seq1 = pF1KB5309.tfa, 1269 bp
seq2 = pF1KB5309/gi568815576r_30454956.tfa (gi568815576r:30454956_30657392), 202437 bp

>pF1KB5309 1269
>gi568815576r:30454956_30657392 (Chr22)

(complement)

1-131  (100001-100131)   99% ->
132-1269  (101300-102437)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGCCACCGCAGAAGAAGCCCTGGGAGTCCATGGCTAAGGGGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGCCACCGCAGAAGAAGCCCTGGGAGTCCATGGCTAAGGGGCTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGGCGCGCTCTTCACTAGTTTCCTGCTGCTGATGTACTCCTATGCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 100051 GCTGGGCGCGCTCTTCACTAGTTTCCTGCTGCTGGTGTACTCCTATGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCCCCGCTGCATGCCGGCCTGGCCTCCAC         GACCCCGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100101 TGCCCCCGCTGCATGCCGGCCTGGCCTCCACGTG...CAGGACCCCGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCGCAGCGTCCTGCTCTCCACCTGCACTCGAGCCAGAGGCAGTGATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101310 GCCGCAGCGTCCTGCTCTCCACCTGCACTCGAGCCAGAGGCAGTGATCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCCAACGGCTCGGCGGGGGAGTGCCAGCCGCGGCGCAACATCGTGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101360 GGCCAACGGCTCGGCGGGGGAGTGCCAGCCGCGGCGCAACATCGTGTTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGAAGACGCACAAGACGGCCAGCAGCACCCTGCTCAACATCCTGTTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101410 TGAAGACGCACAAGACGGCCAGCAGCACCCTGCTCAACATCCTGTTCCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCGGCCAGAAGCACCGGCTCAAGTTCGCCTTCCCTAACGGCCGCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101460 TTCGGCCAGAAGCACCGGCTCAAGTTCGCCTTCCCTAACGGCCGCAATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTTCGACTACCCGACCTTCTTCGCCCGCAGCCTGGTGCAGGACTATCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101510 CTTCGACTACCCGACCTTCTTCGCCCGCAGCCTGGTGCAGGACTATCGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCGGGGCCTGCTTCAACATCATCTGCAACCACATGCGCTTCCACTACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101560 CCGGGGCCTGCTTCAACATCATCTGCAACCACATGCGCTTCCACTACGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAGGTGCGCGGCCTGGTGCCGACCAACGCCATCTTCATCACGGTGCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101610 GAGGTGCGCGGCCTGGTGCCGACCAACGCCATCTTCATCACGGTGCTCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CGACCCCGCCCGCTTGTTCGAGTCCTCCTTCCACTACTTCGGGCCGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101660 CGACCCCGCCCGCTTGTTCGAGTCCTCCTTCCACTACTTCGGGCCGGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGCCCCTCACGTGGAAGCTCTCGGCCGGCGACAAGCTGACCGAGTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101710 TGCCCCTCACGTGGAAGCTCTCGGCCGGCGACAAGCTGACCGAGTTCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CAAGACCCGGATCGCTACTACGACCCCAACGGCTTCAATGCCCACTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101760 CAAGACCCGGATCGCTACTACGACCCCAACGGCTTCAATGCCCACTACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCGAAACCTGCTCTTCTTCGACCTGGGCTATGACAACAGCCTGGACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101810 CCGAAACCTGCTCTTCTTCGACCTGGGCTATGACAACAGCCTGGACCCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GCAGCCCGCAGGTGCAGGAGCACATCCTGGAGGTGGAGCGTCGCTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101860 GCAGCCCGCAGGTGCAGGAGCACATCCTGGAGGTGGAGCGTCGCTTCCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTGGTGCTCCTTCAAGAGTACTTCGACGAGTCGCTGGTGCTGCTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101910 CTGGTGCTCCTTCAAGAGTACTTCGACGAGTCGCTGGTGCTGCTGAAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CCTGCTGTGCTGGGAGCTGGAGGACGTGCTCTACTTCAAGCTCAACGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101960 CCTGCTGTGCTGGGAGCTGGAGGACGTGCTCTACTTCAAGCTCAACGCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GCCGCGACTCGCCCGTGCCGCGGCTCTCGGGGGAGCTGTATGGGCGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102010 GCCGCGACTCGCCCGTGCCGCGGCTCTCGGGGGAGCTGTATGGGCGCGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ACCGCCTGGAACATGCTGGACTCCCACCTCTACCGCCACTTCAACGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102060 ACCGCCTGGAACATGCTGGACTCCCACCTCTACCGCCACTTCAACGCCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CTTCTGGCGCAAGGTGGAGGCCTTCGGGCGGGAGCGCATGGCCCGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102110 CTTCTGGCGCAAGGTGGAGGCCTTCGGGCGGGAGCGCATGGCCCGCGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TGGCCGCCCTGCGCCATGCCAACGAGCGCATGCGGACCATCTGCATCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102160 TGGCCGCCCTGCGCCATGCCAACGAGCGCATGCGGACCATCTGCATCGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GGGGGCCACGCCGTGGACGCCGCCGCCATCCAGGACGAGGCCATGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102210 GGGGGCCACGCCGTGGACGCCGCCGCCATCCAGGACGAGGCCATGCAGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CTGGCAGCCGCTGGGCACCAAGTCCATCCTGGGCTACAACCTCAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102260 CTGGCAGCCGCTGGGCACCAAGTCCATCCTGGGCTACAACCTCAAGAAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 GCATCGGGCAGCGGCACGCGCAGCTCTGCCGGCGCATGCTCACGCCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102310 GCATCGGGCAGCGGCACGCGCAGCTCTGCCGGCGCATGCTCACGCCCGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 ATCCAGTACCTGATGGACCTCGGCGCCAACCTGTGGGTCACCAAGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102360 ATCCAGTACCTGATGGACCTCGGCGCCAACCTGTGGGTCACCAAGCTCTG

   1250     .    :    .    :    .
   1242 GAAGTTCATTCGCGATTTCCTGCGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 102410 GAAGTTCATTCGCGATTTCCTGCGGTGG