seq1 = pF1KB5241.tfa, 1434 bp
seq2 = pF1KB5241/gi568815588f_89302279.tfa (gi568815588f:89302279_89503709), 201431 bp

>pF1KB5241 1434
>gi568815588f:89302279_89503709 (Chr10)

1-1434  (99999-101431)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTACAAATGGTGATGATCATCAGGTCAAGGATAGTCTGGAGCAATT
        | -|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99999 AC AGTACAAATGGTGATGATCATCAGGTCAAGGATAGTCTGGAGCAATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGATGTCACTTTACATGGGAGTTATCCATTGATGACGATGAAATGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100048 GAGATGTCACTTTACATGGGAGTTATCCATTGATGACGATGAAATGCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATTTAGAAAACAGAGTCTTGGATCAGATTGAATTCCTAGACACCAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100098 ATTTAGAAAACAGAGTCTTGGATCAGATTGAATTCCTAGACACCAAATAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGTGTGGGAATACACAACCTACTAGCCTATGTGAAACACCTGAAAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100148 AGTGTGGGAATACACAACCTACTAGCCTATGTGAAACACCTGAAAGGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAATGAGGAAGCCCTGAAGAGCTTAAAAGAAGCTGAAAACTTAATGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100198 GAATGAGGAAGCCCTGAAGAGCTTAAAAGAAGCTGAAAACTTAATGCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAGAACATGACAACCAAGCAAATGTGAGGAGTCTGGTGACCTGGGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100248 AAGAACATGACAACCAAGCAAATGTGAGGAGTCTGGTGACCTGGGGCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTGCCTGGATGTATTACCACATGGGCAGACTGGCAGAAGCCCAGACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100298 TTTGCCTGGATGTATTACCACATGGGCAGACTGGCAGAAGCCCAGACTTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTGGACAAGGTGGAGAACATTTGCAAGAAGCTTTCAAATCCCTTCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100348 CCTGGACAAGGTGGAGAACATTTGCAAGAAGCTTTCAAATCCCTTCCGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATAGAATGGAGTGTCCAGAAATAGACTGTGAGGAAGGATGGGCCTTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100398 ATAGAATGGAGTGTCCAGAAATAGACTGTGAGGAAGGATGGGCCTTGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGTGTGGAGGAAAGAATTATGAACGGGCCAAGGCCTGCTTTGAAAAGGT
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100448 AAGTGTGGAGGAAAAAATTATGAACGGGCCAAGGCCTGCTTTGAAAAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCTTGAAGTGGACCCTGAAAACCCTGAATCCAGCGCTGGGTATGCGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100498 GCTTGAAGTGGACCCTGAAAACCCTGAATCCAGCGCTGGGTATGCGATCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGCCTATCGCCTGGATGGCTTTAAATTAGCCACAAAAAATCACAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100548 CTGCCTATCGCCTGGATGGCTTTAAATTAGCCACAAAAAATCACAAGCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTTTCTTTGCTTCCCCTAAGGCAGGCTGTCCGCTTAAATCCAGACAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100598 TTTTCTTTGCTTCCCCTAAGGCAGGCTGTCCGCTTAAATCCAGACAATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ATATATTAAGGTTCTCCTTGCCCTGAAGCTTCAGGATGAAGGACAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100648 ATATATTAAGGTTCTCCTTGCCCTGAAGCTTCAGGATGAAGGACAGGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTGAAGGAGAAAAGTACATTGAAGAAGCTCTAGCCAACATGTCCTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100698 CTGAAGGAGAAAAGTACATTGAAGAAGCTCTAGCCAACATGTCCTCACAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ACCTATGTCTTTCGATATGCAGCCAAGTTTTACCGAAGAAAAGGCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100748 ACCTATGTCTTTCGATATGCAGCCAAGTTTTACCGAAGAAAAGGCTCTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGATAAAGCTCTTGAGTTATTAAAAAAGGCCTTGCAGGAAACACCCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100798 GGATAAAGCTCTTGAGTTATTAAAAAAGGCCTTGCAGGAAACACCCACTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTGTCTTACTGCATCACCAGATAGGGCTTTGCTACAAGGCACAAATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100848 CTGTCTTACTGCATCACCAGATAGGGCTTTGCTACAAGGCACAAATGATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CAAATCAAGGAGGCTACAAAAGGGCAGCCTAGAGGGCAGAACAGAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100898 CAAATCAAGGAGGCTACAAAAGGGCAGCCTAGAGGGCAGAACAGAGAAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCTAGACAAAATGATAAGATCAGCCATATTTCATTTTGAATCTGCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100948 GCTAGACAAAATGATAAGATCAGCCATATTTCATTTTGAATCTGCAGTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AAAAAAAGCCCACATTTGAGGTGGCTCATCTAGACCTGGCAAGAATGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100998 AAAAAAAGCCCACATTTGAGGTGGCTCATCTAGACCTGGCAAGAATGTAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 ATAGAAGCAGGCAATCACAGAAAAGCTGAAGAGAATTTTCAAAAATTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101048 ATAGAAGCAGGCAATCACAGAAAAGCTGAAGAGAATTTTCAAAAATTGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 ATGCATGAAACCAGTGGTAGAAGAAACAATGCAAGACATACATTTCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101098 ATGCATGAAACCAGTGGTAGAAGAAACAATGCAAGACATACATTTCCACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ATGGTCGGTTTCAGGAATTTCAAAAGAAATCTGACGTCAATGCAATTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101148 ATGGTCGGTTTCAGGAATTTCAAAAGAAATCTGACGTCAATGCAATTATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CATTATTTAAAAGCTATAAAAATAGAACAGGCATCATTAACAAGGGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101198 CATTATTTAAAAGCTATAAAAATAGAACAGGCATCATTAACAAGGGATAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 AAGTATCAATTCTTTGAAGAAATTGGTTTTAAGGAAACTTCGGAGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101248 AAGTATCAATTCTTTGAAGAAATTGGTTTTAAGGAAACTTCGGAGAAAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CATTAGATCTGGAAAGCTTGAGCCTCCTTGGGTTCGTCTACAAATTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101298 CATTAGATCTGGAAAGCTTGAGCCTCCTTGGGTTCGTCTACAAATTGGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GGAAATATGAATGAAGCCCTGGAGTACTATGAGCGGGCCCTGAGACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101348 GGAAATATGAATGAAGCCCTGGAGTACTATGAGCGGGCCCTGAGACTGGC

   1400     .    :    .    :    .    :
   1401 TGCTGACTTTGAGAACTCTGTGAGACAAGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101398 TGCTGACTTTGAGAACTCTGTGAGACAAGGTCCT