seq1 = pF1KB5366.tfa, 633 bp
seq2 = pF1KB5366/gi568815581r_17283380.tfa (gi568815581r:17283380_17484008), 200629 bp

>pF1KB5366 633
>gi568815581r:17283380_17484008 (Chr17)

(complement)

1-633  (99997-100629)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCCCAGCCGGAATGGCATGGTCTTGAAGCCCCACTTCCACAAGGA
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99997 ATGACGCCCAGCCGGAATGGCATGGTCTTGAAGCCCCACTTCCACAAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGCAGCGGCGCGTGGCCACGTGGTTCAACCAGCCGGCCCGTAAGATCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 100047 CTGGCAGCGGCGCGTGGCCACGTGGTTCAACCAGCCGGCCCGGAAGATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGACGTAAGGCCCGGCAAGCCAAGGCGCGCCGCATCGCCCCGCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100097 GCAGACGTAAGGCCCGGCAAGCCAAGGCGCGCCGCATCGCCCCGCGCCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGTCGGGTCCCATCCGGCCCATCGTGCGCTGCCCCACGGTTCGGTACCA
        |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 100147 GCGTCGGGGCCCATCCGGCCCATCGTGTGCTGCCCCACGGTTCGGTACCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACGAAGGTGCGCGCCGGCCGCGGCTTCAGCCTGGAGGAGCTCAGGGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||
 100197 CACGAAGGTGCGCGCCGGCCGCGGCTTCAATCTGGAGGAGCTCAGGGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGGCATTCACAAGAAGGTGGCCCGGACCATCGGCATTTCTGTGGATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100247 CCGGCATTCACAAGAAGGTGGCCCGGACCATCGGCATTTCTGTGGATCCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGGAGGCGGAACAAGTCCACGGAGTCCCTGCAGGCCAACGTGCAGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100297 AGGAGGCGGAACAAGTCCACGGAGTCCCTGCAGGCGAACGTGCAGCGGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAAGGAGTACCGCTCCAAACTCATCCTCTTCCCCAGGAAGCCCTCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100347 GAAGGAGTACCGCTCCAAACTCATCCTCTTCCCCAGGAAGCCCTCGGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCAAGAAGGGAGACAGTTCTGCTGAAGAACTGAAACTGGCCACCCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100397 CCAAGAAGGGAGACAGTTCTGCTGAAGAACTGAAACTGGCCACCCAGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACCGGACCGGTCATGCCCGTCCGGAACGTCTATAAGAAGGAGAAAGCTCG
        |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||
 100447 ACCGGACCGGTCATGCCCATCCGGAATGTCTATAAGAAGGAGAAAGCTCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTCCGTA
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100497 AGTGATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTCCGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGGCCCGTGCCAACGCCCGGCTCTTCGGCATACGGGCAAAAAGAGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100547 TGGCCCGTGCCAACGCCCGGCTCTTCGGCATACGGGCAAAAAGAGCCAAG

    600     .    :    .    :    .    :
    601 GAAGCCGCAGAACAGGATGTTGAAAAGAAAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100597 GAAGCCGCAGAACAGGATGTTGAAAAGAAAAAA