seq1 = pF1KB5334.tfa, 1566 bp
seq2 = pF1KB5334/gi568815576f_32375003.tfa (gi568815576f:32375003_32598527), 223525 bp

>pF1KB5334 1566
>gi568815576f:32375003_32598527 (Chr22)

1-122  (100001-100122)   100% ->
123-417  (103979-104273)   99% ->
418-645  (108895-109122)   99% ->
646-787  (110066-110207)   100% ->
788-871  (112743-112826)   100% ->
872-967  (116084-116179)   98% ->
968-1144  (118103-118279)   100% ->
1145-1182  (120491-120528)   100% ->
1183-1566  (123142-123525)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGCTGCGGGTGCGGCTTCTGAAGCGGACCTGGCCGCTGGAGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGCTGCGGGTGCGGCTTCTGAAGCGGACCTGGCCGCTGGAGGTGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGACGGAGCCGACGCTGGGGCATTTGCGCTCGCACCTGAGGCAGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGACGGAGCCGACGCTGGGGCATTTGCGCTCGCACCTGAGGCAGTCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTGTGCACCTGGGGGTACAG         TTCTAATACCCGATTTACA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100101 TGCTGTGCACCTGGGGGTACAGGTA...CAGTTCTAATACCCGATTTACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTACATTGAACTACAAGGATCCCCTCACTGGAGATGAAGAGACCTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103998 ATTACATTGAACTACAAGGATCCCCTCACTGGAGATGAAGAGACCTTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTCATATGGGATTGTTTCTGGGGACTTGATATGTTTGATTCTTCAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104048 TTCATATGGGATTGTTTCTGGGGACTTGATATGTTTGATTCTTCAAGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACATTCCAGCGCCTAATATACCTTCATCCACAGATTCAGAGCATTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104098 ACATTCCAGCGCCTAATATACCTTCATCCACAGATTCAGAGCATTCTTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCCAGAATAATGAGCAACCCTCTTTGGCCACCAGCTCCAATCAGACTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104148 CTCCAGAATAATGAGCAACCCTCTTTGGCCACCAGCTCCAATCAGACTAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATACAGGATGAACAACCAAGTGATTCATTCCAAGGACAGGCAGCCCAGT
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104198 CATGCAGGATGAACAACCAAGTGATTCATTCCAAGGACAGGCAGCCCAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTGGTGTTTGGAATGACGACAGTATG         TTAGGGCCTAGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 104248 CTGGTGTTTGGAATGACGACAGTATGGTG...CAGTTAGGGCCTAGTCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AATTTTGAAGCTGAGTCAATTCAAGATAATGCGCATATGGCAGAGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108910 AATTTTGAAGCTGAGTCAATTCAAGATAATGCGCATATGGCAGAGGGCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGGTTTCTATCCCTCAGAACCCATGCTCTGTAGTGAATCGGTGGAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108960 AGGTTTCTATCCCTCAGAACCCATGCTCTGTAGTGAATCGGTGGAAGGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AAGTGCCGCATTCATTAGAGACCTTGTATCAATCAGCTGACTGTTCTGAT
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109010 AAGTGCCACATTCATTAGAGACCTTGTATCAATCAGCTGACTGTTCTGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GCCAATGATGCCTTGATAGTGTTGATACATCTTCTCATGTTGGAGTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109060 GCCAATGATGCCTTGATAGTGTTGATACATCTTCTCATGTTGGAGTCAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TTACATACCTCAG         GGCACCGAAGCCAAAGCACTGTCCATGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 109110 TTACATACCTCAGGTA...CAGGGCACCGAAGCCAAAGCACTGTCCATGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CGGAGAAGTGGAAGTTGAGCGGGGTGTATAAGCTGCAGTACATGCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110094 CGGAGAAGTGGAAGTTGAGCGGGGTGTATAAGCTGCAGTACATGCATCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CTCTGCGAGGGCAGCTCCGCTACTCTCACCTGTGTGCCTTTGGGAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110144 CTCTGCGAGGGCAGCTCCGCTACTCTCACCTGTGTGCCTTTGGGAAACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GATTGTTGTAAATG         CTACACTAAAAATCAACAATGAGATTA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 110194 GATTGTTGTAAATGGTA...CAGCTACACTAAAAATCAACAATGAGATTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GAAGTGTGAAAAGATTGCAGCTGCTACCAGAATCTTTTATTTGCAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112770 GAAGTGTGAAAAGATTGCAGCTGCTACCAGAATCTTTTATTTGCAAAGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AAACTAG         GGGAAAATGTAGCCAACATATACAAAGATCTTCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112820 AAACTAGGTA...TAGGGGAAAATGTAGCCAACATATACAAAGATCTTCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GAAACTCTCTCGCCTCTTTAAAGACCAGCTGGTGTATCCTCTTTTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 116118 GAAACTCTCTCGCCTCTTTAAAGACCAGCTGGTGTATCCTCTTCTGGCTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TTACCCGACAAG         CACTGAACCTACCAGATGTATTTGGGTTG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 116168 TTACCCGACAAGGTA...TAGCACTGAACCTACCAGATGTATTTGGGTTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GTCGTCCTCCCATTGGAACTGAAACTACGGATCTTCCGACTTCTGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118132 GTCGTCCTCCCATTGGAACTGAAACTACGGATCTTCCGACTTCTGGATGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TCGTTCCGTCTTGTCTTTGTCTGCGGTTTGTCGTGACCTCTTTACTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118182 TCGTTCCGTCTTGTCTTTGTCTGCGGTTTGTCGTGACCTCTTTACTGCTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CAAATGACCCACTCCTGTGGAGGTTTTTATATCTGCGTGATTTTCGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 118232 CAAATGACCCACTCCTGTGGAGGTTTTTATATCTGCGTGATTTTCGAGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1145        ACAATACTGTCAGAGTTCAAGACACAGATTGGAAAGAA     
        >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 118282 G...TAGACAATACTGTCAGAGTTCAAGACACAGATTGGAAAGAAGTA..

