seq1 = pF1KB5195.tfa, 714 bp
seq2 = pF1KB5195/gi568815586r_55625564.tfa (gi568815586r:55625564_55828341), 202778 bp

>pF1KB5195 714
>gi568815586r:55625564_55828341 (Chr12)

(complement)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-255  (101003-101191)   100% ->
256-330  (101378-101452)   100% ->
331-426  (101547-101642)   100% ->
427-567  (102081-102221)   100% ->
568-651  (102446-102529)   100% ->
652-714  (102716-102778)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGTGGAAGGAGGAATGAAATGTGTGAAGTTCTTGCTCTACGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGTGGAAGGAGGAATGAAATGTGTGAAGTTCTTGCTCTACGTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCTGGCCTTTTGC         GCCTGTGCAGTGGGACTGATTGCCG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCTGGCCTTTTGCGTG...TAGGCCTGTGCAGTGGGACTGATTGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGGTGTCGGGGCACAGCTTGTCCTGAGTCAGACCATAATCCAGGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101028 TGGGTGTCGGGGCACAGCTTGTCCTGAGTCAGACCATAATCCAGGGGGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCCCTGGCTCTCTGTTGCCAGTGGTCATCATCGCAGTGGGTGTCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101078 ACCCCTGGCTCTCTGTTGCCAGTGGTCATCATCGCAGTGGGTGTCTTCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTCCTGGTGGCTTTTGTGGGCTGCTGCGGGGCCTGCAAGGAGAACTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101128 CTTCCTGGTGGCTTTTGTGGGCTGCTGCGGGGCCTGCAAGGAGAACTATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTCTTATGATCACG         TTTGCCATCTTTCTGTCTCTTATCATG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 101178 GTCTTATGATCACGGTG...CAGTTTGCCATCTTTCTGTCTCTTATCATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTGGTGGAGGTGGCCGCAGCCATTGCTGGCTATGTGTTTAGAGATAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101405 TTGGTGGAGGTGGCCGCAGCCATTGCTGGCTATGTGTTTAGAGATAAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    331        GTGATGTCAGAGTTTAATAACAACTTCCGGCAGCAGATGGAGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101455 A...CAGGTGATGTCAGAGTTTAATAACAACTTCCGGCAGCAGATGGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATTACCCGAAAAACAACCACACTGCTTCGATCCTGGACAGGATGCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101590 ATTACCCGAAAAACAACCACACTGCTTCGATCCTGGACAGGATGCAGGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAT         TTTAAGTGCTGTGGGGCTGCTAACTACACAGATTGGGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101640 GATGTG...CAGTTTAAGTGCTGTGGGGCTGCTAACTACACAGATTGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAAAATCCCTTCCATGTCGAAGAACCGAGTCCCCGACTCCTGCTGCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102119 GAAAATCCCTTCCATGTCGAAGAACCGAGTCCCCGACTCCTGCTGCATTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATGTTACTGTGGGCTGTGGGATTAATTTCAACGAGAAGGCGATCCATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102169 ATGTTACTGTGGGCTGTGGGATTAATTTCAACGAGAAGGCGATCCATAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAG         GGCTGTGTGGAGAAGATTGGGGGCTGGCTGAGGAAAAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102219 GAGGTA...CAGGGCTGTGTGGAGAAGATTGGGGGCTGGCTGAGGAAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGTGCTGGTGGTAGCTGCAGCAGCCCTTGGAATTGCTTTTGTCGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 102484 TGTGCTGGTGGTAGCTGCAGCAGCCCTTGGAATTGCTTTTGTCGAGGTA.

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    652      GTTTTGGGAATTGTCTTTGCCTGCTGCCTCGTGAAGAGTATCAGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102534 ..TAGGTTTTGGGAATTGTCTTTGCCTGCTGCCTCGTGAAGAGTATCAGA

    750     .    :    .
    697 AGTGGCTACGAGGTGATG
        ||||||||||||||||||
 102761 AGTGGCTACGAGGTGATG