seq1 = pF1KB5274.tfa, 1047 bp
seq2 = pF1KB5274/gi568815593r_141218998.tfa (gi568815593r:141218998_141420044), 201047 bp

>pF1KB5274 1047
>gi568815593r:141218998_141420044 (Chr5)

(complement)

1-1047  (100001-101047)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTAAAAGCAAAGATGATGCTCCTCACGAACTGGAGAGCCAGTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTAAAAGCAAAGATGATGCTCCTCACGAACTGGAGAGCCAGTTTAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTACGTCTGCCTCCAGAATATGCCTCTACTGTGAGAAGGGCAGTACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTACGTCTGCCTCCAGAATATGCCTCTACTGTGAGAAGGGCAGTACAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGGTCATGTCAACCTCAAGGACAGACTGACAATTGAGTTACATCCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGGTCATGTCAACCTCAAGGACAGACTGACAATTGAGTTACATCCTGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGCGTCATGGAATCGTCAGAGTGGACCGTGTTCCATTGGCCTCAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGCGTCATGGAATCGTCAGAGTGGACCGTGTTCCATTGGCCTCAAAATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGTAGACCTGCCCTGTGTTATGGAAAGCTTGAAAACCATTGATAAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGTAGACCTGCCCTGTGTTATGGAAAGCTTGAAAACCATTGATAAAAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTTTTTACAAGACAGCTGATATCTGTCAGATGCTTGTATCCACAGTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTTTTTACAAGACAGCTGATATCTGTCAGATGCTTGTATCCACAGTTGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGTGATCTCTATCCTCCTGTGGAGGAGCCAGTTGCTAGCACTGATCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGTGATCTCTATCCTCCTGTGGAGGAGCCAGTTGCTAGCACTGATCCTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGCAAGCAAGAAAAAGGATAAGGACAAAGAGAAAAAGTTTATCTGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGCAAGCAAGAAAAAGGATAAGGACAAAGAGAAAAAGTTTATCTGGAACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACGGAATTACTCTGCCTCTAAAGAATGTCAGGAAGAGAAGGTTCCGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACGGAATTACTCTGCCTCTAAAGAATGTCAGGAAGAGAAGGTTCCGGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACAGCAAAGAAGAAATATATTGAATCTCCAGATGTTGAAAAAGAAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACAGCAAAGAAGAAATATATTGAATCTCCAGATGTTGAAAAAGAAGTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACGATTGCTGAGTACAGATGCTGAAGCTGTTAGTACTCGGTGGGAAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACGATTGCTGAGTACAGATGCTGAAGCTGTTAGTACTCGGTGGGAAATAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTGCCGAAGATGAAACAAAGGAGGCAGAAAATCAAGGCCTGGATATCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTGCCGAAGATGAAACAAAGGAGGCAGAAAATCAAGGCCTGGATATCTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCTCCAGGAATGTCTGGTCACAGGCAGGGCCATGACTCATTAGAACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCTCCAGGAATGTCTGGTCACAGGCAGGGCCATGACTCATTAGAACATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGAGCTTCGGGAGATATTCAATGACCTCAGCAGCAGCAGTGAGGATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGAGCTTCGGGAGATATTCAATGACCTCAGCAGCAGCAGTGAGGATGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATGAGACCCAGCATCAAGATGAAGAAGATATAAACATCATTGACACGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATGAGACCCAGCATCAAGATGAAGAAGATATAAACATCATTGACACGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAAGATCTGGAGAGACAGCTACAGGACAAGCTAAATGAATCAGATGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAAGATCTGGAGAGACAGCTACAGGACAAGCTAAATGAATCAGATGAACA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCACCAGGAAAATGAAGGAACCAATCAGCTGGTTATGGGAATTCAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCACCAGGAAAATGAAGGAACCAATCAGCTGGTTATGGGAATTCAGAAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGATTGACAACATGAAAGGCAAGCTCCAAGAGACCCAGGACAGGGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGATTGACAACATGAAAGGCAAGCTCCAAGAGACCCAGGACAGGGCAAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CGACAAGAGGATCTCATCATGAAAGTGGAAAATCTGGCTCTCAAGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CGACAAGAGGATCTCATCATGAAAGTGGAAAATCTGGCTCTCAAGAACAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ATTTCAGGCTGTACTGGATGAGCTCAAACAAAAGGAAGACCGAGAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ATTTCAGGCTGTACTGGATGAGCTCAAACAAAAGGAAGACCGAGAAAAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1001 AGCAACTCAGCTCTTTGCAAGAGGAGCTAGAATCACTCCTAGAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGCAACTCAGCTCTTTGCAAGAGGAGCTAGAATCACTCCTAGAGAAG