAGGCAACATCAACATCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCTGATGGGGGATCCTGGTGTGGCCAAGTCTCAGCTCCTGTCATACATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101709 TCTGATGGGGGATCCTGGTGTGGCCAAGTCTCAGCTCCTGTCATACATTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ATCGACTGGCGCCTCGCA         GCCAGTACACAACAGGCCGGGGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101759 ATCGACTGGCGCCTCGCAGTA...CAGGCCAGTACACAACAGGCCGGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TCCTCAGGAGTGGGGCTTACGGCAGCTGTGCTGAGAGACTCCGTGAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102933 TCCTCAGGAGTGGGGCTTACGGCAGCTGTGCTGAGAGACTCCGTGAGTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AGAACTGACCTTAGAGGGTGGGGCCCTGGTGCTGGCTGACCAGGGTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102983 AGAACTGACCTTAGAGGGTGGGGCCCTGGTGCTGGCTGACCAGGGTGTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GCTGCATTGATGAGTTCGACAAGATGGCTGAGGCCGACCGCACAGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103033 GCTGCATTGATGAGTTCGACAAGATGGCTGAGGCCGACCGCACAGCCATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CACGAGGTCATGGAGCAGCAGACCATCTCCATTGCCAAGGCCGGCATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103083 CACGAGGTCATGGAGCAGCAGACCATCTCCATTGCCAAGGCCGGCATTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CACCACACTCAATGCCCGCTGCTCCATCCTGGCTGCCGCCAACCCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103133 CACCACACTCAATGCCCGCTGCTCCATCCTGGCTGCCGCCAACCCTGCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ACGGGCGCTACAACCCTCGCCGCAGCCTGGAGCAGAACATACAGCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103183 ACGGGCGCTACAACCCTCGCCGCAGCCTGGAGCAGAACATACAGCTACCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GCTGCACTGCTCTCCCGGTTTGACCTCCTCTGGCTGATTCAGGACCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103233 GCTGCACTGCTCTCCCGGTTTGACCTCCTCTGGCTGATTCAGGACCGGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CGACCGAGACAATGACCTACG         GTTGGCCCAGCACATTACCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| ||||
 103283 CGACCGAGACAATGACCTACGGTG...CAGGTTGGCCCAGCACATCACCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATGTGCACCAGCACAGCCGGCAGCCCCCCTCCCAGTTTGAACCTCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103627 ATGTGCACCAGCACAGCCGGCAGCCCCCCTCCCAGTTTGAACCTCTGGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ATGAAGCTCATGAG         GCGTTACATAGCCATGTGCCGCGAGAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 103677 ATGAAGCTCATGAGGTA...CAGGCGTTACATAGCCATGTGCCGCGAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GCAGCCCATGGTGCCAGAGTCTCTGGCTGACTACATCACAGCAGCATACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104763 GCAGCCCATGGTGCCAGAGTCTCTGGCTGACTACATCACAGCAGCATACG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TGGAGATGAGGCGAGAGGCTTGGGCTAGTAAGGATGCCACCTATACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104813 TGGAGATGAGGCGAGAGGCTTGGGCTAGTAAGGATGCCACCTATACTTCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GCCCGGACCCTGCTGGCTATCCTGCGCCTTTCCACTGCTCTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 104863 GCCCGGACCCTGCTGGCTATCCTGCGCCTTTCCACTGCTCTGGTA...TA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1321  GCACGTCTGAGAATGGTGGATGTGGTGGAGAAAGAAGATGTGAATGAAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105675 GGCACGTCTGAGAATGGTGGATGTGGTGGAGAAAGAAGATGTGAATGAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CCATCAGGCTAATGGAGATGTCAAAGGACTCTCTTCTAGGAGACAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105725 CCATCAGGCTAATGGAGATGTCAAAGGACTCTCTTCTAGGAGACAAGGGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CAGACAGCTAG         GACTCAGAGACCAGCAGATGTGATATTTGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105775 CAGACAGCTAGGTG...CAGGACTCAGAGACCAGCAGATGTGATATTTGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CACCGTCCGTGAACTGGTCTCAGGGGGCCGAAGTGTCCGGTTCTCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105974 CACCGTCCGTGAACTGGTCTCAGGGGGCCGAAGTGTCCGGTTCTCTGAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CAGAGCAGCGCTGTGTATCTCGTGGCTTCACACCCGCCCAGTTCCAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106024 CAGAGCAGCGCTGTGTATCTCGTGGCTTCACACCCGCCCAGTTCCAGGCG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GCTCTGGATGAATATGAGGAGCTCAATGTCTGGCAGGTCAATGCTTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106074 GCTCTGGATGAATATGAGGAGCTCAATGTCTGGCAGGTCAATGCTTCCCG

   1700     .    :    .
   1611 GACACGGATCACTTTTGTC
        |||||||||||||||||||
 106124 GACACGGATCACTTTTGTC