seq1 = pF1KB5180.tfa, 390 bp
seq2 = pF1KB5180/gi568815588f_77935351.tfa (gi568815588f:77935351_78137304), 201954 bp

>pF1KB5180 390
>gi568815588f:77935351_78137304 (Chr10)

1-69  (100000-100067)   98% ->
70-279  (100161-100370)   100% ->
280-390  (101844-101954)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACGACACCGTAACTATCCGCACTAGAAAGTTCATGACCAACCGACT
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GAACGACACCGTAACTATCCGCACTAGAAAGTTCATGACCAACCGACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTTCAGAGGAAACAAATG         GTCATTGATGTCCTTCACCCCG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100049 ACTTCAGAGGAAACAAATGGTA...TAGGTCATTGATGTCCTTCACCCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGAAGGCGACAGTGCCTAAGACAGAAATTCGGGAAAAACTAGCCAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100183 GGAAGGCGACAGTGCCTAAGACAGAAATTCGGGAAAAACTAGCCAAAATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACAAGACCACACCGGATGTCATCTTTGTATTTGGATTCAGAACTCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100233 TACAAGACCACACCGGATGTCATCTTTGTATTTGGATTCAGAACTCATTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGTGGTGGCAAGACAACTGGCTTTGGCATGATTTATGATTCCCTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100283 TGGTGGTGGCAAGACAACTGGCTTTGGCATGATTTATGATTCCCTGGATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGCAAAGAAAAATGAACCCAAACATAGACTTGCAAGA         CAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100333 ATGCAAAGAAAAATGAACCCAAACATAGACTTGCAAGAGTA...CAGCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCCTGTATGAGAAGAAAAAGACCTCAAGAAAGCAACGAAAGGAACGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101847 GGCCTGTATGAGAAGAAAAAGACCTCAAGAAAGCAACGAAAGGAACGCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAACAGAATGAAGAAAGTCAGGGGGACTGCAAAGGCCAATGTTGGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101897 GAACAGAATGAAGAAAGTCAGGGGGACTGCAAAGGCCAATGTTGGTGCTG

    400     .
    383 GCAAAAAG
        ||||||||
 101947 GCAAAAAG