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183     CTGTACAGGAAGAGGCACATACAAAGAAAAGAATCCCCGAAAGGGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120534 .CAGCTGTACAGGAAGAGGCACATACAAAGAAAAGAATCCCCGAAAGGGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GGTTTGTGATGCTCCTGCCATCGTCAACTCACACCATTCCATTCTATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123188 GGTTTGTGATGCTCCTGCCATCGTCAACTCACACCATTCCATTCTATCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 AACCCCTTGCACCCTAGGCCATTTCCTAGCTCCCGCCTTCCTCCAGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123238 AACCCCTTGCACCCTAGGCCATTTCCTAGCTCCCGCCTTCCTCCAGGAAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TATCGGGGGTGAATATGACCAAAGACCAACACTTCCCTATGTTGGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123288 TATCGGGGGTGAATATGACCAAAGACCAACACTTCCCTATGTTGGAGACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CAATCAGTTCACTCATTCCTGGTCCTGGGGAGACGCCCAGCCAGTTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123338 CAATCAGTTCACTCATTCCTGGTCCTGGGGAGACGCCCAGCCAGTTTCCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CCACTGAGACCACGCTTTGATCCAGTTGGCCCACTTCCAGGACCTAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123388 CCACTGAGACCACGCTTTGATCCAGTTGGCCCACTTCCAGGACCTAACCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 CATCTTGCCAGGGCGAGGCGGCCCCAATGACAGATTTCCCTTTAGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123438 CATCTTGCCAGGGCGAGGCGGCCCCAATGACAGATTTCCCTTTAGACCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .
   1529 GCAGGGGTCGGCCAACTGATGGCCGGCTGTCATTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123488 GCAGGGGTCGGCCAACTGATGGCCGGCTGTCATTCATG