seq1 = pF1KB5275.tfa, 1407 bp
seq2 = pF1KB5275/gi568815591r_44014788.tfa (gi568815591r:44014788_44222053), 207266 bp

>pF1KB5275 1407
>gi568815591r:44014788_44222053 (Chr7)

(complement)

1-220  (100001-100220)   100% ->
221-342  (103990-104111)   100% ->
343-466  (104312-104435)   100% ->
467-581  (104807-104921)   100% ->
582-780  (105039-105237)   100% ->
781-861  (105544-105624)   100% ->
862-1019  (105782-105939)   100% ->
1020-1147  (106161-106288)   100% ->
1148-1249  (106658-106759)   100% ->
1250-1407  (107109-107266)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTTCTGAGCAGGCTGCCCAGAGGGCCCACACTCTACTGTCCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTTTCTGAGCAGGCTGCCCAGAGGGCCCACACTCTACTGTCCCCACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCAGCCAACAATGCCACCTTTGCCCGGGTGCCAGTGGCAACCTACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCAGCCAACAATGCCACCTTTGCCCGGGTGCCAGTGGCAACCTACACCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTCCTCACAACCCTTCCGGCTAGGAGAGCGCAGCTTTAGCCGGCAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTCCTCACAACCCTTCCGGCTAGGAGAGCGCAGCTTTAGCCGGCAGTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCCACATTTATGCCACCCGCCTCATCCAAATGAGACCCTTCCTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCCACATTTATGCCACCCGCCTCATCCAAATGAGACCCTTCCTGGAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGGGCCCAGCAGCACTGGG         GCAGTGGAGTGGGAGTGAAGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100201 CCGGGCCCAGCAGCACTGGGGTA...CAGGCAGTGGAGTGGGAGTGAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCTGTGTGAACTGCAGCCTGAGGAGAAGTGCTGTGTGGTGGGCACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104011 AGCTGTGTGAACTGCAGCCTGAGGAGAAGTGCTGTGTGGTGGGCACTCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCAAGGCCATGCCGCTGCAGCCCTCCATCCTGCGGGAGGTCAGCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104061 TTCAAGGCCATGCCGCTGCAGCCCTCCATCCTGCGGGAGGTCAGCGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 G         CACAACCTGCTCCCCCAGCCTCCTCGGAGTAAATACATAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104111 GGTG...CAGCACAACCTGCTCCCCCAGCCTCCTCGGAGTAAATACATAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACCCAGATGACGAGCTGGTCTTGGAAGATGAACTGCAGCGTATCAAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104352 ACCCAGATGACGAGCTGGTCTTGGAAGATGAACTGCAGCGTATCAAACTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAAGGCACCATTGACGTGTCAAAGCTGGTTACGG         GGACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 104402 AAAGGCACCATTGACGTGTCAAAGCTGGTTACGGGTA...CAGGGACTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCTGGCTGTGTTTGGCTCCGTGAGAGACGACGGGAAGTTTCTGGTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104814 CCTGGCTGTGTTTGGCTCCGTGAGAGACGACGGGAAGTTTCTGGTGGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACTATTGCTTTGCTGACCTTGCTCCCCAGAAGCCCGCACCCCCACTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104864 ACTATTGCTTTGCTGACCTTGCTCCCCAGAAGCCCGCACCCCCACTTGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACAGATAG         GTTTGTGCTACTGGTGTCCGGCCTGGGCCTGGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 104914 ACAGATAGGTG...CAGGTTTGTGCTACTGGTGTCCGGCCTGGGCCTGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGGCGGTGGAGGCGAGAGCCTGCTGGGCACCCAGCTGCTGGTGGATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105072 TGGCGGTGGAGGCGAGAGCCTGCTGGGCACCCAGCTGCTGGTGGATGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGACGGGGCAGCTTGGGGACGAAGGGGAGCAGTGCAGCGCCGCCCACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105122 TGACGGGGCAGCTTGGGGACGAAGGGGAGCAGTGCAGCGCCGCCCACGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TCCCGGGTTATCCTCGCTGGCAACCTCCTCAGCCACAGCACCCAGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105172 TCCCGGGTTATCCTCGCTGGCAACCTCCTCAGCCACAGCACCCAGAGCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GGATTCTATCAATAAG         GCCAAATACCTCACCAAGAAAACCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105222 GGATTCTATCAATAAGGTA...CAGGCCAAATACCTCACCAAGAAAACCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGGCAGCCAGCGTGGAGGCTGTTAAGATGCTGGATGAGATCCTCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105569 AGGCAGCCAGCGTGGAGGCTGTTAAGATGCTGGATGAGATCCTCCTGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTGAGC         GCCTCAGTGCCCGTGGACGTGATGCCAGGCGAGTT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105619 CTGAGCGTG...CAGGCCTCAGTGCCCGTGGACGTGATGCCAGGCGAGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGATCCCACCAATTACACGCTCCCCCAGCAGCCCCTCCACCCCTGCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105817 TGATCCCACCAATTACACGCTCCCCCAGCAGCCCCTCCACCCCTGCATGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCCCGCTGGCCACTGCCTACTCCACGCTCCAGCTGGTCACCAACCCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105867 TCCCGCTGGCCACTGCCTACTCCACGCTCCAGCTGGTCACCAACCCCTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CAGGCCACCATTGATGGAGTCAG         ATTTTTGGGGACATCAGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 105917 CAGGCCACCATTGATGGAGTCAGGTA...CAGATTTTTGGGGACATCAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 ACAGAACGTGAGTGACATTTTCCGATACAGCAGCATGGAGGATCACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106179 ACAGAACGTGAGTGACATTTTCCGATACAGCAGCATGGAGGATCACTTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGATCCTGGAGTGGACCCTGCGGGTCCGTCACATCAGCCCCACAGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106229 AGATCCTGGAGTGGACCCTGCGGGTCCGTCACATCAGCCCCACAGCCCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GACACTCTAG         GTTGTTACCCCTTCTACAAAACTGACCCGTT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 106279 GACACTCTAGGTA...CAGGTTGTTACCCCTTCTACAAAACTGACCCGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CATCTTCCCAGAGTGCCCGCATGTCTACTTTTGTGGCAACACCCCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106689 CATCTTCCCAGAGTGCCCGCATGTCTACTTTTGTGGCAACACCCCCAGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TTGGCTCCAAAATCATCCGAG         GTCCTGAGGACCAGACAGTG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 106739 TTGGCTCCAAAATCATCCGAGGTA...CAGGTCCTGAGGACCAGACAGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CTGTTGGTGACTGTCCCTGACTTCAGTGCCACGCAGACCGCCTGCCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107129 CTGTTGGTGACTGTCCCTGACTTCAGTGCCACGCAGACCGCCTGCCTTGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GAACCTGCGCAGCCTGGCCTGCCAGCCCATCAGCTTCTCGGGCTTCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107179 GAACCTGCGCAGCCTGGCCTGCCAGCCCATCAGCTTCTCGGGCTTCGGGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .
   1370 CAGAGGACGATGACCTGGGAGGCCTGGGGCTGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107229 CAGAGGACGATGACCTGGGAGGCCTGGGGCTGGGCCCC