seq1 = pF1KB5352.tfa, 1335 bp
seq2 = pF1KB5352/gi568815590r_108101888.tfa (gi568815590r:108101888_108348702), 246815 bp

>pF1KB5352 1335
>gi568815590r:108101888_108348702 (Chr8)

(complement)

1-90  (100001-100090)   100% ->
91-205  (106790-106904)   100% ->
206-323  (108628-108745)   100% ->
324-366  (112500-112542)   100% ->
367-471  (113601-113705)   100% ->
472-597  (119508-119633)   100% ->
598-722  (120312-120436)   100% ->
723-849  (131243-131369)   100% ->
850-951  (132190-132291)   100% ->
952-1061  (133987-134096)   100% ->
1062-1164  (145200-145302)   100% ->
1165-1299  (145586-145720)   100% ->
1300-1335  (146780-146815)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGTACGACTTGACTACTCGCATCGCGCACTTTTTGGATCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAGTACGACTTGACTACTCGCATCGCGCACTTTTTGGATCGGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTAGTCTTTCCGCTTCTTGAATTTCTCTCTGTAAAGGAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100051 TCTAGTCTTTCCGCTTCTTGAATTTCTCTCTGTAAAGGAGGTG...CAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TATATAATGAAAAGGAATTATTACAAGGTAAATTGGACCTTCTTAGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106791 TATATAATGAAAAGGAATTATTACAAGGTAAATTGGACCTTCTTAGTGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCAACATGGTAGACTTTGCTATGGATGTATACAAAAACCTTTATTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106841 ACCAACATGGTAGACTTTGCTATGGATGTATACAAAAACCTTTATTCTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGATATTCCTCATG         CTTTGAGAGAGAAAAGAACCACAGTGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 106891 TGATATTCCTCATGGTA...TAGCTTTGAGAGAGAAAAGAACCACAGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGCACAACTGAAACAGCTTCAGGCAGAAACAGAACCAATTGTGAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108655 TTGCACAACTGAAACAGCTTCAGGCAGAAACAGAACCAATTGTGAAGATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTTGAAGATCCAGAAACTACAAGGCAAATGCAGTCAACCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 108705 TTTGAAGATCCAGAAACTACAAGGCAAATGCAGTCAACCAGGTA...TAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGATGGTAGGATGCTCTTTGACTACCTGGCGGACAAGCATGGT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 112500 GGATGGTAGGATGCTCTTTGACTACCTGGCGGACAAGCATGGTGTA...T

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    367   TTTAGGCAGGAATATTTAGATACACTCTACAGATATGCAAAATTCCAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113599 AGTTTAGGCAGGAATATTTAGATACACTCTACAGATATGCAAAATTCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TACGAATGTGGGAATTACTCAGGAGCAGCAGAATATCTTTATTTTTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113649 TACGAATGTGGGAATTACTCAGGAGCAGCAGAATATCTTTATTTTTTTAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGTGCTG         GTTCCAGCAACAGATAGAAATGCTTTAAGTTCAC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113699 AGTGCTGGTA...CAGGTTCCAGCAACAGATAGAAATGCTTTAAGTTCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TCTGGGGAAAGCTGGCCTCTGAAATCTTAATGCAGAATTGGGATGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119542 TCTGGGGAAAGCTGGCCTCTGAAATCTTAATGCAGAATTGGGATGCAGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATGGAAGACCTTACACGGTTAAAAGAGACCATAGATAATAAT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 119592 ATGGAAGACCTTACACGGTTAAAAGAGACCATAGATAATAATGTG...TA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    598  TCTGTGAGTTCTCCACTTCAGTCTCTTCAGCAGAGAACATGGCTCATTC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120311 GTCTGTGAGTTCTCCACTTCAGTCTCTTCAGCAGAGAACATGGCTCATTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ACTGGTCTCTGTTTGTTTTCTTCAATCACCCCAAAGGTCGCGATAATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120361 ACTGGTCTCTGTTTGTTTTCTTCAATCACCCCAAAGGTCGCGATAATATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATTGACCTCTTCCTTTATCAGCCACA         ATATCTTAATGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 120411 ATTGACCTCTTCCTTTATCAGCCACAGTA...TAGATATCTTAATGCAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TCAGACAATGTGTCCACACATTCTTCGCTATTTGACTACAGCAGTCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131258 TCAGACAATGTGTCCACACATTCTTCGCTATTTGACTACAGCAGTCATAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CAAACAAGGATGTTCGAAAACGTCGGCAGGTTCTAAAAGATCTAGTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131308 CAAACAAGGATGTTCGAAAACGTCGGCAGGTTCTAAAAGATCTAGTTAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GTTATTCAACAG         GAGTCTTACACATATAAAGACCCAATTAC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 131358 GTTATTCAACAGGTA...CAGGAGTCTTACACATATAAAGACCCAATTAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AGAATTTGTTGAATGTTTATATGTTAACTTTGACTTTGATGGGGCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132219 AGAATTTGTTGAATGTTTATATGTTAACTTTGACTTTGATGGGGCTCAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AAAAGCTGAGGGAATGTGAATCA         GTGCTTGTGAATGACTTC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 132269 AAAAGCTGAGGGAATGTGAATCAGTA...TAGGTGCTTGTGAATGACTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TTCTTGGTGGCTTGTCTTGAGGATTTCATTGAAAATGCCCGTCTCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134005 TTCTTGGTGGCTTGTCTTGAGGATTTCATTGAAAATGCCCGTCTCTTCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 ATTTGAGACTTTCTGTCGCATCCACCAGTGTATCAGCATTAA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 134055 ATTTGAGACTTTCTGTCGCATCCACCAGTGTATCAGCATTAAGTA...TA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1062  CATGTTGGCAGATAAATTGAACATGACTCCAGAAGAAGCTGAAAGGTGG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145199 GCATGTTGGCAGATAAATTGAACATGACTCCAGAAGAAGCTGAAAGGTGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 ATTGTAAATTTGATTAGAAATGCAAGACTGGATGCCAAGATTGATTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145249 ATTGTAAATTTGATTAGAAATGCAAGACTGGATGCCAAGATTGATTCTAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 ATTA         GGTCATGTGGTTATGGGTAACAATGCAGTCTCACCCT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145299 ATTAGTG...TAGGGTCATGTGGTTATGGGTAACAATGCAGTCTCACCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 ATCAGCAAGTGATTGAAAAGACCAAAAGCCTTTCCTTTAGAAGCCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145623 ATCAGCAAGTGATTGAAAAGACCAAAAGCCTTTCCTTTAGAAGCCAGATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 TTGGCCATGAATATTGAGAAGAAACTTAATCAGAATAGCAGGTCAGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 145673 TTGGCCATGAATATTGAGAAGAAACTTAATCAGAATAGCAGGTCAGAGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :
   1300        GCTCCTAACTGGGCAACTCAAGATTCTGGCTTCTAC
        >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145723 A...TAGGCTCCTAACTGGGCAACTCAAGATTCTGGCTTCTAC