seq1 = pF1KB5383.tfa, 1617 bp
seq2 = pF1KB5383/gi568815596r_61769436.tfa (gi568815596r:61769436_61988507), 219072 bp

>pF1KB5383 1617
>gi568815596r:61769436_61988507 (Chr2)

(complement)

1-127  (100001-100127)   100% ->
128-180  (103436-103488)   100% ->
181-270  (104960-105049)   100% ->
271-379  (108114-108222)   100% ->
380-522  (109497-109639)   100% ->
523-644  (110994-111115)   100% ->
645-777  (111456-111588)   100% ->
778-917  (112274-112413)   100% ->
918-1014  (115215-115311)   98% ->
1015-1125  (115396-115506)   100% ->
1126-1256  (115920-116050)   100% ->
1257-1491  (116192-116426)   100% ->
1492-1609  (118955-119072)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGAGAATGTGGCACCCCGGAGCGGGGCGACTGCCGGGGCTGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCGAGAATGTGGCACCCCGGAGCGGGGCGACTGCCGGGGCTGCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCCGCGGGAAAGGCGCCTATCAGGACCGCGACAAGCCAGCCCAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGCCGCGGGAAAGGCGCCTATCAGGACCGCGACAAGCCAGCCCAGATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTCAGCAACATTTCCGCCGCCAAAG         CGGTTGCTGATGCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100101 GCTTCAGCAACATTTCCGCCGCCAAAGGTA...CAGCGGTTGCTGATGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTAGAACAAGCCTTGGACCAAAAGGAATGGATAAAATG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 103450 ATTAGAACAAGCCTTGGACCAAAAGGAATGGATAAAATGGTA...TAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCAAGATGGAAAAGGTGATGTAACCATTACAAATGATGGTGCTACCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104962 TCAAGATGGAAAAGGTGATGTAACCATTACAAATGATGGTGCTACCATTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGAAACAAATGCAAGTATTACATCCAGCAGCCAGAATG         CTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 105012 TGAAACAAATGCAAGTATTACATCCAGCAGCCAGAATGGTA...TAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTGGAGCTGTCTAAGGCTCAAGATATAGAAGCAGGAGATGGCACCACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108117 GTGGAGCTGTCTAAGGCTCAAGATATAGAAGCAGGAGATGGCACCACATC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGTAGTCATCATTGCTGGCTCCCTCTTAGATTCTTGTACCAAGCTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108167 AGTAGTCATCATTGCTGGCTCCCTCTTAGATTCTTGTACCAAGCTTCTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGAAAG         GGATTCATCCAACCATCATTTCTGAGTCATTCCAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108217 AGAAAGGTG...CAGGGATTCATCCAACCATCATTTCTGAGTCATTCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAGGCCCTGGAAAAGGGCATTGAAATCTTGACTGACATGTCTCGACCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109532 AAGGCCCTGGAAAAGGGCATTGAAATCTTGACTGACATGTCTCGACCTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGAACTGAGTGACAGAGAAACTTTGTTAAATAGTGCAACCACTTCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109582 GGAACTGAGTGACAGAGAAACTTTGTTAAATAGTGCAACCACTTCACTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACTCAAAG         GTGGTTTCTCAGTATTCAAGTCTGCTTTCTCCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 109632 ACTCAAAGGTG...TAGGTGGTTTCTCAGTATTCAAGTCTGCTTTCTCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATGAGTGTAAATGCAGTGATGAAAGTGATTGACCCAGCCACAGCCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111027 ATGAGTGTAAATGCAGTGATGAAAGTGATTGACCCAGCCACAGCCACCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGTAGATCTTAGAGATATTAAAATAGTTAAGAAGCTTGG         TG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 111077 TGTAGATCTTAGAGATATTAAAATAGTTAAGAAGCTTGGGTA...TAGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GGACAATTGATGACTGTGAGTTGGTGGAAGGGCTGGTTCTCACCCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111458 GGACAATTGATGACTGTGAGTTGGTGGAAGGGCTGGTTCTCACCCAAAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GTGTCAAATTCTGGCATAACCAGAGTTGAAAAGGCCAAGATTGGGCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111508 GTGTCAAATTCTGGCATAACCAGAGTTGAAAAGGCCAAGATTGGGCTTAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TCAGTTTTGCTTATCTGCTCCCAAAACAGAC         ATGGATAATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 111558 TCAGTTTTGCTTATCTGCTCCCAAAACAGACGTA...CAGATGGATAATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AAATAGTGGTTTCTGACTATGCCCAGATGGACCGAGTGCTGCGAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112284 AAATAGTGGTTTCTGACTATGCCCAGATGGACCGAGTGCTGCGAGAAGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AGAGCCTATATTTTAAATTTAGTGAAGCAAATTAAAAAAACAGGATGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112334 AGAGCCTATATTTTAAATTTAGTGAAGCAAATTAAAAAAACAGGATGTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGTCCTTCTCATACAGAAATCTATTCTAAG         AGATGCTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 112384 TGTCCTTCTCATACAGAAATCTATTCTAAGGTG...TAGAGATGCTCTTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GTGATCTTGCATTACACTTTCTGAATAAAATGAAGATAATGGTGATTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 115226 GTGATCTTGCATTACACTTTCTGAATAAAATGAAGATCATGGTGATTAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GATATTGAAAGAGAAGACATTGAATTCATTTGTAAG         ACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 115276 GATATTGAAAGAGAAGACATTGAATTCATTTGTAAGGTA...CAGACAAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TGGAACCAAGCCAGTTGCTCATATTGACCAATTTACTGCTGACATGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115401 TGGAACCAAGCCAGTTGCTCATATTGACCAATTTACTGCTGACATGCTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GTTCTGCTGAGTTAGCTGAGGAGGTCAATTTAAATGGTTCTGGCAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115451 GTTCTGCTGAGTTAGCTGAGGAGGTCAATTTAAATGGTTCTGGCAAACTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CTCAAG         ATTACAGGCTGTGCCAGCCCTGGAAAAACAGTTAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115501 CTCAAGGTA...AAGATTACAGGCTGTGCCAGCCCTGGAAAAACAGTTAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 AATTGTTGTTCGTGGTTCTAACAAACTGGTGATTGAAGAAGCTGAGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115955 AATTGTTGTTCGTGGTTCTAACAAACTGGTGATTGAAGAAGCTGAGCGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CCATTCATGATGCCCTATGTGTTATTCGTTGTTTAGTGAAGAAGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 116005 CCATTCATGATGCCCTATGTGTTATTCGTTGTTTAGTGAAGAAGAGGTA.

