seq1 = pF1KB5298.tfa, 1902 bp
seq2 = pF1KB5298/gi568815576r_20342076.tfa (gi568815576r:20342076_20589211), 247136 bp

>pF1KB5298 1902
>gi568815576r:20342076_20589211 (Chr22)

(complement)

1-227  (100001-100227)   100% ->
228-393  (117697-117862)   100% ->
394-1112  (123636-124354)   100% ->
1113-1305  (131212-131404)   100% ->
1306-1539  (142536-142769)   99% ->
1540-1902  (146774-147136)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGAGGAGCAGGAGTTCACCCAGCTCTGCAAGTTGCCTGCACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGAGGAGCAGGAGTTCACCCAGCTCTGCAAGTTGCCTGCACAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCACACCCACACTGCGTGAACAACACCTACCGCAGCGCACAGCACTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCACACCCACACTGCGTGAACAACACCTACCGCAGCGCACAGCACTCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCTCTGCTCCGAGGGCTGCTGGCTCTCCGGGACAGCGGAATCCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCTCTGCTCCGAGGGCTGCTGGCTCTCCGGGACAGCGGAATCCTCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATGTTGTGCTGGTGGTGGAGGGCAGACACATCGAGGCCCATCGCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATGTTGTGCTGGTGGTGGAGGGCAGACACATCGAGGCCCATCGCATCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGGCTGCGTCCTGCGATTACTTCAG         AGGAATGTTTGCTG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100201 GCTGGCTGCGTCCTGCGATTACTTCAGGTG...CAGAGGAATGTTTGCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGGGATTGAAGGAGATGGAACAGGAAGAGGTCCTGATCCACGGTGTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117711 GGGGATTGAAGGAGATGGAACAGGAAGAGGTCCTGATCCACGGTGTGTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TACAATGCTATGTGCCAAATCCTACATTTCATATACACCTCCGAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117761 TACAATGCTATGTGCCAAATCCTACATTTCATATACACCTCCGAGCTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCTCAGCCTGAGCAATGTACAAGAGACACTGGTGGCTGCCTGCCAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117811 GCTCAGCCTGAGCAATGTACAAGAGACACTGGTGGCTGCCTGCCAGCTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AG         ATCCCAGAAATTATCCATTTCTGCTGTGATTTCCTCATG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117861 AGGTG...CAGATCCCAGAAATTATCCATTTCTGCTGTGATTTCCTCATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCCTGGGTGGACGAAGAGAACATTCTCGATGTCTACCGGCTGGCAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123675 TCCTGGGTGGACGAAGAGAACATTCTCGATGTCTACCGGCTGGCAGAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTTTGACTTGAGCCGCCTGACTGAGCAACTGGACACCTATATCCTCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123725 GTTTGACTTGAGCCGCCTGACTGAGCAACTGGACACCTATATCCTCAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACTTTGTGGCCTTCTCTCGGACTGACAAGTACCGCCAGCTTCCATTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123775 ACTTTGTGGCCTTCTCTCGGACTGACAAGTACCGCCAGCTTCCATTGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AAGGTCTACTCCCTCCTCAGCAGCAATCGCCTGGAGGTCTCCTGCGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123825 AAGGTCTACTCCCTCCTCAGCAGCAATCGCCTGGAGGTCTCCTGCGAGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CGAGGTATATGAGGGGGCCCTTCTCTACCATTATAGCCTGGAGCAGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123875 CGAGGTATATGAGGGGGCCCTTCTCTACCATTATAGCCTGGAGCAGGTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGGCTGACCAGATCTCGCTGCACGAGCCCCCAAAGCTCCTTGAGACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123925 AGGCTGACCAGATCTCGCTGCACGAGCCCCCAAAGCTCCTTGAGACAGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CGGTTTCCGCTGATGGAAGCTGAGGTCCTGCAGCGGCTGCATGACAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123975 CGGTTTCCGCTGATGGAAGCTGAGGTCCTGCAGCGGCTGCATGACAAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GGACCCCAGCCCTTTGAGGGACACAGTGGCCAGCGCCCTCATGTACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124025 GGACCCCAGCCCTTTGAGGGACACAGTGGCCAGCGCCCTCATGTACCACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GGAACGAGAGCCTACAGCCCAGCCTGCAGAGCCCGCAAACGGAGCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124075 GGAACGAGAGCCTACAGCCCAGCCTGCAGAGCCCGCAAACGGAGCTGCGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TCGGACTTCCAGTGCGTTGTGGGCTTCGGGGGCATTCACTCCACGCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124125 