seq1 = pF1KB5272.tfa, 744 bp
seq2 = pF1KB5272/gi568815597r_154057642.tfa (gi568815597r:154057642_154283119), 225478 bp

>pF1KB5272 744
>gi568815597r:154057642_154283119 (Chr1)

(complement)

1-132  (100001-100132)   100% ->
133-266  (106872-107005)   100% ->
267-384  (109919-110036)   100% ->
385-455  (110142-110212)   100% ->
456-531  (111632-111707)   100% ->
532-594  (112409-112471)   100% ->
595-664  (112651-112720)   100% ->
665-744  (125399-125478)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGGGATCACCACCATCGAGGCGGTGAAGCGCAAGATCCAGGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGGGATCACCACCATCGAGGCGGTGAAGCGCAAGATCCAGGTTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGCAGCAGGCAGATGATGCAGAGGAGCGAGCTGAGCGCCTCCAGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGCAGCAGGCAGATGATGCAGAGGAGCGAGCTGAGCGCCTCCAGCGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGTTGAGGGAGAAAGGCGGGCCCGGGAACAG         GCTGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100101 AAGTTGAGGGAGAAAGGCGGGCCCGGGAACAGGTA...CAGGCTGAGGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGTGGCCTCCTTGAACCGTAGGATCCAGCTGGTTGAAGAAGAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106881 GAGGTGGCCTCCTTGAACCGTAGGATCCAGCTGGTTGAAGAAGAGCTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCGTGCTCAGGAGCGCCTGGCCACTGCCCTGCAAAAGCTGGAAGAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106931 CCGTGCTCAGGAGCGCCTGGCCACTGCCCTGCAAAAGCTGGAAGAAGCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAAAAGCTGCTGATGAGAGTGAGAG         AGGTATGAAGGTTATT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 106981 AAAAAGCTGCTGATGAGAGTGAGAGGTG...CAGAGGTATGAAGGTTATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAAAACCGGGCCTTAAAAGATGAAGAAAAGATGGAACTCCAGGAAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109935 GAAAACCGGGCCTTAAAAGATGAAGAAAAGATGGAACTCCAGGAAATCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACTCAAAGAAGCTAAGCACATTGCAGAAGAGGCAGATAGGAAGTATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109985 ACTCAAAGAAGCTAAGCACATTGCAGAAGAGGCAGATAGGAAGTATGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AG         GTGGCTCGTAAGTTGGTGATCATTGAAGGAGACTTGGAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110035 AGGTA...TAGGTGGCTCGTAAGTTGGTGATCATTGAAGGAGACTTGGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CGCACAGAGGAACGAGCTGAGCTGGCAGAGTC         TAAGTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 110181 CGCACAGAGGAACGAGCTGAGCTGGCAGAGTCGTG...CAGTAAGTGTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGAGCTGGAGGAGGAGCTGAAGAATGTCACCAACAACCTCAAGTCTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111641 TGAGCTGGAGGAGGAGCTGAAGAATGTCACCAACAACCTCAAGTCTCTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGGCTCAGGCGGAGAAG         TACTCTCAAAAAGAAGATAAATAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 111691 AGGCTCAGGCGGAGAAGGTA...CAGTACTCTCAAAAAGAAGATAAATAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAGGAAGAAATCAAGATTCTTACTGATAAACTCAAGGAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 112433 GAGGAAGAAATCAAGATTCTTACTGATAAACTCAAGGAGGTG...CAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AGAGACCCGTGCTGAGTTTGCTGAGAGATCGGTAGCCAAGCTGGAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112653 AGAGACCCGTGCTGAGTTTGCTGAGAGATCGGTAGCCAAGCTGGAAAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CAATTGATGACCTGGAAG         ATAAACTGAAATGCACCAAAGAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 112703 CAATTGATGACCTGGAAGGTA...TAGATAAACTGAAATGCACCAAAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GAGCACCTCTGTACACAAAGGATGCTGGACCAGACCCTGCTTGACCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125422 GAGCACCTCTGTACACAAAGGATGCTGGACCAGACCCTGCTTGACCTGAA

    800     .
    738 TGAGATG
        |||||||
 125472 TGAGATG