seq1 = pF1KB5207.tfa, 1587 bp
seq2 = pF1KB5207/gi568815586r_56538326.tfa (gi568815586r:56538326_56745963), 207638 bp

>pF1KB5207 1587
>gi568815586r:56538326_56745963 (Chr12)

(complement)

1-127  (100001-100127)   100% ->
128-310  (100611-100793)   100% ->
311-485  (101009-101183)   100% ->
486-607  (102006-102127)   100% ->
608-792  (102377-102561)   100% ->
793-951  (103133-103291)   100% ->
952-1074  (103384-103506)   100% ->
1075-1287  (105772-105984)   100% ->
1288-1489  (106657-106858)   100% ->
1490-1587  (107541-107638)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGGGGTTTGTGGGTCGGGTGGCCGCTGCTCCGGCCTCCGGGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGGGGTTTGTGGGTCGGGTGGCCGCTGCTCCGGCCTCCGGGGCCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGGAGACTCACCCCTTCAGCGTCGCTGCCCCCAGCTCAGCTCTTACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGGAGACTCACCCCTTCAGCGTCGCTGCCCCCAGCTCAGCTCTTACTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGCCGCTCCGACGGCGGTCCATCCTG         TCAGGGACTATGCG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100101 GGGCCGCTCCGACGGCGGTCCATCCTGGTA...TAGTCAGGGACTATGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCGCAAACATCTCCTTCGCCAAAAGCAGGCGCCGCCACCGGGCGCATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100625 GCGCAAACATCTCCTTCGCCAAAAGCAGGCGCCGCCACCGGGCGCATCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCGGTCATTGGCGCAGTGGTGGACGTCCAGTTTGATGAGGGACTACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100675 GGCGGTCATTGGCGCAGTGGTGGACGTCCAGTTTGATGAGGGACTACCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAATTCTAAATGCCCTGGAAGTGCAAGGCAGGGAGACCAGACTGGTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100725 CAATTCTAAATGCCCTGGAAGTGCAAGGCAGGGAGACCAGACTGGTTTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGGTGGCCCAGCATTTGG         GTGAGAGCACAGTAAGGACTAT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100775 GAGGTGGCCCAGCATTTGGGTA...CAGGTGAGAGCACAGTAAGGACTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCTATGGATGGTACAGAAGGCTTGGTTAGAGGCCAGAAAGTACTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101031 TGCTATGGATGGTACAGAAGGCTTGGTTAGAGGCCAGAAAGTACTGGATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGGTGCACCAATCAAAATTCCTGTTGGTCCTGAGACTTTGGGCAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101081 CTGGTGCACCAATCAAAATTCCTGTTGGTCCTGAGACTTTGGGCAGAATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATGAATGTCATTGGAGAACCTATTGATGAAAGAGGTCCCATCAAAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101131 ATGAATGTCATTGGAGAACCTATTGATGAAAGAGGTCCCATCAAAACCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ACA         ATTTGCTCCCATTCATGCTGAGGCTCCAGAGTTCATGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101181 ACAGTA...CAGATTTGCTCCCATTCATGCTGAGGCTCCAGAGTTCATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAATGAGTGTTGAGCAGGAAATTCTGGTGACTGGTATCAAGGTTGTCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102044 AAATGAGTGTTGAGCAGGAAATTCTGGTGACTGGTATCAAGGTTGTCGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGCTAGCTCCCTATGCCAAGGGTGGCAAAATTG         GGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 102094 CTGCTAGCTCCCTATGCCAAGGGTGGCAAAATTGGTA...TAGGGCTTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGGTGGTGCTGGAGTTGGCAAGACTGTACTGATCATGGAGTTAATCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102384 TGGTGGTGCTGGAGTTGGCAAGACTGTACTGATCATGGAGTTAATCAACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATGTCGCCAAAGCCCATGGTGGTTACTCTGTGTTTGCTGGTGTTGGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102434 ATGTCGCCAAAGCCCATGGTGGTTACTCTGTGTTTGCTGGTGTTGGTGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AGGACCCGTGAAGGCAATGATTTATACCATGAAATGATTGAATCTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102484 AGGACCCGTGAAGGCAATGATTTATACCATGAAATGATTGAATCTGGTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TATCAACTTAAAAGATGCCACCTCTAAG         GTAGCGCTGGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102534 TATCAACTTAAAAGATGCCACCTCTAAGGTA...CAGGTAGCGCTGGTAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ATGGTCAAATGAATGAACCACCTGGTGCTCGTGCCCGGGTAGCTCTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103146 ATGGTCAAATGAATGAACCACCTGGTGCTCGTGCCCGGGTAGCTCTGACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GGGCTGACTGTGGCTGAATACTTCAGAGACCAAGAAGGTCAAGATGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103196 GGGCTGACTGTGGCTGAATACTTCAGAGACCAAGAAGGTCAAGATGTACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GCTATTTATTGATAACATCTTTCGCTTCACCCAGGCTGGTTCAGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 103246 GCTATTTATTGATAACATCTTTCGCTTCACCCAGGCTGGTTCAGAGGTA.

