seq1 = pF1KB5194.tfa, 489 bp
seq2 = pF1KB5194/gi568815593r_134058452.tfa (gi568815593r:134058452_134274022), 215571 bp

>pF1KB5194 489
>gi568815593r:134058452_134274022 (Chr5)

(complement)

1-97  (100001-100097)   100% ->
98-171  (106780-106853)   100% ->
172-315  (112893-113036)   100% ->
316-456  (115428-115568)   100% ->
457-489  (116255-116287)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTTCAATTAAGTTGCAGAGTTCTGATGGAGAGATATTTGAAGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTTCAATTAAGTTGCAGAGTTCTGATGGAGAGATATTTGAAGTTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGGAAATTGCCAAACAATCTGTGACTATTAAGACCATGTTGGAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100051 TGTGGAAATTGCCAAACAATCTGTGACTATTAAGACCATGTTGGAAGGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     98       ATTTGGGAATGGATGATGAAGGAGATGATGACCCAGTTCCTCTA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ...TAGATTTGGGAATGGATGATGAAGGAGATGATGACCCAGTTCCTCTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCAAATGTGAATGCAGCAATATTAAAAAAG         GTCATTCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 106824 CCAAATGTGAATGCAGCAATATTAAAAAAGGTA...TAGGTCATTCAGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTGCACCCACCACAAGGATGACCCTCCTCCTCCTGAAGATGATGAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112904 GTGCACCCACCACAAGGATGACCCTCCTCCTCCTGAAGATGATGAGAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGAAAAGCGAACAGATGATATCCCTGTTTGGGACCAAGAATTCCTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112954 AAGAAAAGCGAACAGATGATATCCCTGTTTGGGACCAAGAATTCCTGAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTTGACCAAGGAACACTTTTTGAACTCATTCTG         GCTGCAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 113004 GTTGACCAAGGAACACTTTTTGAACTCATTCTGGTA...CAGGCTGCAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTACTTAGACATCAAAGGTTTGCTTGATGTTACATGCAAGACTGTTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115436 CTACTTAGACATCAAAGGTTTGCTTGATGTTACATGCAAGACTGTTGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATATGATCAAGGGGAAAACTCCTGAGGAGATTCGCAAGACCTTCAATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115486 ATATGATCAAGGGGAAAACTCCTGAGGAGATTCGCAAGACCTTCAATATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAAAATGACTTTACTGAAGAGGAGGAAGCCCAG         GTACGCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 115536 AAAAATGACTTTACTGAAGAGGAGGAAGCCCAGGTA...TAGGTACGCAA

    500     .    :    .    :    .
    465 AGAGAACCAGTGGTGTGAAGAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||
 116263 AGAGAACCAGTGGTGTGAAGAGAAG