seq1 = pF1KB5232.tfa, 1506 bp
seq2 = pF1KB5232/gi568815597r_59793654.tfa (gi568815597r:59793654_60026746), 233093 bp

>pF1KB5232 1506
>gi568815597r:59793654_60026746 (Chr1)

(complement)

1-210  (100001-100210)   100% ->
211-373  (110647-110809)   100% ->
374-523  (114436-114585)   100% ->
524-684  (114979-115139)   100% ->
685-861  (116787-116963)   100% ->
862-1003  (118820-118961)   100% ->
1004-1191  (121689-121876)   100% ->
1192-1330  (125644-125782)   100% ->
1331-1506  (132918-133093)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCGCGGCGATGGGCTCTCTGGCGGCTGCCCTCTGGGCAGTGGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTCGCGGCGATGGGCTCTCTGGCGGCTGCCCTCTGGGCAGTGGTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCTCGGACTCTCCTACTGGGCACTGTCGCCTTTCTGCTCGCTGCTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCTCGGACTCTCCTACTGGGCACTGTCGCCTTTCTGCTCGCTGCTGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCTCAAAAGACGGCGCCCAAAGAACTACCCGCCGGGGCCCTGGCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTCTCAAAAGACGGCGCCCAAAGAACTACCCGCCGGGGCCCTGGCGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCTTCCTTGGCAACTTCTTCCTTGTGGACTTCGAGCAGTCGCACCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCTTCCTTGGCAACTTCTTCCTTGTGGACTTCGAGCAGTCGCACCTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGTTCAGCTG         TTTGTGAAGAAATATGGGAACCTTTTTAGCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGTTCAGCTGGTA...CAGTTTGTGAAGAAATATGGGAACCTTTTTAGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGAGCTTGGTGACATATCTGCAGTTCTTATTACTGGCTTGCCCTTAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110678 TGGAGCTTGGTGACATATCTGCAGTTCTTATTACTGGCTTGCCCTTAATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAAGAAGCCCTTATCCACATGGACCAAAACTTTGGGAACCGCCCCGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110728 AAAGAAGCCCTTATCCACATGGACCAAAACTTTGGGAACCGCCCCGTGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCCTATGCGAGAACATATCTTTAAGAAAAATG         GATTGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 110778 CCCTATGCGAGAACATATCTTTAAGAAAAATGGTA...CAGGATTGATTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGTCAAGTGGCCAGGCATGGAAGGAGCAAAGAAGGTTCACTCTGACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114445 TGTCAAGTGGCCAGGCATGGAAGGAGCAAAGAAGGTTCACTCTGACAGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTAAGGAACTTTGGTTTAGGAAAGAAGAGCTTAGAGGAACGCATTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114495 CTAAGGAACTTTGGTTTAGGAAAGAAGAGCTTAGAGGAACGCATTCAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGAGGCCCAACACCTCACTGAAGCAATAAAAGAGGAGAACG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 114545 GGAGGCCCAACACCTCACTGAAGCAATAAAAGAGGAGAACGGTG...CAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GACAGCCTTTTGACCCTCATTTCAAGATCAACAATGCAGTTTCCAATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114979 GACAGCCTTTTGACCCTCATTTCAAGATCAACAATGCAGTTTCCAATATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATTTGCTCCATCACCTTCGGAGAACGCTTTGAGTACCAGGATAGTTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115029 ATTTGCTCCATCACCTTCGGAGAACGCTTTGAGTACCAGGATAGTTGGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TCAGCAGCTGCTGAAGTTACTAGATGAAGTCACATACTTGGAGGCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115079 TCAGCAGCTGCTGAAGTTACTAGATGAAGTCACATACTTGGAGGCTTCAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGACATGCCAG         CTCTACAATGTCTTTCCATGGATAATGAAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 115129 AGACATGCCAGGTA...TAGCTCTACAATGTCTTTCCATGGATAATGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TTCCTGCCTGGACCCCACCAAACTCTCTTCAGCAACTGGAAAAAACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116817 TTCCTGCCTGGACCCCACCAAACTCTCTTCAGCAACTGGAAAAAACTGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 ATTGTTTGTTTCTCATATGATTGACAAACACAGAAAGGATTGGAATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116867 ATTGTTTGTTTCTCATATGATTGACAAACACAGAAAGGATTGGAATCCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CAGAAACAAGAGACTTTATTGATGCTTACCTTAAAGAAATGTCAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 116917 CAGAAACAAGAGACTTTATTGATGCTTACCTTAAAGAAATGTCAAAGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    862       CACACAGGCAATCCTACTTCAAGTTTCCATGAAGAAAACCTCAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116967 ...TAGCACACAGGCAATCCTACTTCAAGTTTCCATGAAGAAAACCTCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CTGCAGCACCCTGGACCTCTTCTTTGCCGGAACCGAGACAACTTCCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118864 CTGCAGCACCCTGGACCTCTTCTTTGCCGGAACCGAGACAACTTCCACAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CTCTGCGATGGGCTCTGCTTTATATGGCCCTCTACCCAGAAATCCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 118914 CTCTGCGATGGGCTCTGCTTTATATGGCCCTCTACCCAGAAATCCAAGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1004        AAAAAGTACAAGCTGAGATTGACAGAGTGATTGGCCAGGGGCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118964 G...CAGAAAAAGTACAAGCTGAGATTGACAGAGTGATTGGCCAGGGGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GCAGCCGAGCACAGCCGCCCGGGAGTCCATGCCCTACACCAATGCTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121732 GCAGCCGAGCACAGCCGCCCGGGAGTCCATGCCCTACACCAATGCTGTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TCCATGAGGTGCAGAGAATGGGCAACATCATCCCCCTGAACGTTCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121782 TCCATGAGGTGCAGAGAATGGGCAACATCATCCCCCTGAACGTTCCCAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GAAGTGACAGTTGATACCACTTTGGCTGGGTACCACCTGCCCAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 121832 GAAGTGACAGTTGATACCACTTTGGCTGGGTACCACCTGCCCAAGGTA..

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192     GGTACCATGATCCTGACCAATTTGACGGCGCTGCACAGGGACCCCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121882 .TAGGGTACCATGATCCTGACCAATTTGACGGCGCTGCACAGGGACCCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CAGAGTGGGCCACCCCTGACACATTCAATCCGGACCATTTTCTGGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125690 CAGAGTGGGCCACCCCTGACACATTCAATCCGGACCATTTTCTGGAGAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GGACAGTTTAAGAAAAGGGAAGCCTTTATGCCTTTCTCAATAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 125740 GGACAGTTTAAGAAAAGGGAAGCCTTTATGCCTTTCTCAATAGGTA...C

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1331   GAAAGCGGGCATGCCTCGGAGAACAGTTGGCCAGGACTGAGCTGTTTA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132916 AGGAAAGCGGGCATGCCTCGGAGAACAGTTGGCCAGGACTGAGCTGTTTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TTTTCTTCACTTCCCTTATGCAAAAATTTACCTTCAGGCCCCCAAACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132966 TTTTCTTCACTTCCCTTATGCAAAAATTTACCTTCAGGCCCCCAAACAAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 GAGAAGCTGAGCCTGAAGTTTAGAATGGGTATCACCATTTCCCCAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133016 GAGAAGCTGAGCCTGAAGTTTAGAATGGGTATCACCATTTCCCCAGTCAG

   1550     .    :    .    :    .
   1479 TCACCGCCTCTGCGCTGTTCCTCAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 133066 TCACCGCCTCTGCGCTGTTCCTCAGGTG