seq1 = pF1KB5364.tfa, 1185 bp
seq2 = pF1KB5364/gi568815590r_17957537.tfa (gi568815590r:17957537_18184058), 226522 bp

>pF1KB5364 1185
>gi568815590r:17957537_18184058 (Chr8)

(complement)

1-78  (100001-100078)   100% ->
79-125  (108472-108518)   100% ->
126-216  (112669-112759)   98% ->
217-303  (114181-114267)   98% ->
304-382  (116761-116839)   100% ->
383-457  (119528-119602)   100% ->
458-503  (120829-120874)   100% ->
504-648  (121636-121780)   100% ->
649-703  (122319-122373)   100% ->
704-785  (122601-122682)   98% ->
786-917  (124356-124487)   100% ->
918-1041  (124595-124718)   100% ->
1042-1098  (125168-125224)   100% ->
1099-1185  (126436-126522)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGGGCCGGAGTTGCGTCGCCTTAGTCCTCCTGGCTGCCGCCGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGGGCCGGAGTTGCGTCGCCTTAGTCCTCCTGGCTGCCGCCGTCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGTGCCGTCGCGCAGCACGCGCCGCCG         TGGACAGAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100051 CTGTGCCGTCGCGCAGCACGCGCCGCCGGTG...CAGTGGACAGAGGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCAGAAAATCAACCTATCCTCCTTCAGGACCAAC         GTACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 108485 GCAGAAAATCAACCTATCCTCCTTCAGGACCAACGTG...CAGGTACAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GGTGCAGTTCCATGGTACACCATAAATCTTGACTTACCACCCTACAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112676 GGTGCAGTTCCATGGTACACCATAAATCTTGACTTACCACCCTACAAAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ATGGCATGAATTGATGCTTGACAAGGCACCAATG         CTAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||>>>...>>>|||||||
 112726 ATGGCATGAATTGATGCTTGACAAGGCACCAGTGGTA...CAGCTAAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TTATAGTGAATTCTCTGAAGAATATGATAAATACATTCGTGCCAAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114188 TTATAGTGAATTCTCTGAAGAATATGATAAATACATTCGTGCCAAGTGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAAGTTATGCAGGTGGTGGATGAAAAATTG         CCTGGCCTACT
        ||| ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 114238 AAAATTATGCAGGTGGTGGATGAAAAATTGGTA...CAGCCTGGCCTACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TGGCAACTTTCCTGGCCCTTTTGAAGAGGAAATGAAGGGTATTGCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116772 TGGCAACTTTCCTGGCCCTTTTGAAGAGGAAATGAAGGGTATTGCCGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TTACTGATATACCTTTAG         GAGAGATTATTTCATTCAATATT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 116822 TTACTGATATACCTTTAGGTA...TAGGAGAGATTATTTCATTCAATATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TTTTATGAATTATTTACCATTTGTACTTCAATAGTAGCAGAAGACAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119551 TTTTATGAATTATTTACCATTTGTACTTCAATAGTAGCAGAAGACAAAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AG         GTCATCTAATACATGGGAGAAACATGGATTTTGGAGTAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119601 AGGTA...TAGGTCATCTAATACATGGGAGAAACATGGATTTTGGAGTAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TTCTTGG         GTGGAACATAAATAATGATACCTGGGTCATAACT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120868 TTCTTGGGTA...TAGGTGGAACATAAATAATGATACCTGGGTCATAACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 GAGCAACTAAAACCTTTAACAGTGAATTTGGATTTCCAAAGAAACAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121670 GAGCAACTAAAACCTTTAACAGTGAATTTGGATTTCCAAAGAAACAACAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 AACTGTCTTCAAGGCTTCAAGCTTTGCTGGCTATGTGGGCATGTTAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121720 AACTGTCTTCAAGGCTTCAAGCTTTGCTGGCTATGTGGGCATGTTAACAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 GATTCAAACCA         GGACTGTTCAGTCTTACACTGAATGAACGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 121770 GATTCAAACCAGTA...CAGGGACTGTTCAGTCTTACACTGAATGAACGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 TTCAGTATAAATGGTGGTTATCTGG         GTATTCTAGAATGGAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 122349 TTCAGTATAAATGGTGGTTATCTGGGTA...CAGGTATTCTAGAATGGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 TCTGGGAAAGAAAGATGCCATGTGGATAGGGTTCCTCACTAGAACAGTTC
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 122617 TCTGGGAAAGAAAGATGTCATGTGGATAGGGTTCCTCACTAGAACAGTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 TGGAAAATAGCACAAG         TTATGAAGAAGCCAAGAATTTATTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 122667 TGGAAAATAGCACAAGGTA...TAGTTATGAAGAAGCCAAGAATTTATTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    811 ACCAAGACCAAGATATTGGCCCCAGCCTACTTTATCCTGGGAGGCAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124381 ACCAAGACCAAGATATTGGCCCCAGCCTACTTTATCCTGGGAGGCAACCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 GTCTGGGGAAGGTTGTGTGATTACACGAGACAGAAAGGAATCATTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124431 GTCTGGGGAAGGTTGTGTGATTACACGAGACAGAAAGGAATCATTGGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 TATATGA         ACTCGATGCTAAGCAGGGTAGATGGTATGTGGTA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124481 TATATGAGTA...TAGACTCGATGCTAAGCAGGGTAGATGGTATGTGGTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 CAAACAAATTATGACCGTTGGAAACATCCCTTCTTCCTTGATGATCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124629 CAAACAAATTATGACCGTTGGAAACATCCCTTCTTCCTTGATGATCGCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 AACGCCTGCAAAGATGTGTCTGAACCGCACCAGCCAAGAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 124679 AACGCCTGCAAAGATGTGTCTGAACCGCACCAGCCAAGAGGTA...TAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1043 ATATCTCATTTGAAACCATGTATGATGTCCTGTCAACAAAACCTGTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125169 ATATCTCATTTGAAACCATGTATGATGTCCTGTCAACAAAACCTGTCCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 AACAAG         CTGACCGTATACACAACCTTGATAGATGTTACCAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125219 AACAAGGTA...CAGCTGACCGTATACACAACCTTGATAGATGTTACCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1134 AGGTCAATTCGAAACTTACCTGCGGGACTGCCCTGACCCTTGTATAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126471 AGGTCAATTCGAAACTTACCTGCGGGACTGCCCTGACCCTTGTATAGGTT

   1300 
   1184 GG
        ||
 126521 GG