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952      GTGTCTGCATTATTGGGCCGAATCCCTTCTGCTGTGGGCTATCAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103296 ..TAGGTGTCTGCATTATTGGGCCGAATCCCTTCTGCTGTGGGCTATCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CCTACCCTGGCCACTGACATGGGTACTATGCAGGAAAGAATTACCACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103429 CCTACCCTGGCCACTGACATGGGTACTATGCAGGAAAGAATTACCACTAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CAAGAAGGGATCTATCACCTCTGTACAG         GCTATCTATGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 103479 CAAGAAGGGATCTATCACCTCTGTACAGGTA...TAGGCTATCTATGTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CTGCTGATGACTTGACTGACCCTGCCCCTGCTACTACGTTTGCCCATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105785 CTGCTGATGACTTGACTGACCCTGCCCCTGCTACTACGTTTGCCCATTTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GATGCTACCACTGTACTGTCGCGTGCCATTGCTGAGCTGGGCATCTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105835 GATGCTACCACTGTACTGTCGCGTGCCATTGCTGAGCTGGGCATCTATCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AGCTGTGGATCCTCTAGACTCCACCTCTCGTATCATGGATCCCAACATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105885 AGCTGTGGATCCTCTAGACTCCACCTCTCGTATCATGGATCCCAACATTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TTGGCAGTGAGCATTACGATGTTGCCCGTGGGGTGCAAAAGATCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105935 TTGGCAGTGAGCATTACGATGTTGCCCGTGGGGTGCAAAAGATCCTGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288          GACTACAAATCCCTCCAGGATATCATTGCCATCCTGGGTAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105985 GTG...TAGGACTACAAATCCCTCCAGGATATCATTGCCATCCTGGGTAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGATGAACTTTCTGAGGAAGACAAGTTGACCGTGTCCCGTGCACGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106698 GGATGAACTTTCTGAGGAAGACAAGTTGACCGTGTCCCGTGCACGGAAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TACAGCGTTTCTTGTCTCAGCCATTCCAGGTTGCTGAGGTCTTCACAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106748 TACAGCGTTTCTTGTCTCAGCCATTCCAGGTTGCTGAGGTCTTCACAGGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CATATGGGGAAGCTGGTACCCCTGAAGGAGACCATCAAAGGATTCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106798 CATATGGGGAAGCTGGTACCCCTGAAGGAGACCATCAAAGGATTCCAGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 GATTTTGGCAG         GTGAATATGACCATCTCCCAGAACAGGCCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 106848 GATTTTGGCAGGTG...CAGGTGAATATGACCATCTCCCAGAACAGGCCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TCTATATGGTGGGACCCATTGAAGAAGCTGTGGCAAAAGCTGATAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107571 TCTATATGGTGGGACCCATTGAAGAAGCTGTGGCAAAAGCTGATAAGCTG

   1650     .    :    .
   1570 GCTGAAGAGCATTCATCG
        ||||||||||||||||||
 107621 GCTGAAGAGCATTCATCG