seq1 = pF1KB5210.tfa, 984 bp
seq2 = pF1KB5210/gi568815586r_113292944.tfa (gi568815586r:113292944_113499708), 206765 bp

>pF1KB5210 984
>gi568815586r:113292944_113499708 (Chr12)

(complement)

1-153  (100001-100153)   100% ->
154-193  (100558-100597)   100% ->
194-333  (100863-101002)   100% ->
334-425  (101103-101194)   100% ->
426-653  (102317-102544)   100% ->
654-778  (105693-105817)   100% ->
779-984  (106560-106765)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGTCTGGAGAACCCCTGCACGTGAAGACCCCCATCCGTGACAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGTCTGGAGAACCCCTGCACGTGAAGACCCCCATCCGTGACAGCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCTGTCCAAAATGGCCGGCACCAGCGTCTACCTCAAGATGGACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCCTGTCCAAAATGGCCGGCACCAGCGTCTACCTCAAGATGGACAGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCAGCCCTCCGGCTCCTTCAAGATCCGGGGCATTGGGCACTTCTGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCAGCCCTCCGGCTCCTTCAAGATCCGGGGCATTGGGCACTTCTGCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGG         TGGGCCAAGCAAGGCTGTGCACATTTTGTCTGCTCCTC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGGGTA...CAGTGGGCCAAGCAAGGCTGTGCACATTTTGTCTGCTCCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GG         CGGGCAACGCAGGCATGGCGGCTGCATATGCGGCCAGGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100596 GGGTA...CAGCGGGCAACGCAGGCATGGCGGCTGCATATGCGGCCAGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AACTCGGCGTCCCCGCCACCATCGTGGTGCCCAGCACCACACCTGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100902 AACTCGGCGTCCCCGCCACCATCGTGGTGCCCAGCACCACACCTGCTCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACCATTGAGCGCCTCAAGAATGAAGGTGCCACAGTCAAGGTGGTGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100952 ACCATTGAGCGCCTCAAGAATGAAGGTGCCACAGTCAAGGTGGTGGGTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 G         TTATTGGATGAAGCCTTCGAGCTGGCCAAGGCCCTAGCGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101002 GGTG...CAGTTATTGGATGAAGCCTTCGAGCTGGCCAAGGCCCTAGCGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGAACAACCCGGGTTGGGTCTACATTCCCCCCTTTGATGACCCCCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101143 AGAACAACCCGGGTTGGGTCTACATTCCCCCCTTTGATGACCCCCTCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TG         GGAAGGCCACGCTTCCATCGTGAAAGAGCTGAAGGAGAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101193 TGGTA...CAGGGAAGGCCACGCTTCCATCGTGAAAGAGCTGAAGGAGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ACTGTGGGAAAAGCCGGGGGCCATCGCGCTGTCAGTGGGCGGCGGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102356 ACTGTGGGAAAAGCCGGGGGCCATCGCGCTGTCAGTGGGCGGCGGGGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGCTGTGTGGAGTGGTCCAGGGGCTGCAGGAGGTGGGCTGGGGGGACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102406 TGCTGTGTGGAGTGGTCCAGGGGCTGCAGGAGGTGGGCTGGGGGGACGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCTGTCATCGCCATGGAGACTTTTGGTGCCCACAGCTTCCACGCTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102456 CCTGTCATCGCCATGGAGACTTTTGGTGCCCACAGCTTCCACGCTGCCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CACCGCAGGCAAACTTGTCTCCCTGCCCAAGATCACCAG         TG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102506 CACCGCAGGCAAACTTGTCTCCCTGCCCAAGATCACCAGGTG...CAGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTGCCAAGGCCCTGGGCGTGAAGACTGTGGGGGCTCAGGCCCTGAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105695 TTGCCAAGGCCCTGGGCGTGAAGACTGTGGGGGCTCAGGCCCTGAAGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TTTCAGGAACACCCCATTTTCTCTGAAGTTATCTCGGACCAGGAGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105745 TTTCAGGAACACCCCATTTTCTCTGAAGTTATCTCGGACCAGGAGGCTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGCCGCCATTGAGAAGTTCGTGG         ATGATGAGAAGATCCTGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 105795 GGCCGCCATTGAGAAGTTCGTGGGTA...CAGATGATGAGAAGATCCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGGAGCCCGCCTGCGGGGCAGCCCTGGCCGCTGTCTATAGCCACGTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106578 TGGAGCCCGCCTGCGGGGCAGCCCTGGCCGCTGTCTATAGCCACGTGATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAGAAGCTCCAACTGGAGGGGAATCTCCGAACCCCGCTGCCATCCCTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106628 CAGAAGCTCCAACTGGAGGGGAATCTCCGAACCCCGCTGCCATCCCTCGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGTCATCGTCTGCGGGGGCAGCAACATCAGCCTGGCCCAGCTGCGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106678 GGTCATCGTCTGCGGGGGCAGCAACATCAGCCTGGCCCAGCTGCGGGCGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .
    947 TCAAGGAACAGCTGGGCATGACAAATAGGTTGCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106728 TCAAGGAACAGCTGGGCATGACAAATAGGTTGCCCAAG