seq1 = pF1KB5329.tfa, 498 bp
seq2 = pF1KB5329/gi568815592r_36755816.tfa (gi568815592r:36755816_36974772), 218957 bp

>pF1KB5329 498
>gi568815592r:36755816_36974772 (Chr6)

(complement)

1-56  (100001-100056)   100% ->
57-211  (102901-103055)   100% ->
212-280  (118119-118187)   100% ->
281-498  (118740-118957)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCAATTCCCCCAGATTCCTGGCAGCCACCCAACGTTTACTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCAATTCCCCCAGATTCCTGGCAGCCACCCAACGTTTACTTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCAG         CATGGGAATCATTGTGCTGGAGCTGTACTGGAAGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACCAGGTG...CAGCATGGGAATCATTGTGCTGGAGCTGTACTGGAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGCTCCAAAGACCTGTAAGAACTTTGCTGAGTTGGCTCGTCGAGGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102936 ATGCTCCAAAGACCTGTAAGAACTTTGCTGAGTTGGCTCGTCGAGGTTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACAATGGCACAAAATTCCACAGAATTATCAAAGACTTCATGATCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102986 TACAATGGCACAAAATTCCACAGAATTATCAAAGACTTCATGATCCAAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGGTGACCCAACAGGGACAG         GTCGAGGTGGTGCATCTATCT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 103036 AGGTGACCCAACAGGGACAGGTA...CAGGTCGAGGTGGTGCATCTATCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGGCAAACAGTTTGAAGATGAACTTCATCCAGACTTGAAATTCACGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 118140 ATGGCAAACAGTTTGAAGATGAACTTCATCCAGACTTGAAATTCACGGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    281        GGGCTGGAATTCTCGCAATGGCCAATGCGGGGCCAGATACCAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118190 A...CAGGGGCTGGAATTCTCGCAATGGCCAATGCGGGGCCAGATACCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGGCAGCCAGTTCTTTGTGACCCTCGCCCCCACCCAGTGGCTTGACGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118783 TGGCAGCCAGTTCTTTGTGACCCTCGCCCCCACCCAGTGGCTTGACGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AACACACCATTTTTGGCCGAGTGTGTCAGGGCATAGGAATGGTGAATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118833 AACACACCATTTTTGGCCGAGTGTGTCAGGGCATAGGAATGGTGAATCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGGGAATGGTAGAAACAAACTCCCAGGACCGCCCTGTGGACGACGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118883 GTGGGAATGGTAGAAACAAACTCCCAGGACCGCCCTGTGGACGACGTGAA

    500     .    :    .    :    .
    474 GATCATTAAGGCATACCCTTCTGGG
        |||||||||||||||||||||||||
 118933 GATCATTAAGGCATACCCTTCTGGG