seq1 = pF1KB5326.tfa, 1350 bp
seq2 = pF1KB5326/gi568815595r_125347782.tfa (gi568815595r:125347782_125620172), 272391 bp

>pF1KB5326 1350
>gi568815595r:125347782_125620172 (Chr3)

(complement)

1-141  (100001-100141)   100% ->
142-263  (115429-115550)   100% ->
264-399  (121979-122114)   100% ->
400-549  (122190-122339)   100% ->
550-597  (122785-122832)   100% ->
598-653  (130710-130765)   100% ->
654-726  (139854-139926)   100% ->
727-788  (143417-143478)   100% ->
789-854  (150654-150719)   100% ->
855-944  (159313-159402)   100% ->
945-1044  (162808-162907)   100% ->
1045-1190  (166218-166363)   100% ->
1191-1305  (168754-168868)   100% ->
1306-1350  (172347-172391)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCAGGCACCTCCGGACCCCGAGCGGCAGCTCCAGCCGGCGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCAGGCACCTCCGGACCCCGAGCGGCAGCTCCAGCCGGCGCCCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGCCGCTGGGCTCCCCAGACGCTGGGCTGGGGGCTGCGGTCGGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGCCGCTGGGCTCCCCAGACGCTGGGCTGGGGGCTGCGGTCGGCAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGCGGAGGGGGCCGGAGAAGAGAGCTCTGGGGTCGACACG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100101 AAGCGGAGGGGGCCGGAGAAGAGAGCTCTGGGGTCGACACGGTG...CAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGACACACAATAATTTTTGGTTGAAGAAGATAGAAATCAGTGTTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115429 ATGACACACAATAATTTTTGGTTGAAGAAGATAGAAATCAGTGTTTCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGCAGAAAAACGAACTGGAAGAAATGCCATGAACATGCAAGAAACATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115479 AGCAGAAAAACGAACTGGAAGAAATGCCATGAACATGCAAGAAACATATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGCTTACCTCATTGAAACAAG         GTCAGTTGAACATACCGAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 115529 CTGCTTACCTCATTGAAACAAGGTG...CAGGTCAGTTGAACATACCGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGTCAGAGTGTCCTAACAGACTCACTATGGCGGCGATATAGTGAATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121998 GGTCAGAGTGTCCTAACAGACTCACTATGGCGGCGATATAGTGAATTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTTGTTGAGAAGCTACCTTTTAGTTTACTATCCACATATTGTTGTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122048 GTTGTTGAGAAGCTACCTTTTAGTTTACTATCCACATATTGTTGTGCCAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTCTGCCAGAAAAACGG         GCAGAATTTGTTTGGCATAAACTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 122098 CTCTGCCAGAAAAACGGGTA...TAGGCAGAATTTGTTTGGCATAAACTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCTGCTGACAACATGGATCCAGATTTTGTGGAGAGGCGACGGATTGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122214 TCTGCTGACAACATGGATCCAGATTTTGTGGAGAGGCGACGGATTGGTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGAAAACTTTCTCTTGAGGATTGCTTCACATCCCATCCTTTGTAGAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122264 AGAAAACTTTCTCTTGAGGATTGCTTCACATCCCATCCTTTGTAGAGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAATCTTCTATCTGTTTTTAACACAG         GAAGGTAACTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 122314 AAATCTTCTATCTGTTTTTAACACAGGTA...TAGGAAGGTAACTGGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAGACTGTGAATGAAACTGGGTTTCAGCTGAAG         GCAGACTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 122800 GAGACTGTGAATGAAACTGGGTTTCAGCTGAAGGTA...CAGGCAGACTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CAGGTTAAAAGCGCTTAATGCAACATTCAGAGTGAAAAACCCAGACAA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 130718 CAGGTTAAAAGCGCTTAATGCAACATTCAGAGTGAAAAACCCAGACAAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    654        GAGATTTACTGACCTTAAGCACTATAGTGATGAACTGCAGTCT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130768 A...CAGGAGATTTACTGACCTTAAGCACTATAGTGATGAACTGCAGTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GTCATCTCACATCTTCTTCGAGTCAGAGCT         AGAGTAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 139897 GTCATCTCACATCTTCTTCGAGTCAGAGCTGTA...CAGAGAGTAGCAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TCGACTCTATGGTGTATATAAAGTACATGGGAATTATGGTCGAGTTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143428 TCGACTCTATGGTGTATATAAAGTACATGGGAATTATGGTCGAGTTTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 G         TGAATGGAGTGCCATAGAAAAAGAAATGGGTGATGGACTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143478 GGTA...TAGTGAATGGAGTGCCATAGAAAAAGAAATGGGTGATGGACTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CAGAGTGCTGGTCATCATATGGATGT         GTATGCATCTTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 150694 CAGAGTGCTGGTCATCATATGGATGTGTA...CAGGTATGCATCTTCTAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 TGATGATATTTTGGAAGATGAAGAACATTATGCAGATCAGTTAAAAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159328 TGATGATATTTTGGAAGATGAAGAACATTATGCAGATCAGTTAAAAGAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 ATCTTTTTTATGCAGAAGCATTGCG         GGCTGTGTGCAGGAAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 159378 ATCTTTTTTATGCAGAAGCATTGCGGTA...TAGGGCTGTGTGCAGGAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 CATGAACTTATGCAGTATGACTTGGAGATGGCTGCTCAGGACTTAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162824 CATGAACTTATGCAGTATGACTTGGAGATGGCTGCTCAGGACTTAGCATC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 CAAGAAGCAGCAGTGTGAGGAACTGGTAACTGGG         ACTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 162874 CAAGAAGCAGCAGTGTGAGGAACTGGTAACTGGGGTG...TAGACTGTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 GAACATTCTCTTTGAAGGGAATGACTACCAAGCTCTTTGGTCAAGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166225 GAACATTCTCTTTGAAGGGAATGACTACCAAGCTCTTTGGTCAAGAAACT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 CCAGAGCAGAGAGAAGCCAGAATAAAGGTGCTAGAAGAACAAATAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166275 CCAGAGCAGAGAGAAGCCAGAATAAAGGTGCTAGAAGAACAAATAAATGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 AGGAGAACAACAGCTAAAGTCTAAAAATCTGGAAGGCAG         AG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 166325 AGGAGAACAACAGCTAAAGTCTAAAAATCTGGAAGGCAGGTA...CAGAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 AATTTGTGAAAAACGCATGGGCTGATATTGAACGCTTCAAAGAACAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168756 AATTTGTGAAAAACGCATGGGCTGATATTGAACGCTTCAAAGAACAAAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 AACCGAGACTTAAAGGAGGCCCTCATAAGCTATGCAGTCATGCAGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168806 AACCGAGACTTAAAGGAGGCCCTCATAAGCTATGCAGTCATGCAGATCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 TATGTGCAAAAAG         GGAATTCAAGTTTGGACCAATGCTAAGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 168856 TATGTGCAAAAAGGTA...TAGGGAATTCAAGTTTGGACCAATGCTAAGG

   1450     .    :    .
   1334 AATGCTTTAGCAAGATG
        |||||||||||||||||
 172375 AATGCTTTAGCAAGATG