seq1 = pF1KB5237.tfa, 885 bp
seq2 = pF1KB5237/gi568815597r_94430463.tfa (gi568815597r:94430463_94641636), 211174 bp

>pF1KB5237 885
>gi568815597r:94430463_94641636 (Chr1)

(complement)

1-100  (100001-100100)   100% ->
101-212  (101269-101380)   100% ->
213-412  (105473-105672)   100% ->
413-591  (108369-108547)   100% ->
592-751  (109157-109316)   100% ->
752-885  (111041-111174)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGACCCCTGCCTGGCCCCGGGTCCCGCGCCCCGAGACCGCCGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGACCCCTGCCTGGCCCCGGGTCCCGCGCCCCGAGACCGCCGTCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCGGACGCTCCTGCTCGGCTGGGTCTTCGCCCAGGTGGCCGGCGCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCGGACGCTCCTGCTCGGCTGGGTCTTCGCCCAGGTGGCCGGCGCTTCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          GCACTACAAATACTGTGGCAGCATATAATTTAACTTGGAAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTG...AAGGCACTACAAATACTGTGGCAGCATATAATTTAACTTGGAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCAACTAATTTCAAGACAATTTTGGAGTGGGAACCCAAACCCGTCAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101310 TCAACTAATTTCAAGACAATTTTGGAGTGGGAACCCAAACCCGTCAATCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTCTACACTGTTCAAATAAG         CACTAAGTCAGGAGATTGGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 101360 AGTCTACACTGTTCAAATAAGGTA...TAGCACTAAGTCAGGAGATTGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAAGCAAATGCTTTTACACAACAGACACAGAGTGTGACCTCACCGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105493 AAAGCAAATGCTTTTACACAACAGACACAGAGTGTGACCTCACCGACGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATTGTGAAGGATGTGAAGCAGACGTACTTGGCACGGGTCTTCTCCTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105543 ATTGTGAAGGATGTGAAGCAGACGTACTTGGCACGGGTCTTCTCCTACCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGCAGGGAATGTGGAGAGCACCGGTTCTGCTGGGGAGCCTCTGTATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105593 GGCAGGGAATGTGGAGAGCACCGGTTCTGCTGGGGAGCCTCTGTATGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACTCCCCAGAGTTCACACCTTACCTGGAGA         CAAACCTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 105643 ACTCCCCAGAGTTCACACCTTACCTGGAGAGTA...CAGCAAACCTCGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAGCCAACAATTCAGAGTTTTGAACAGGTGGGAACAAAAGTGAATGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108380 CAGCCAACAATTCAGAGTTTTGAACAGGTGGGAACAAAAGTGAATGTGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CGTAGAAGATGAACGGACTTTAGTCAGAAGGAACAACACTTTCCTAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108430 CGTAGAAGATGAACGGACTTTAGTCAGAAGGAACAACACTTTCCTAAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCGGGATGTTTTTGGCAAGGACTTAATTTATACACTTTATTATTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108480 TCCGGGATGTTTTTGGCAAGGACTTAATTTATACACTTTATTATTGGAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCTTCAAGTTCAGGAAAG         AAAACAGCCAAAACAAACACTAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 108530 TCTTCAAGTTCAGGAAAGGTG...CAGAAAACAGCCAAAACAAACACTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGAGTTTTTGATTGATGTGGATAAAGGAGAAAACTACTGTTTCAGTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109180 TGAGTTTTTGATTGATGTGGATAAAGGAGAAAACTACTGTTTCAGTGTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAGCAGTGATTCCCTCCCGAACAGTTAACCGGAAGAGTACAGACAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109230 AAGCAGTGATTCCCTCCCGAACAGTTAACCGGAAGAGTACAGACAGCCCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTAGAGTGTATGGGCCAGGAGAAAGGGGAATTCAGAG         AAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 109280 GTAGAGTGTATGGGCCAGGAGAAAGGGGAATTCAGAGGTG...CAGAAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ATTCTACATCATTGGAGCTGTGGTATTTGTGGTCATCATCCTTGTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111045 ATTCTACATCATTGGAGCTGTGGTATTTGTGGTCATCATCCTTGTCATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCCTGGCTATATCTCTACACAAGTGTAGAAAGGCAGGAGTGGGGCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111095 TCCTGGCTATATCTCTACACAAGTGTAGAAAGGCAGGAGTGGGGCAGAGC

    900     .    :    .    :    .    :
    856 TGGAAGGAGAACTCCCCACTGAATGTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 111145 TGGAAGGAGAACTCCCCACTGAATGTTTCA