seq1 = pF1KB5242.tfa, 1566 bp
seq2 = pF1KB5242/gi568815591r_150976728.tfa (gi568815591r:150976728_151180766), 204039 bp

>pF1KB5242 1566
>gi568815591r:150976728_151180766 (Chr7)

(complement)

1-82  (100001-100082)   100% ->
83-505  (100845-101267)   100% ->
506-604  (101746-101844)   100% ->
605-744  (102066-102205)   100% ->
745-958  (102675-102888)   100% ->
959-1118  (102987-103146)   100% ->
1119-1210  (103366-103457)   100% ->
1211-1346  (103531-103666)   100% ->
1347-1461  (103740-103854)   100% ->
1462-1566  (103935-104039)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGAGGCCGCGGGGGGAACCCGGCCCCCGGGCCCCGAGACCGACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGAGGCCGCGGGGGGAACCCGGCCCCCGGGCCCCGAGACCGACTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGAGCGACCTGCGCAGGGCCCGGGGAGTCAT         GGTCTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100051 GGGAGCGACCTGCGCAGGGCCCGGGGAGTCATGTA...CAGGGTCTCCAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CACCCAACTCCATGCTTCGAGTCCTGCTCTCTGCTCAGACCTCCCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100854 CACCCAACTCCATGCTTCGAGTCCTGCTCTCTGCTCAGACCTCCCCTGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGCTGTCTGGCCTGCTGCTGATCCCTCCAGTACAGCCCTGCTGTTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100904 CGGCTGTCTGGCCTGCTGCTGATCCCTCCAGTACAGCCCTGCTGTTTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCCCAGCAAATGGGGGGACCGGCCTGTTGGAGGAGGCCCCAGTGCAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100954 GCCCAGCAAATGGGGGGACCGGCCTGTTGGAGGAGGCCCCAGTGCAGGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGTGCAAGGACTGCAGCGGCTTCTGGAACAGGCGAAGAGCCCTGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101004 CTGTGCAAGGACTGCAGCGGCTTCTGGAACAGGCGAAGAGCCCTGGGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGCTGCGCTGGCTGGGCCAGAACCCCAGCAAGGTGCGCGCCCACCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101054 CTGCTGCGCTGGCTGGGCCAGAACCCCAGCAAGGTGCGCGCCCACCACTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTCGGTGGCGCTTCGTCGTCTGGGCCAGCTCTTGGGGTCTCGGCCACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101104 CTCGGTGGCGCTTCGTCGTCTGGGCCAGCTCTTGGGGTCTCGGCCACGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCCCTCCTGTGGAGCAGGTCACACTGCAGGACTTGAGTCAGCTCATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101154 CCCCTCCTGTGGAGCAGGTCACACTGCAGGACTTGAGTCAGCTCATCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CGAAACTGCCCCTCCTTTGACATTCACACCATCCACGTGTGTCTGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101204 CGAAACTGCCCCTCCTTTGACATTCACACCATCCACGTGTGTCTGCACCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGCAGTCTTACTTG         GCTTTCCATCTGATGGTCCCCTGGTGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 101254 TGCAGTCTTACTTGGTG...CAGGCTTTCCATCTGATGGTCCCCTGGTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GTGCCCTGGAACAGGAGCGAAGGCTCCGCCTCCCTCCGAAGCCACCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101773 GTGCCCTGGAACAGGAGCGAAGGCTCCGCCTCCCTCCGAAGCCACCTCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CCTTTGCAGCCCCTTCTCCGAG         AGGCAAGGCCAGAGGAACT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101823 CCTTTGCAGCCCCTTCTCCGAGGTG...CAGAGGCAAGGCCAGAGGAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GACTCCCCACGTGATGGTGCTCCTGGCCCAGCACCTGGCCCGGCACCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102085 GACTCCCCACGTGATGGTGCTCCTGGCCCAGCACCTGGCCCGGCACCGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGCGGGAGCCCCAGCTTCTGGAAGCCATTGCCCACTTCCTGGTGGTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102135 TGCGGGAGCCCCAGCTTCTGGAAGCCATTGCCCACTTCCTGGTGGTTCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GAAACGCAACTCAGCAGCAAG         GTGGTACAGAAGTTGGTCCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 102185 GAAACGCAACTCAGCAGCAAGGTG...CAGGTGGTACAGAAGTTGGTCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GCCCTTTGGGCGACTGAACTACCTGCCCCTGGAACAGCAGTTTATGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102695 GCCCTTTGGGCGACTGAACTACCTGCCCCTGGAACAGCAGTTTATGCCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GCCTTGAGAGGATCCTGGCTCGGGAAGCAGGGGTGGCACCCCTGGCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102745 GCCTTGAGAGGATCCTGGCTCGGGAAGCAGGGGTGGCACCCCTGGCTACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GTCAACATCTTGATGTCACTGTGCCAACTGCGGTGCCTGCCCTTCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102795 GTCAACATCTTGATGTCACTGTGCCAACTGCGGTGCCTGCCCTTCAGAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CCTGCACTTTGTTTTTTCCCCTGGCTTCATCAACTACATCAGTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 102845 CCTGCACTTTGTTTTTTCCCCTGGCTTCATCAACTACATCAGTGGTA...

