seq1 = pF1KB5284.tfa, 567 bp
seq2 = pF1KB5284/gi568815590r_27136849.tfa (gi568815590r:27136849_27342493), 205645 bp

>pF1KB5284 567
>gi568815590r:27136849_27342493 (Chr8)

(complement)

6-109  (99996-100097)   97% ->
110-318  (101232-101440)   100% ->
319-510  (102332-102523)   100% ->
511-567  (105589-105645)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      6 CCTTGCTGCCTACAAAGAGAAGATGAAGGAGCTCCCGCTGGTGTCCTTGT
        ||--|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99996 CC  GCAGCCTACAAAGAGAAGATGAAGGAGCTCCCGCTGGTGTCCTTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     56 TCTGCTCCTGCTTCCTGGCCGATCCCCTGAATAAGTCGTCCTACAAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100044 TCTGCTCCTGCTTCCTGGCCGATCCCCTGAATAAGTCGTCCTACAAATAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    106 GAAG         CAGACACGGTGGACCTGAATTGGTGCGTCATTTCCGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100094 GAAGGTC...TAGCAGACACGGTGGACCTGAATTGGTGCGTCATTTCCGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    147 CATGGAAGTCATCGAGCTGAACAAATGCACCTCGGGCCAATCCTTTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101269 CATGGAAGTCATCGAGCTGAACAAATGCACCTCGGGCCAATCCTTTGAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    197 TCATCCTGAAGCCACCCTCCTTTGATGGGGTTCCCGAGTTCAACGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101319 TCATCCTGAAGCCACCCTCCTTTGATGGGGTTCCCGAGTTCAACGCCTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    247 CTGCCAAGGCGGCGAGACCCATCCCTGGAAGAGATCCAGAAGAAACTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101369 CTGCCAAGGCGGCGAGACCCATCCCTGGAAGAGATCCAGAAGAAACTAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    297 AGCGGCTGAGGAGCGAAGGAAG         TACCAGGAAGCGGAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101419 AGCGGCTGAGGAGCGAAGGAAGGTA...CAGTACCAGGAAGCGGAGCTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    338 TGAAACACCTAGCAGAGAAACGGGAACATGAGAGAGAGGTGATCCAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102351 TGAAACACCTAGCAGAGAAACGGGAACATGAGAGAGAGGTGATCCAAAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    388 GCCATTGAGGAAAACAACAACTTCATCAAGATGGCTAAGGAAAAACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102401 GCCATTGAGGAAAACAACAACTTCATCAAGATGGCTAAGGAAAAACTGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    438 CCAGAAGATGGAATCCAACAAGGAGAACAGGGAGGCCCACCTCGCCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102451 CCAGAAGATGGAATCCAACAAGGAGAACAGGGAGGCCCACCTCGCCGCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    488 TGTTGGAACGGCTGCAAGAGAAG         GACAAGCACGCCGAGGAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 102501 TGTTGGAACGGCTGCAAGAGAAGGTG...CAGGACAAGCACGCCGAGGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .
    529 GTGCGGAAAAACAAGGAGCTGAAGGAAGAGGCCTCCAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105607 GTGCGGAAAAACAAGGAGCTGAAGGAAGAGGCCTCCAGG