seq1 = pF1KB5263.tfa, 1137 bp
seq2 = pF1KB5263/gi568815582r_30016671.tfa (gi568815582r:30016671_30223130), 206460 bp

>pF1KB5263 1137
>gi568815582r:30016671_30223130 (Chr16)

(complement)

1-170  (99922-100091)   100% ->
171-353  (101125-101307)   100% ->
354-543  (104593-104782)   100% ->
544-660  (104968-105084)   100% ->
661-775  (105347-105461)   100% ->
776-907  (105846-105977)   100% ->
908-1017  (106128-106237)   100% ->
1018-1137  (106341-106460)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGCGGCGGCTCAGGGGGGCGGGGGCGGGGAGCCCCGTAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99922 ATGGCGGCGGCGGCGGCTCAGGGGGGCGGGGGCGGGGAGCCCCGTAGAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGGGGGTCGGCCCGGGGGTCCCGGGGGAGGTGGAGATGGTGAAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99972 CGAGGGGGTCGGCCCGGGGGTCCCGGGGGAGGTGGAGATGGTGAAGGGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCCGTTCGACGTGGGCCCGCGCTACACGCAGTTGCAGTACATCGGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100022 AGCCGTTCGACGTGGGCCCGCGCTACACGCAGTTGCAGTACATCGGCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCGCGTACGGCATGGTCAG         CTCGGCCTATGACCACGTGCG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100072 GGCGCGTACGGCATGGTCAGGTG...CAGCTCGGCCTATGACCACGTGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGACTCGCGTGGCCATCAAGAAGATCAGCCCCTTCGAACATCAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101146 CAAGACTCGCGTGGCCATCAAGAAGATCAGCCCCTTCGAACATCAGACCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACTGCCAGCGCACGCTCCGGGAGATCCAGATCCTGCTGCGCTTCCGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101196 ACTGCCAGCGCACGCTCCGGGAGATCCAGATCCTGCTGCGCTTCCGCCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGAATGTCATCGGCATCCGAGACATTCTGCGGGCGTCCACCCTGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101246 GAGAATGTCATCGGCATCCGAGACATTCTGCGGGCGTCCACCCTGGAAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATGAGAGATGT         CTACATTGTGCAGGACCTGATGGAGACTG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101296 CATGAGAGATGTGTA...CAGCTACATTGTGCAGGACCTGATGGAGACTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACCTGTACAAGTTGCTGAAAAGCCAGCAGCTGAGCAATGACCATATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104622 ACCTGTACAAGTTGCTGAAAAGCCAGCAGCTGAGCAATGACCATATCTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TACTTCCTCTACCAGATCCTGCGGGGCCTCAAGTACATCCACTCCGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104672 TACTTCCTCTACCAGATCCTGCGGGGCCTCAAGTACATCCACTCCGCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CGTGCTCCACCGAGATCTAAAGCCCTCCAACCTGCTCATCAACACCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104722 CGTGCTCCACCGAGATCTAAAGCCCTCCAACCTGCTCATCAACACCACCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCGACCTTAAG         ATTTGTGATTTCGGCCTGGCCCGGATTGCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 104772 GCGACCTTAAGGTC...CAGATTTGTGATTTCGGCCTGGCCCGGATTGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GATCCTGAGCATGACCACACCGGCTTCCTGACGGAGTATGTGGCTACGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104998 GATCCTGAGCATGACCACACCGGCTTCCTGACGGAGTATGTGGCTACGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTGGTACCGGGCCCCAGAGATCATGCTGAACTCCAAG         GGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 105048 CTGGTACCGGGCCCCAGAGATCATGCTGAACTCCAAGGTA...CAGGGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATACCAAGTCCATCGACATCTGGTCTGTGGGCTGCATTCTGGCTGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105351 ATACCAAGTCCATCGACATCTGGTCTGTGGGCTGCATTCTGGCTGAGATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTCTCTAACCGGCCCATCTTCCCTGGCAAGCACTACCTGGATCAGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105401 CTCTCTAACCGGCCCATCTTCCCTGGCAAGCACTACCTGGATCAGCTCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCACATTCTGG         GCATCCTGGGCTCCCCATCCCAGGAGGACC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105451 CCACATTCTGGGTG...CAGGCATCCTGGGCTCCCCATCCCAGGAGGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGAATTGTATCATCAACATGAAGGCCCGAAACTACCTACAGTCTCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105876 TGAATTGTATCATCAACATGAAGGCCCGAAACTACCTACAGTCTCTGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TCCAAGACCAAGGTGGCTTGGGCCAAGCTTTTCCCCAAGTCAGACTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105926 TCCAAGACCAAGGTGGCTTGGGCCAAGCTTTTCCCCAAGTCAGACTCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AG         CCCTTGACCTGCTGGACCGGATGTTAACCTTTAACCCCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105976 AGGTT...TAGCCCTTGACCTGCTGGACCGGATGTTAACCTTTAACCCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ATAAACGGATCACAGTGGAGGAAGCGCTGGCTCACCCCTACCTGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106167 ATAAACGGATCACAGTGGAGGAAGCGCTGGCTCACCCCTACCTGGAGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TACTATGACCCGACGGATGAG         CCAGTGGCCGAGGAGCCCTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 106217 TACTATGACCCGACGGATGAGGTG...CAGCCAGTGGCCGAGGAGCCCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CACCTTCGCCATGGAGCTGGATGACCTACCTAAGGAGCGGCTGAAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106361 CACCTTCGCCATGGAGCTGGATGACCTACCTAAGGAGCGGCTGAAGGAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCATCTTCCAGGAGACAGCACGCTTCCAGCCCGGAGTGCTGGAGGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106411 TCATCTTCCAGGAGACAGCACGCTTCCAGCCCGGAGTGCTGGAGGCCCCC