seq1 = pF1KB5209.tfa, 1581 bp
seq2 = pF1KB5209/gi568815588r_71718616.tfa (gi568815588r:71718616_71951221), 232606 bp

>pF1KB5209 1581
>gi568815588r:71718616_71951221 (Chr10)

(complement)

1-40  (100001-100040)   100% ->
41-174  (116717-116850)   100% ->
175-249  (119302-119376)   100% ->
250-375  (119971-120096)   100% ->
376-576  (122145-122345)   100% ->
577-720  (123065-123208)   100% ->
721-786  (125329-125389)   92% ->
787-918  (129215-129346)   100% ->
919-1014  (130887-130982)   100% ->
1015-1201  (131322-131508)   100% ->
1202-1359  (131600-131757)   100% ->
1360-1440  (132111-132191)   100% ->
1441-1548  (132498-132605)   100% ->
1549-1581  (133746-133778)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACGCCCTCTTCCTCCTGGCCAGCCTCCTGGGCGCGG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100001 ATGTACGCCCTCTTCCTCCTGGCCAGCCTCCTGGGCGCGGGTA...TAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TCTAGCCGGCCCGGTCCTTGGACTGAAAGAATGCACCAGGGGCTCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116718 TCTAGCCGGCCCGGTCCTTGGACTGAAAGAATGCACCAGGGGCTCGGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTGGTGCCAGAATGTGAAGACGGCGTCCGACTGCGGGGCAGTGAAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116768 TGTGGTGCCAGAATGTGAAGACGGCGTCCGACTGCGGGGCAGTGAAGCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGCCTGCAGACCGTTTGGAACAAGCCAACAGTG         AAATCCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 116818 TGCCTGCAGACCGTTTGGAACAAGCCAACAGTGGTG...TAGAAATCCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCCCTGCGACATATGCAAAGACGTTGTCACCGCAGCTGGTGATATGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119310 TCCCTGCGACATATGCAAAGACGTTGTCACCGCAGCTGGTGATATGCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGACAATGCCACTGAG         GAGGAGATCCTTGTTTACTTGGAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 119360 AGGACAATGCCACTGAGGTG...TAGGAGGAGATCCTTGTTTACTTGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAGACCTGTGACTGGCTTCCGAAACCGAACATGTCTGCTTCATGCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119995 AAGACCTGTGACTGGCTTCCGAAACCGAACATGTCTGCTTCATGCAAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GATAGTGGACTCCTACCTCCCTGTCATCCTGGACATCATTAAAGGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120045 GATAGTGGACTCCTACCTCCCTGTCATCCTGGACATCATTAAAGGAGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TG         AGCCGTCCTGGGGAGGTGTGCTCTGCTCTCAACCTCTGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120095 TGGTA...CAGAGCCGTCCTGGGGAGGTGTGCTCTGCTCTCAACCTCTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAGTCTCTCCAGAAGCACCTAGCAGAGCTGAATCACCAGAAGCAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122184 GAGTCTCTCCAGAAGCACCTAGCAGAGCTGAATCACCAGAAGCAGCTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GTCCAATAAGATCCCAGAGCTGGACATGACTGAGGTGGTGGCCCCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122234 GTCCAATAAGATCCCAGAGCTGGACATGACTGAGGTGGTGGCCCCCTTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGCCAACATCCCTCTCCTCCTCTACCCTCAGGACGGCCCCCGCAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122284 TGGCCAACATCCCTCTCCTCCTCTACCCTCAGGACGGCCCCCGCAGCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCCCAGCCAAAG         GATAATGGGGACGTTTGCCAGGACTGCAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 122334 CCCCAGCCAAAGGTA...TAGGATAATGGGGACGTTTGCCAGGACTGCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCAGATGGTGACTGACATCCAGACTGCTGTACGGACCAACTCCACCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123094 TCAGATGGTGACTGACATCCAGACTGCTGTACGGACCAACTCCACCTTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCCAGGCCTTGGTGGAACATGTCAAGGAGGAGTGTGACCGCCTGGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123144 TCCAGGCCTTGGTGGAACATGTCAAGGAGGAGTGTGACCGCCTGGGCCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GGCATGGCCGACATA         TGCAAGAACTATATCAGCCAGTATTC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 123194 GGCATGGCCGACATAGTG...CAGTGCAAGAACTATATCAGCCAGTATTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGAAATTGCTATCCAGATGATGATGCACATGCAGGATCAG         C