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1257      GGCTCTTATTGCAGGAGGTGGTGCTCCAGAAATAGAGTTGGCCCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116055 ..CAGGGCTCTTATTGCAGGAGGTGGTGCTCCAGAAATAGAGTTGGCCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 ACGATTAACTGAATATTCACGAACACTGAGTGGTATGGAATCCTACTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116237 ACGATTAACTGAATATTCACGAACACTGAGTGGTATGGAATCCTACTGCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 TTCGTGCTTTTGCAGATGCTATGGAGGTCATTCCATCTACACTAGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116287 TTCGTGCTTTTGCAGATGCTATGGAGGTCATTCCATCTACACTAGCTGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 AATGCCGGCCTGAATCCCATTTCTACAGTAACAGAACTAAGAAACCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116337 AATGCCGGCCTGAATCCCATTTCTACAGTAACAGAACTAAGAAACCGGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TGCCCAGGGAGAAAAAACTGCAGGCATTAATGTCCGAAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 116387 TGCCCAGGGAGAAAAAACTGCAGGCATTAATGTCCGAAAGGTA...CAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 GTGGTATTTCCAACATTTTGGAGGAACTGGTTGTCCAGCCTCTGTTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118956 GTGGTATTTCCAACATTTTGGAGGAACTGGTTGTCCAGCCTCTGTTGGTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 TCAGTCAGTGCTCTGACTCTTGCAACTGAAACTGTTCGGAGCATTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119006 TCAGTCAGTGCTCTGACTCTTGCAACTGAAACTGTTCGGAGCATTCTGAA

   1700     .    :    .
   1593 AATAGATGATGTGGTAA
        |||||||||||||||||
 119056 AATAGATGATGTGGTAA