seq1 = pF1KB5285.tfa, 2181 bp
seq2 = pF1KB5285/gi568815582f_67510833.tfa (gi568815582f:67510833_67737869), 227037 bp

>pF1KB5285 2181
>gi568815582f:67510833_67737869 (Chr16)

1-781  (100001-100781)   100% ->
782-952  (101119-101289)   100% ->
953-1086  (105913-106046)   100% ->
1087-1207  (109865-109985)   100% ->
1208-1357  (110610-110759)   100% ->
1358-1518  (115723-115883)   100% ->
1519-1701  (117538-117720)   100% ->
1702-1837  (118566-118701)   100% ->
1838-1999  (125858-126019)   100% ->
2000-2181  (126856-127037)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGGTGATGCAGTCGAAGCCATTGTGGAGGAGTCCGAAACTTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGGTGATGCAGTCGAAGCCATTGTGGAGGAGTCCGAAACTTTTAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAAAGGAAAGGAGAGAAAGACTTACCAGAGACGCCGGGAAGGGGGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAAAGGAAAGGAGAGAAAGACTTACCAGAGACGCCGGGAAGGGGGCCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGAAGATGCCTGCCACTTACCCCAGAACCAGACGGATGGGGGTGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGAAGATGCCTGCCACTTACCCCAGAACCAGACGGATGGGGGTGAGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCCAGGATGTCAACAGCAGTGTACAGATGGTGATGATGGAACAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCCAGGATGTCAACAGCAGTGTACAGATGGTGATGATGGAACAGCTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCCACCCTTCTTCAGATGAAGACTGAAGTAATGGAGGGCACAGTGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCCACCCTTCTTCAGATGAAGACTGAAGTAATGGAGGGCACAGTGGCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAGAAGCAGAGGCTGCTGTGGACGATACCCAGATTATAACTTTACAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAGAAGCAGAGGCTGCTGTGGACGATACCCAGATTATAACTTTACAGGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTAAATATGGAGGAACAGCCCATAAACATAGGAGAACTTCAGCTTGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTAAATATGGAGGAACAGCCCATAAACATAGGAGAACTTCAGCTTGTTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGTACCTGTTCCTGTGACTGTACCTGTTGCTACCACTTCAGTAGAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGTACCTGTTCCTGTGACTGTACCTGTTGCTACCACTTCAGTAGAAGAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTCAGGGGGCTTATGAAAATGAAGTGTCTAAAGAGGGCCTTGCGGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTCAGGGGGCTTATGAAAATGAAGTGTCTAAAGAGGGCCTTGCGGAAAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAACCCATGATATGCCACACCCTACCTTTGCCTGAAGGGTTTCAGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAACCCATGATATGCCACACCCTACCTTTGCCTGAAGGGTTTCAGGTGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TAAAGTGGGGGCCAATGGAGAGGTGGAGACACTAGAACAAGGGGAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TAAAGTGGGGGCCAATGGAGAGGTGGAGACACTAGAACAAGGGGAACTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CACCCCAGGAAGATCCTAGTTGGCAAAAAGACCCAGACTATCAGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CACCCCAGGAAGATCCTAGTTGGCAAAAAGACCCAGACTATCAGCCACCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCAAAAAAACAAAGAAAACCAAAAAGAGCAAACTGCGTTATACAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCAAAAAAACAAAGAAAACCAAAAAGAGCAAACTGCGTTATACAGAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGGCAAAGATGTAGATGTGTCTGTCTACGATTTTGAGGAAGAACAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGGCAAAGATGTAGATGTGTCTGTCTACGATTTTGAGGAAGAACAGCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGGTCTGCTATCAGAGGTTAATGCAGAGAAAGTGGTTGGTAATATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGGTCTGCTATCAGAGGTTAATGCAGAGAAAGTGGTTGGTAATATGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCTCCAAAGCCAACAAAAATTAAAAAGAAAG         GTGTAAAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100751 CCTCCAAAGCCAACAAAAATTAAAAAGAAAGGTA...TAGGTGTAAAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GACATTCCAGTGTGAGCTTTGCAGTTACACGTGTCCACGGCGTTCAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101129 GACATTCCAGTGTGAGCTTTGCAGTTACACGTGTCCACGGCGTTCAAATT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TGGATCGTCACATGAAAAGCCACACTGATGAGAGACCACACAAGTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101179 TGGATCGTCACATGAAAAGCCACACTGATGAGAGACCACACAAGTGCCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CTCTGTGGCAGGGCATTCAGAACAGTCACCCTCCTGAGGAATCACCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101229 CTCTGTGGCAGGGCATTCAGAACAGTCACCCTCCTGAGGAATCACCTTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CACACACACAG         GTACTCGTCCTCACAAGTGCCCAGACTGCG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101279 CACACACACAGGTG...TAGGTACTCGTCCTCACAAGTGCCCAGACTGCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ACATGGCCTTTGTGACCAGTGGAGAATTGGTTCGGCATCGTCGTTACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105943 ACATGGCCTTTGTGACCAGTGGAGAATTGGTTCGGCATCGTCGTTACAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CACACCCACGAGAAGCCATTCAAGTGTTCCATGTGCGATTACGCCAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105993 CACACCCACGAGAAGCCATTCAAGTGTTCCATGTGCGATTACGCCAGTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 AGAA         GTCAGCAAATTAAAACGTCACATTCGCTCTCATACTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106043 AGAAGTG...CAGGTCAGCAAATTAAAACGTCACATTCGCTCTCATACTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GAGAGCGTCCGTTTCAGTGCAGTTTGTGCAGTTATGCCAGCAGGGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109902 GAGAGCGTCCGTTTCAGTGCAGTTTGTGCAGTTATGCCAGCAGGGACACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 TACAAGCTGAAAAGGCACATGAGAACCCATTCAG         GGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 109952 TACAAGCTGAAAAGGCACATGAGAACCCATTCAGGTA...AAGGGGAAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GCCTTATGAATGTTATATTTGTCATGCTCGGTTTACCCAAAGTGGTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110617 GCCTTATGAATGTTATATTTGTCATGCTCGGTTTACCCAAAGTGGTACCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 TGAAGATGCACATTTTACAGAAGCACACAGAAAATGTGGCCAAATTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110667 TGAAGATGCACATTTTACAGAAGCACACAGAAAATGTGGCCAAATTTCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 TGTCCCCACTGTGACACAGTCATAGCCCGAAAAAGTGATTTGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 110717 TGTCCCCACTGTGACACAGTCATAGCCCGAAAAAGTGATTTGGGTA...C

