seq1 = pF1KB5178.tfa, 1455 bp
seq2 = pF1KB5178/gi568815597r_230603144.tfa (gi568815597r:230603144_230810850), 207707 bp

>pF1KB5178 1455
>gi568815597r:230603144_230810850 (Chr1)

(complement)

1-856  (100001-100856)   99% ->
857-1124  (104651-104918)   99% ->
1125-1269  (106514-106658)   100% ->
1270-1455  (107522-107707)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGGAAGCGAGCACCCCAGTCTGAGATGGCTCCTGCCGGTGTGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGGAAGCGAGCACCCCAGTCTGAGATGGCTCCTGCCGGTGTGAGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGGGCCACCATCCTCTGCCTCCTGGCCTGGGCTGGCCTGGCTGCAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGGGCCACCATCCTCTGCCTCCTGGCCTGGGCTGGCCTGGCTGCAGGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCGGGTGTACATACACCCCTTCCACCTCGTCATCCACAATGAGAGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCGGGTGTACATACACCCCTTCCACCTCGTCATCCACAATGAGAGTACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGTGAGCAGCTGGCAAAGGCCAATGCCGGGAAGCCCAAAGACCCCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGTGAGCAGCTGGCAAAGGCCAATGCCGGGAAGCCCAAAGACCCCACCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATACCTGCTCCAATTCAGGCCAAGACATCCCCTGTGGATGAAAAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATACCTGCTCCAATTCAGGCCAAGACATCCCCTGTGGATGAAAAGGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TACAGGACCAGCTGGTGCTAGTCGCTGCAAAACTTGACACCGAAGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TACAGGACCAGCTGGTGCTAGTCGCTGCAAAACTTGACACCGAAGACAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTGAGGGCCGCAATGGTCGGGATGCTGGCCAACTTCTTGGGCTTCCGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTGAGGGCCGCAATGGTCGGGATGCTGGCCAACTTCTTGGGCTTCCGTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ATATGGCATGCACAGTGAGCTATGGGGCGTGGTCCATGGGGCCACCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ATATGGCATGCACAGTGAGCTATGGGGCGTGGTCCATGGGGCCACCGTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCTCCCCAACGGCTGTCTTTGGCACCCTGGCCTCTCTCTATCTGGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCTCCCCAACGGCTGTCTTTGGCACCCTGGCCTCTCTCTATCTGGGAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTGGACCACACAGCTGACAGGCTACAGGCAATCCTGGGTGTTCCTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTGGACCACACAGCTGACAGGCTACAGGCAATCCTGGGTGTTCCTTGGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGACAAGAACTGCACCTCCCGGCTGGATGCGCACAAGGTCCTGTCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGACAAGAACTGCACCTCCCGGCTGGATGCGCACAAGGTCCTGTCTGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCAGGCTGTACAGGGCCTGCTAGTGGCCCAGGGCAGGGCTGATAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCAGGCTGTACAGGGCCTGCTAGTGGCCCAGGGCAGGGCTGATAGCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCCAGCTGCTGCTGTCCACGGTGGTGGGCGTGTTCACAGCCCCAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCCAGCTGCTGCTGTCCACGGTGGTGGGCGTGTTCACAGCCCCAGGCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCACCTGAAGCAGCCGTTTGTGCAGGGCCTGGCTCTCTATACCCCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCACCTGAAGCAGCCGTTTGTGCAGGGCCTGGCTCTCTATACCCCTGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCCTCCCACGCTCTCTGGACTTCACAGAACTGGATGTTGCTGCTGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCCTCCCACGCTCTCTGGACTTCACAGAACTGGATGTTGCTGCTGAGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATTGACAGGTTCATGCAGGCTGTGACAGGATGGAAGACTGGCTGCTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATTGACAGGTTCATGCAGGCTGTGACAGGATGGAAGACTGGCTGCTCCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GACGGGAGCCAGTGTGGACAGCACCCTGGCTTTCAACACCTACGTCCACT
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GATGGGAGCCAGTGTGGACAGCACCCTGGCTTTCAACACCTACGTCCACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCCAAG         GGAAGATGAAGGGCTTCTCCCTGCTGGCCGAGCCC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCCAAGGTA...CAGGGAAGATGAAGGGCTTCTCCCTGCTGGCCGAGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CAGGAGTTCTGGGTGGACAACAGCACCTCAGTGTCTGTTCCCATGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104686 CAGGAGTTCTGGGTGGACAACAGCACCTCAGTGTCTGTTCCCATGCTCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TGGCATGGGCACCTTCCAGCACTGGAGTGACATCCAGGACAACTTCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104736 TGGCATGGGCACCTTCCAGCACTGGAGTGACATCCAGGACAACTTCTCGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TGACTCAAGTGCCCTTCACTGAGAGCGCCTGCCTGCTGCTGATCCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104786 TGACTCAAGTGCCCTTCACTGAGAGCGCCTGCCTGCTGCTGATCCAGCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CACTATGCCTCTGACCTGGACAAGGTGGAGGGTCTCACTTTCCAGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104836 CACTATGCCTCTGACCTGGACAAGGTGGAGGGTCTCACTTTCCAGCAAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CTCCCTCAACTGGATGAAGAAACTGTCTCCCCG         GACCATCC
        |||||||||||||||||||||||| ||||||||>>>...>>>||||||||
 104886 CTCCCTCAACTGGATGAAGAAACTATCTCCCCGGTA...CAGGACCATCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 ACCTGACCATGCCCCAACTGGTGCTGCAAGGATCTTATGACCTGCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106522 ACCTGACCATGCCCCAACTGGTGCTGCAAGGATCTTATGACCTGCAGGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 CTGCTCGCCCAGGCTGAGCTGCCCGCCATTCTGCACACCGAGCTGAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106572 CTGCTCGCCCAGGCTGAGCTGCCCGCCATTCTGCACACCGAGCTGAACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 GCAAAAATTGAGCAATGACCGCATCAGGGTGGGGGAG         GTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 106622 GCAAAAATTGAGCAATGACCGCATCAGGGTGGGGGAGGTA...CAGGTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TGAACAGCATTTTTTTTGAGCTTGAAGCGGATGAGAGAGAGCCCACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107526 TGAACAGCATTTTTTTTGAGCTTGAAGCGGATGAGAGAGAGCCCACAGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 TCTACCCAACAGCTTAACAAGCCTGAGGTCTTGGAGGTGACCCTGAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107576 TCTACCCAACAGCTTAACAAGCCTGAGGTCTTGGAGGTGACCCTGAACCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 CCCATTCCTGTTTGCTGTGTATGATCAAAGCGCCACTGCCCTGCACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107626 CCCATTCCTGTTTGCTGTGTATGATCAAAGCGCCACTGCCCTGCACTTCC

   1450     .    :    .    :    .    :
   1424 TGGGCCGCGTGGCCAACCCGCTGAGCACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 107676 TGGGCCGCGTGGCCAACCCGCTGAGCACAGCA