seq1 = pF1KB5182.tfa, 1515 bp
seq2 = pF1KB5182/gi568815588r_80055856.tfa (gi568815588r:80055856_80272861), 217006 bp

>pF1KB5182 1515
>gi568815588r:80055856_80272861 (Chr10)

(complement)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-171  (101947-102062)   100% ->
172-561  (103504-103893)   100% ->
562-649  (105549-105636)   100% ->
650-744  (105878-105972)   98% ->
745-858  (106665-106778)   100% ->
859-949  (108719-108809)   100% ->
950-1029  (109249-109328)   100% ->
1030-1086  (109457-109513)   100% ->
1087-1180  (110834-110927)   100% ->
1181-1276  (113667-113762)   100% ->
1277-1335  (114837-114895)   100% ->
1336-1458  (115099-115221)   100% ->
1459-1515  (116950-117006)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCTACCCTGGCTATCCCCCGCCCCCAGGTGGCTACCCACCAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCTACCCTGGCTATCCCCCGCCCCCAGGTGGCTACCCACCAGCTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCAG         GTGGTGGTCCCTGGGGAGGTGCTGCCTACCCTCCTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACCAGGTA...CAGGTGGTGGTCCCTGGGGAGGTGCTGCCTACCCTCCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGCCCAGCATGCCCCCCATCGGGCTGGATAACGTGGCCACCTATGCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101983 CGCCCAGCATGCCCCCCATCGGGCTGGATAACGTGGCCACCTATGCGGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGTTCAACCAGGACTATCTCTCGGGAATG         GCGGCCAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102033 CAGTTCAACCAGGACTATCTCTCGGGAATGGTG...CAGGCGGCCAACAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTCTGGGACATTTGGAGGAGCCAACATGCCCAACCTGTACCCTGGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103515 GTCTGGGACATTTGGAGGAGCCAACATGCCCAACCTGTACCCTGGGGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGGGGCTGGCTACCCACCAGTGCCCCCTGGCGGCTTTGGGCAGCCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103565 CTGGGGCTGGCTACCCACCAGTGCCCCCTGGCGGCTTTGGGCAGCCCCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCTGCCCAGCAGCCTGTTCCTCCCTATGGGATGTATCCACCCCCAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103615 TCTGCCCAGCAGCCTGTTCCTCCCTATGGGATGTATCCACCCCCAGGAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAACCCACCCTCCAGGATGCCCTCATATCCGCCATACCCAGGGGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103665 AAACCCACCCTCCAGGATGCCCTCATATCCGCCATACCCAGGGGCCCCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGCCGGGCCAGCCCATGCCACCCCCCGGACAGCAGCCCCCAGGGGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103715 TGCCGGGCCAGCCCATGCCACCCCCCGGACAGCAGCCCCCAGGGGCCTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCTGGGCAGCCACCAGTGACCTACCCTGGTCAGCCTCCAGTGCCACTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103765 CCTGGGCAGCCACCAGTGACCTACCCTGGTCAGCCTCCAGTGCCACTCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGGGCAGCAGCAGCCAGTGCCGAGCTACCCAGGATACCCGGGGTCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103815 TGGGCAGCAGCAGCCAGTGCCGAGCTACCCAGGATACCCGGGGTCTGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTGTCACCCCCGCTGTGCCCCCAACCCAG         TTTGGAAGCCGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 103865 CTGTCACCCCCGCTGTGCCCCCAACCCAGGTG...TAGTTTGGAAGCCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGCACCATCACTGATGCTCCCGGCTTTGACCCCCTGCGAGATGCCGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105561 GGCACCATCACTGATGCTCCCGGCTTTGACCCCCTGCGAGATGCCGAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCTGCGGAAGGCCATGAAAGGCTTCG         GGACGGATGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 105611 CCTGCGGAAGGCCATGAAAGGCTTCGGTA...CAGGGACGGATGAGCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCATCATTGACTGCCTGGGGAGTTGCTCCAACAAGCAGCGGCAGCAGATC
