seq1 = pF1KB5260.tfa, 1143 bp
seq2 = pF1KB5260/gi568815591r_450433.tfa (gi568815591r:450433_811505), 361073 bp

>pF1KB5260 1143
>gi568815591r:450433_811505 (Chr7)

(complement)

1-177  (100001-100177)   100% ->
178-348  (130780-130950)   100% ->
349-440  (134186-134277)   100% ->
441-502  (204054-204115)   100% ->
503-549  (205267-205313)   100% ->
550-708  (215202-215360)   100% ->
709-769  (226938-226998)   100% ->
770-891  (232129-232250)   100% ->
892-973  (260036-260117)   100% ->
974-1143  (260904-261073)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCCCCGCCCGCCTGCCCCTCGGAGGAGGACGAGAGCCTGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCCCCGCCCGCCTGCCCCTCGGAGGAGGACGAGAGCCTGAAGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGTGAGCTGTACGTGCAGCTGCACGGGATCCAGCAGGTCCTCAAAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGTGAGCTGTACGTGCAGCTGCACGGGATCCAGCAGGTCCTCAAAGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTATCGTCCACCTCTGCATCTCCAAGCCCGAACGCCCCATGAAGTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTATCGTCCACCTCTGCATCTCCAAGCCCGAACGCCCCATGAAGTTCCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGGAGCACTTCGAGAAGCTGGAGAAG         GAAGAAAACAGGCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100151 CGGGAGCACTTCGAGAAGCTGGAGAAGGTG...CAGGAAGAAAACAGGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATTTTGGCGCGGCAAAAGTCAAACTCACAGTCGGACTCCCATGATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130794 GATTTTGGCGCGGCAAAAGTCAAACTCACAGTCGGACTCCCATGATGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGTGTCGCCCACCCCCCCGAACCCTGTGGTGAAGGCCCGCCGCCGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130844 AGGTGTCGCCCACCCCCCCGAACCCTGTGGTGAAGGCCCGCCGCCGGCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGAGGCGTGAGTGCCGAGGTGTACACCGAGGAGGACGCCGTGTCCTACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130894 GGAGGCGTGAGTGCCGAGGTGTACACCGAGGAGGACGCCGTGTCCTACGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAGGAAG         GTGATTCCCAAGGACTACAAAACCATGACTGCGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130944 CAGGAAGGTG...CAGGTGATTCCCAAGGACTACAAAACCATGACTGCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGCCAAGGCCATCTCCAAGAACGTGCTCTTCGCTCACCTGGATGACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134220 TGGCCAAGGCCATCTCCAAGAACGTGCTCTTCGCTCACCTGGATGACAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGAGGAG         TGACATATTCGATGCCATGTTCCCTGTCACTCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 134270 GAGAGGAGGTA...CAGTGACATATTCGATGCCATGTTCCCTGTCACTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CATCGCTGGGGAGACTGTTATACAGCAAG         GGAATGAAGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 204087 CATCGCTGGGGAGACTGTTATACAGCAAGGTA...CAGGGAATGAAGGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACAACTTCTATGTCGTTGATCAAGGGGAAGTGGAT         GTGTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 205279 ACAACTTCTATGTCGTTGATCAAGGGGAAGTGGATGTG...AAGGTGTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GTGAACGGAGAGTGGGTGACCAACATCAGCGAGGGAGGCAGCTTCGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215208 GTGAACGGAGAGTGGGTGACCAACATCAGCGAGGGAGGCAGCTTCGGGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GCTGGCGCTCATCTACGGCACCCCCAGGGCTGCGACCGTGAAAGCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215258 GCTGGCGCTCATCTACGGCACCCCCAGGGCTGCGACCGTGAAAGCCAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CGGACCTCAAGCTCTGGGGGATCGACCGGGACAGCTACCGGCGCATCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215308 CGGACCTCAAGCTCTGGGGGATCGACCGGGACAGCTACCGGCGCATCCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATG         GGCAGCACGCTGAGGAAACGCAAGATGTACGAGGAGTT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215358 ATGGTG...CAGGGCAGCACGCTGAGGAAACGCAAGATGTACGAGGAGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCTCAGCAAGGTCTCCATCCTAG         AGTCCCTGGAGAAGTGGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 226976 CCTCAGCAAGGTCTCCATCCTAGGTC...CAGAGTCCCTGGAGAAGTGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AGCGTCTGACCGTGGCGGATGCGCTGGAGCCCGTCCAGTTTGAAGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232147 AGCGTCTGACCGTGGCGGATGCGCTGGAGCCCGTCCAGTTTGAAGATGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GAGAAAATTGTGGTCCAGGGAGAGCCTGGGGACGACTTTTACATCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232197 GAGAAAATTGTGGTCCAGGGAGAGCCTGGGGACGACTTTTACATCATCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGAG         GGCACCGCGTCCGTGCTGCAGCGCCGGTCCCCCAATG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232247 GGAGGTG...CAGGGCACCGCGTCCGTGCTGCAGCGCCGGTCCCCCAATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AGGAGTACGTGGAGGTGGGGCGCCTGGGACCCTCTGACTACTTCG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 260073 AGGAGTACGTGGAGGTGGGGCGCCTGGGACCCTCTGACTACTTCGGTG..

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974     GGGAGATTGCACTGCTGCTGAACCGGCCCCGGGCGGCCACTGTCGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 260123 .CAGGGGAGATTGCACTGCTGCTGAACCGGCCCCGGGCGGCCACTGTCGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GGCCCGGGGGCCCCTCAAGTGTGTGAAGCTGGACCGGCCCCGCTTCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 260950 GGCCCGGGGGCCCCTCAAGTGTGTGAAGCTGGACCGGCCCCGCTTCGAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GTGTGCTGGGGCCCTGCTCTGAGATCCTCAAGAGGAACATTCAGCGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261000 GTGTGCTGGGGCCCTGCTCTGAGATCCTCAAGAGGAACATTCAGCGTTAC

   1200     .    :    .    :
   1120 AACAGCTTCATCTCCCTCACCGTC
        ||||||||||||||||||||||||
 261050 AACAGCTTCATCTCCCTCACCGTC