TCGGACTTCCAGTGCGTTGTGGGCTTCGGGGGCATTCACTCCACGCCGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CACTGTCCTCAGCGACCAGGCCAAGTATCTAAACCCCTTACTGGGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124175 CACTGTCCTCAGCGACCAGGCCAAGTATCTAAACCCCTTACTGGGAGAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GGAAGCACTTCACTGCCTCCCTGGCCCCCCGCATGTCCAACCAGGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124225 GGAAGCACTTCACTGCCTCCCTGGCCCCCCGCATGTCCAACCAGGGCATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GCGGTGCTCAACAACTTCGTATACTTGATTGGAGGGGACAACAATGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124275 GCGGTGCTCAACAACTTCGTATACTTGATTGGAGGGGACAACAATGTCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 AGGATTTCGAGCAGAGTCCCGATGCTGGAG         GTATGACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 124325 AGGATTTCGAGCAGAGTCCCGATGCTGGAGGTA...CAGGTATGACCCAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GGCACAACCGCTGGTTCCAGATCCAGTCCCTGCAGCAGGAGCACGCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131223 GGCACAACCGCTGGTTCCAGATCCAGTCCCTGCAGCAGGAGCACGCCGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CTGTCCGTGTGTGTTGTAGGCAGGTACATCTACGCTGTGGCGGGCCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131273 CTGTCCGTGTGTGTTGTAGGCAGGTACATCTACGCTGTGGCGGGCCGTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CTACCACAATGACCTGAATGCTGTGGAGCGCTACGACCCTGCCACCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131323 CTACCACAATGACCTGAATGCTGTGGAGCGCTACGACCCTGCCACCAACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 CCTGGGCATACGTGGCCCCACTCAAGAGGGAG         GTGTATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 131373 CCTGGGCATACGTGGCCCCACTCAAGAGGGAGGTA...CAGGTGTATGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 CACGCAGGCGCGACGCTGGAGGGGAAGATGTATATCACCTGCGGCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142545 CACGCAGGCGCGACGCTGGAGGGGAAGATGTATATCACCTGCGGCCGCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 AGGGGAGGATTACCTGAAAGAGACACACTGCTACGATCCAGGCAGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142595 AGGGGAGGATTACCTGAAAGAGACACACTGCTACGATCCAGGCAGCAACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 CTTGGCACACACTGGCTGACGGGCCTGTGCGGCGCGCCTGGCACGGCATG
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 142645 CTTGGCACACACTGGCTGATGGGCCTGTGCGGCGCGCCTGGCACGGCATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 GCAACCCTCCTCAACAAGCTGTATGTGATCGGGGGCAGCAACAACGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142695 GCAACCCTCCTCAACAAGCTGTATGTGATCGGGGGCAGCAACAACGATGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 CGGATACAGGAGGGACGTGCACCAG         GTGGCCTGCTACAGCT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 142745 CGGATACAGGAGGGACGTGCACCAGGTG...CAGGTGGCCTGCTACAGCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 GCACGTCTGGACAGTGGTCATCTGTCTGCCCACTCCCTGCTGGGCACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146790 GCACGTCTGGACAGTGGTCATCTGTCTGCCCACTCCCTGCTGGGCACGGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 GAGCCTGGCATTGCTGTGCTGGACAACAGGATCTATGTGTTAGGTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146840 GAGCCTGGCATTGCTGTGCTGGACAACAGGATCTATGTGTTAGGTGGCCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 CTCACACAACCGCGGCAGCCGCACAGGCTACGTGCACATTTACGATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146890 CTCACACAACCGCGGCAGCCGCACAGGCTACGTGCACATTTACGATGTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 AGAAGGACTGCTGGGAGGAAGGGCCCCAGCTGGACAACTCCATCTCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146940 AGAAGGACTGCTGGGAGGAAGGGCCCCAGCTGGACAACTCCATCTCAGGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 CTGGCGGCCTGTGTGCTCACCCTGCCCCGCTCCCTGCTCCTTGAGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146990 CTGGCGGCCTGTGTGCTCACCCTGCCCCGCTCCCTGCTCCTTGAGCCGCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 CCGCGGGACCCCTGACCGCAGCCAGGCCGACCCGGACTTTGCCTCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147040 CCGCGGGACCCCTGACCGCAGCCAGGCCGACCCGGACTTTGCCTCTGAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1856 TGATGAGTGTGTCTGACTGGGAGGAGTTTGACAACTCCAGTGAGGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147090 TGATGAGTGTGTCTGACTGGGAGGAGTTTGACAACTCCAGTGAGGAC