seq1 = pF1KB5273.tfa, 396 bp
seq2 = pF1KB5273/gi568815590r_81343401.tfa (gi568815590r:81343401_81547386), 203986 bp

>pF1KB5273 396
>gi568815590r:81343401_81547386 (Chr8)

(complement)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-246  (102398-102570)   100% ->
247-348  (102786-102887)   100% ->
349-396  (103939-103986)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCAACAAATTCCTGGGCACCTGGAAACTTGTCTCTAGTGAGAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCAACAAATTCCTGGGCACCTGGAAACTTGTCTCTAGTGAGAACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGACGATTACATGAAAGCTCTGG         GTGTGGGGTTAGCCACCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 TGACGATTACATGAAAGCTCTGGGTA...CAGGTGTGGGGTTAGCCACCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAAAACTGGGAAATTTGGCCAAACCCACTGTGATCATCAGCAAGAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102416 GAAAACTGGGAAATTTGGCCAAACCCACTGTGATCATCAGCAAGAAAGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATATTATAACTATACGAACTGAAAGTACCTTTAAAAATACAGAAATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102466 GATATTATAACTATACGAACTGAAAGTACCTTTAAAAATACAGAAATCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTCAAGCTAGGCCAGGAATTTGAAGAAACCACAGCTGACAATAGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102516 CTTCAAGCTAGGCCAGGAATTTGAAGAAACCACAGCTGACAATAGAAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCAAG         AGCATCGTAACCCTGCAGAGAGGATCACTGAATCAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102566 CCAAGGTA...CAGAGCATCGTAACCCTGCAGAGAGGATCACTGAATCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTGCAGAGATGGGATGGCAAAGAGACAACCATAAAGAGAAAGCTAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102822 GTGCAGAGATGGGATGGCAAAGAGACAACCATAAAGAGAAAGCTAGTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGGAAAATGGTAGCG         GAATGTAAAATGAAGGGCGTGGTGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102872 TGGGAAAATGGTAGCGGTA...AAGGAATGTAAAATGAAGGGCGTGGTGT

    400     .    :    .    :
    374 GCACCAGAATCTATGAGAAGGTC
        |||||||||||||||||||||||
 103964 GCACCAGAATCTATGAGAAGGTC