        |||||||||||||||||||||||||||||||--|--|-||>>>...>>>|
 125355 TGAAATTGCTATCCAGATGATGATGCACATG  G  T AGGTG...CAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AACCCAAGGAGATCTGTGCGCTGGTTGGGTTCTGTGATGAGGTGAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129216 AACCCAAGGAGATCTGTGCGCTGGTTGGGTTCTGTGATGAGGTGAAAGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ATGCCCATGCAGACTCTGGTCCCCGCCAAAGTGGCCTCCAAGAATGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129266 ATGCCCATGCAGACTCTGGTCCCCGCCAAAGTGGCCTCCAAGAATGTCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CCCTGCCCTGGAACTGGTGGAGCCCATTAAG         AAGCACGAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 129316 CCCTGCCCTGGAACTGGTGGAGCCCATTAAGGTA...CAGAAGCACGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TCCCAGCAAAGTCTGATGTTTACTGTGAGGTGTGTGAATTCCTGGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130897 TCCCAGCAAAGTCTGATGTTTACTGTGAGGTGTGTGAATTCCTGGTGAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GAGGTGACCAAGCTGATTGACAACAACAAGACTGAG         AAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 130947 GAGGTGACCAAGCTGATTGACAACAACAAGACTGAGGTA...CAGAAAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AATACTCGACGCTTTTGACAAAATGTGCTCGAAGCTGCCGAAGTCCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131327 AATACTCGACGCTTTTGACAAAATGTGCTCGAAGCTGCCGAAGTCCCTGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CGGAAGAGTGCCAGGAGGTGGTGGACACGTACGGCAGCTCCATCCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131377 CGGAAGAGTGCCAGGAGGTGGTGGACACGTACGGCAGCTCCATCCTGTCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 ATCCTGCTGGAGGAGGTCAGCCCTGAGCTGGTGTGCAGCATGCTGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131427 ATCCTGCTGGAGGAGGTCAGCCCTGAGCTGGTGTGCAGCATGCTGCACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CTGCTCTGGCACGCGGCTGCCTGCACTGACCG         TTCACGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 131477 CTGCTCTGGCACGCGGCTGCCTGCACTGACCGGTG...TAGTTCACGTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CTCAGCCAAAGGACGGTGGCTTCTGCGAAGTGTGCAAGAAGCTGGTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131609 CTCAGCCAAAGGACGGTGGCTTCTGCGAAGTGTGCAAGAAGCTGGTGGGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TATTTGGATCGCAACCTGGAGAAAAACAGCACCAAGCAGGAGATCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131659 TATTTGGATCGCAACCTGGAGAAAAACAGCACCAAGCAGGAGATCCTGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TGCTCTTGAGAAAGGCTGCAGCTTCCTGCCAGACCCTTACCAGAAGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 131709 TGCTCTTGAGAAAGGCTGCAGCTTCCTGCCAGACCCTTACCAGAAGCAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1360         TGTGATCAGTTTGTGGCAGAGTACGAGCCCGTGCTGATCGAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131759 TA...TAGTGTGATCAGTTTGTGGCAGAGTACGAGCCCGTGCTGATCGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 ATCCTGGTGGAGGTGATGGATCCTTCCTTCGTGTGCTTG         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 132153 ATCCTGGTGGAGGTGATGGATCCTTCCTTCGTGTGCTTGGTG...TAGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 AATTGGAGCCTGCCCCTCGGCCCATAAGCCCTTGTTGGGAACTGAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132500 AATTGGAGCCTGCCCCTCGGCCCATAAGCCCTTGTTGGGAACTGAGAAGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 GTATATGGGGCCCAAGCTACTGGTGCCAGAACACAGAGACAGCAGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132550 GTATATGGGGCCCAAGCTACTGGTGCCAGAACACAGAGACAGCAGCCCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1543 TGCAAT         GCTGTCGAGCATTGCAAACGCCATGTGTGGAAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 132600 TGCAATGTG...CAGGCTGTCGAGCATTGCAAACGCCATGTGTGGAAC