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    959    GCACCCCTCATGCTCTGATTGTGCGTCGCTACCTCTCCCTGCTGGAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102984 CAGGCACCCCTCATGCTCTGATTGTGCGTCGCTACCTCTCCCTGCTGGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 ACGGCCGTGGAGCTGGAGCTCCCAGGATACCGGGGTCCCCGCCTTCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103034 ACGGCCGTGGAGCTGGAGCTCCCAGGATACCGGGGTCCCCGCCTTCCCCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 AAGGCAGCAAGTGCCCATCTTTCCCCAGCCTCTCATCACCGACCGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103084 AAGGCAGCAAGTGCCCATCTTTCCCCAGCCTCTCATCACCGACCGTGCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GCTGCAAGTACAG         TCACAAGGACATAGTAGCTGAGGGGTTG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 103134 GCTGCAAGTACAGGTG...CAGTCACAAGGACATAGTAGCTGAGGGGTTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CGCCAGCTGCTGGGGGAGGAGAAATACCGCCAGGACCTGACTGTGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103394 CGCCAGCTGCTGGGGGAGGAGAAATACCGCCAGGACCTGACTGTGCCTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 AGGCTACTGCACAG         ACTTCCTGCTGTGCGCCAGCAGCTCTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 103444 AGGCTACTGCACAGGTG...CAGACTTCCTGCTGTGCGCCAGCAGCTCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GTGCTGTGCTTCCCGTGAGGACCCAGGACCCCTTCCTGCCATACCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103558 GTGCTGTGCTTCCCGTGAGGACCCAGGACCCCTTCCTGCCATACCCACCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 AGGTCCTGCCCACAGGGCCAGGCTGCCTCTAGCGCCACTACTCGAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103608 AGGTCCTGCCCACAGGGCCAGGCTGCCTCTAGCGCCACTACTCGAGACCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 TGCCCAGAG         GGTGGTGCTGGTGTTGCGGGAACGCTGGCATT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 103658 TGCCCAGAGGTA...CAGGGTGGTGCTGGTGTTGCGGGAACGCTGGCATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TCTGCCGGGACGGCCGGGTGCTGCTGGGCTCGAGGGCCCTGAGGGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103772 TCTGCCGGGACGGCCGGGTGCTGCTGGGCTCGAGGGCCCTGAGGGAGCGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CACCTAGGCCTGATGGGCTACCAGCTCCTGCCG         CTACCCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 103822 CACCTAGGCCTGATGGGCTACCAGCTCCTGCCGGTG...CAGCTACCCTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CGAGGAACTGGAGTCCCAGAGAGGCCTGCCCCAGCTCAAGAGCTACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103943 CGAGGAACTGGAGTCCCAGAGAGGCCTGCCCCAGCTCAAGAGCTACCTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1520 GGCAGAAGCTCCAGGCCCTGGGCCTGCGCTGGGGGCCTGAAGGGGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103993 GGCAGAAGCTCCAGGCCCTGGGCCTGCGCTGGGGGCCTGAAGGGGGC