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1358   GTGTCCACTTGCGAAAGCAGCATTCCTATATTGAGCAAGGCAAGAAAT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115721 AGGTGTCCACTTGCGAAAGCAGCATTCCTATATTGAGCAAGGCAAGAAAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 GCCGTTACTGTGATGCTGTGTTTCATGAGCGCTATGCCCTCATCCAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115771 GCCGTTACTGTGATGCTGTGTTTCATGAGCGCTATGCCCTCATCCAGCAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 CAGAAGTCACACAAGAATGAGAAGCGCTTTAAGTGTGACCAGTGTGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115821 CAGAAGTCACACAAGAATGAGAAGCGCTTTAAGTGTGACCAGTGTGATTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 CGCTTGTAGACAG         GAGAGGCACATGATCATGCACAAGCGCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 115871 CGCTTGTAGACAGGTA...CAGGAGAGGCACATGATCATGCACAAGCGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 CCCACACCGGGGAGAAGCCTTACGCCTGCAGCCACTGCGATAAGACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117566 CCCACACCGGGGAGAAGCCTTACGCCTGCAGCCACTGCGATAAGACCTTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 CGCCAGAAGCAGCTTCTCGACATGCACTTCAAGCGCTATCACGACCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117616 CGCCAGAAGCAGCTTCTCGACATGCACTTCAAGCGCTATCACGACCCCAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 CTTCGTCCCTGCGGCTTTTGTCTGTTCTAAGTGTGGGAAAACATTTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117666 CTTCGTCCCTGCGGCTTTTGTCTGTTCTAAGTGTGGGAAAACATTTACAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 GTCGG         AATACCATGGCAAGACATGCTGATAATTGTGCTGGC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117716 GTCGGGTA...TAGAATACCATGGCAAGACATGCTGATAATTGTGCTGGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 CCAGATGGCGTAGAGGGGGAAAATGGAGGAGAAACGAAGAAGAGTAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118602 CCAGATGGCGTAGAGGGGGAAAATGGAGGAGAAACGAAGAAGAGTAAACG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 TGGAAGAAAAAGAAAGATGCGCTCTAAGAAAGAAGATTCCTCTGACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118652 TGGAAGAAAAAGAAAGATGCGCTCTAAGAAAGAAGATTCCTCTGACAGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838          AAAATGCTGAACCAGATCTGGACGACAATGAGGATGAGGAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118702 GTA...AAGAAAATGCTGAACCAGATCTGGACGACAATGAGGATGAGGAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 GAGCCTGCCGTAGAAATTGAACCTGAGCCAGAGCCTCAGCCTGTGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125899 GAGCCTGCCGTAGAAATTGAACCTGAGCCAGAGCCTCAGCCTGTGACCCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 AGCCCCACCACCCGCCAAGAAGCGGAGAGGACGACCCCCTGGCAGAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125949 AGCCCCACCACCCGCCAAGAAGCGGAGAGGACGACCCCCTGGCAGAACCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 ACCAGCCCAAACAGAACCAGC         CAACAGCTATCATTCAGGTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 125999 ACCAGCCCAAACAGAACCAGCGTA...CAGCAACAGCTATCATTCAGGTT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 GAAGACCAGAATACAGGTGCAATTGAGAACATTATAGTTGAAGTAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126876 GAAGACCAGAATACAGGTGCAATTGAGAACATTATAGTTGAAGTAAAAAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 AGAGCCAGATGCTGAGCCCGCAGAGGGAGAGGAAGAGGAGGCCCAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126926 AGAGCCAGATGCTGAGCCCGCAGAGGGAGAGGAAGAGGAGGCCCAGCCAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120 CTGCCACAGATGCCCCCAACGGAGACCTCACGCCCGAGATGATCCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126976 CTGCCACAGATGCCCCCAACGGAGACCTCACGCCCGAGATGATCCTCAGC

   2250     .    :
   2170 ATGATGGACCGG
        ||||||||||||
 127026 ATGATGGACCGG