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 105893 CCATCATTGACTGCCTGGGGAGTCGCTCCAACAAGCAGCGGCAGCAGATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTACTTTCCTTCAAGACGGCTTACGGCAAG         GATTTGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 105943 CTACTTTCCTTCAAGACGGCTTACGGCAAGGCG...CAGGATTTGATCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGATCTGAAATCTGAACTGTCAGGAAACTTTGAGAAGACAATCTTGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106676 AGATCTGAAATCTGAACTGTCAGGAAACTTTGAGAAGACAATCTTGGCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGATGAAGACCCCAGTCCTCTTTGACATTTATGAGATAAAGGAAGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106726 TGATGAAGACCCCAGTCCTCTTTGACATTTATGAGATAAAGGAAGCCATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AAG         GGGGTTGGCACTGATGAAGCCTGCCTGATTGAGATCCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106776 AAGGTG...CAGGGGGTTGGCACTGATGAAGCCTGCCTGATTGAGATCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CGCTTCCCGCAGCAATGAGCACATCCGAGAATTAAACAGAGCCTACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108757 CGCTTCCCGCAGCAATGAGCACATCCGAGAATTAAACAGAGCCTACAAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CAG         AATTCAAAAAGACCCTGGAAGAGGCCATTCGAAGCGAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108807 CAGGTG...CAGAATTCAAAAAGACCCTGGAAGAGGCCATTCGAAGCGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ACATCAGGGCACTTCCAGCGGCTCCTCATCTCTCTCTCTCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 109287 ACATCAGGGCACTTCCAGCGGCTCCTCATCTCTCTCTCTCAGGTA...CA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1030  GGAAACCGTGATGAAAGCACAAACGTGGACATGTCACTCGCCCAGAGAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109456 GGGAAACCGTGATGAAAGCACAAACGTGGACATGTCACTCGCCCAGAGAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ATGCCCAG         GAGCTGTATGCGGCCGGGGAGAACCGCCTGGGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 109506 ATGCCCAGGTG...CAGGAGCTGTATGCGGCCGGGGAGAACCGCCTGGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 ACAGACGAGTCCAAGTTCAATGCGGTTCTGTGCTCCCGGAGCCGGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110867 ACAGACGAGTCCAAGTTCAATGCGGTTCTGTGCTCCCGGAGCCGGGCCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CCTGGTAGCAG         TTTTCAATGAGTACCAGAGAATGACAGGCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 110917 CCTGGTAGCAGGTA...TAGTTTTCAATGAGTACCAGAGAATGACAGGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 GGGACATTGAGAAGAGCATCTGCCGGGAGATGTCCGGGGACCTGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113697 GGGACATTGAGAAGAGCATCTGCCGGGAGATGTCCGGGGACCTGGAGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GGCATGCTGGCCGTGG         TGAAATGTCTCAAGAATACCCCAGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 113747 GGCATGCTGGCCGTGGGTA...TAGTGAAATGTCTCAAGAATACCCCAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CTTCTTTGCGGAGAGGCTCAACAAGGCCATGAGG         GGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 114862 CTTCTTTGCGGAGAGGCTCAACAAGGCCATGAGGGTA...TAGGGGGCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 GAACAAAGGACCGGACCCTGATTCGCATCATGGTGTCTCGCAGCGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115106 GAACAAAGGACCGGACCCTGATTCGCATCATGGTGTCTCGCAGCGAGACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 GACCTCCTGGACATCAGATCAGAGTATAAGCGGATGTACGGCAAGTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115156 GACCTCCTGGACATCAGATCAGAGTATAAGCGGATGTACGGCAAGTCGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GTACCACGACATCTCG         GGAGATACTTCAGGGGATTACCGGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 115206 GTACCACGACATCTCGGTA...CAGGGAGATACTTCAGGGGATTACCGGA

   1600     .    :    .    :    .    :
   1484 AGATTCTGCTGAAGATCTGTGGTGGCAATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 116975 AGATTCTGCTGAAGATCTGTGGTGGCAATGAC