seq1 = pF1KB5167.tfa, 1560 bp
seq2 = pF1KB5167/gi568815582r_87608354.tfa (gi568815582r:87608354_87865890), 257537 bp

>pF1KB5167 1560
>gi568815582r:87608354_87865890 (Chr16)

(complement)

1-99  (100001-100099)   100% ->
100-191  (103851-103942)   100% ->
192-270  (109414-109492)   100% ->
271-369  (110599-110697)   100% ->
370-506  (117082-117218)   100% ->
507-599  (135247-135339)   100% ->
600-759  (138967-139126)   100% ->
760-835  (151318-151393)   100% ->
836-1044  (154448-154656)   100% ->
1045-1447  (156224-156626)   100% ->
1448-1560  (157425-157537)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAAGAAGGGCAAGAAGGAGAAGAAGGGCCGCGGCGCGGAGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCAAGAAGGGCAAGAAGGAGAAGAAGGGCCGCGGCGCGGAGAAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCGCCAAGATGGAGAAGAAGGTGTCTAAGCGCTCGCGGAAGGAGGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100051 GGCCGCCAAGATGGAGAAGAAGGTGTCTAAGCGCTCGCGGAAGGAGGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100         GAAGACCTGGAAGCGCTCATAGCCCATTTCCAGACACTCGAT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TG...TAGGAAGACCTGGAAGCGCTCATAGCCCATTTCCAGACACTCGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCAAGAGGACTCAGACTGTGGAACTTCCGTGCCCCCCACCCTCACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103893 GCCAAGAGGACTCAGACTGTGGAACTTCCGTGCCCCCCACCCTCACCAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192          GTTAAATGCCTCCCTCTCGGTTCATCCTGAGAAAGATGAGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103943 GTG...TAGGTTAAATGCCTCCCTCTCGGTTCATCCTGAGAAAGATGAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TAATCCTTTTTGGAGGTGAATATTTCAACGGCCAAAAA         ACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 109455 TAATCCTTTTTGGAGGTGAATATTTCAACGGCCAAAAAGTA...TAGACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTTTTGTATAACGAGCTCTATGTCTACAATACCAGAAAGGACACCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110602 TTTTTGTATAACGAGCTCTATGTCTACAATACCAGAAAGGACACCTGGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAAAGTTGACATCCCCAGTCCACCTCCGAGGCGCTGTGCTCACCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 110652 CAAAGTTGACATCCCCAGTCCACCTCCGAGGCGCTGTGCTCACCAGGTA.

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    370      GCGGTGGTAGTGCCTCAAGGTGGCGGACAGCTGTGGGTCTTTGGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110702 ..CAGGCGGTGGTAGTGCCTCAAGGTGGCGGACAGCTGTGGGTCTTTGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GGGGAGTTTGCCTCTCCCAACGGAGAGCAGTTCTACCACTACAAGGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117127 GGGGAGTTTGCCTCTCCCAACGGAGAGCAGTTCTACCACTACAAGGATCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTGGGTCCTGCATTTGGCCACCAAGACCTGGGAACAAGTCAA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 117177 CTGGGTCCTGCATTTGGCCACCAAGACCTGGGAACAAGTCAAGTA...TA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    507  ATCAACAGGCGGTCCTTCGGGTCGGAGTGGACATCGGATGGTGGCCTGG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135246 GATCAACAGGCGGTCCTTCGGGTCGGAGTGGACATCGGATGGTGGCCTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AAGAGACAATTGATCCTGTTTGGTGGCTTCCATGAAAGTACACG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 135296 AAGAGACAATTGATCCTGTTTGGTGGCTTCCATGAAAGTACACGGTT...

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    600    GGATTACATCTACTACAACGACGTGTATGCCTTTAATCTGGACACCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138964 CAGGGATTACATCTACTACAACGACGTGTATGCCTTTAATCTGGACACCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TCACATGGAGCAAGCTGTCCCCGTCAGGGACGGGGCCCACACCCAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139014 TCACATGGAGCAAGCTGTCCCCGTCAGGGACGGGGCCCACACCCAGATCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GGCTGCCAGATGTCCGTCACTCCCCAGGGCGGCATCGTCGTCTATGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139064 GGCTGCCAGATGTCCGTCACTCCCCAGGGCGGCATCGTCGTCTATGGGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CTACTCGAAACAG         AGAGTTAAGAAAGACGTGGACAAGGGCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 139114 CTACTCGAAACAGGTA...CAGAGAGTTAAGAAAGACGTGGACAAGGGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CACGGCACTCAGACATGTTCCTGCTGAAGCCAGAGGACGGAAGAGAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 151346 CACGGCACTCAGACATGTTCCTGCTGAAGCCAGAGGACGGAAGAGAAGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    836        ACAAGTGGGTTTGGACTCGGATGAACCCTTCGGGGGTCAAGCC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151396 A...CAGACAAGTGGGTTTGGACTCGGATGAACCCTTCGGGGGTCAAGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CACCCCACGGTCTGGCTTTTCCGTGGCCATGGCCCCGAATCACCAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154491 CACCCCACGGTCTGGCTTTTCCGTGGCCATGGCCCCGAATCACCAGACAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TGTTCTTCGGGGGTGTCTGTGACGAGGAAGAGGAGGAGAGCCTGTCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154541 TGTTCTTCGGGGGTGTCTGTGACGAGGAAGAGGAGGAGAGCCTGTCGGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GAGTTCTTCAACGATCTGTACTTCTACGACGCCACCAGGAACCGTTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154591 GAGTTCTTCAACGATCTGTACTTCTACGACGCCACCAGGAACCGTTGGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TGAGGGACAGCTGAAG         GGACCCAAGTCTGAAAAGAAGAAAC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 154641 TGAGGGACAGCTGAAGGTA...TAGGGACCCAAGTCTGAAAAGAAGAAAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GCAGGCGGGGCAGAAAAGAGGAGCCCGAAGGTGGTAGCAGGCCGGCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156249 GCAGGCGGGGCAGAAAAGAGGAGCCCGAAGGTGGTAGCAGGCCGGCGTGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GGGGGAGCTGGCACCCAGGGGCCTGTGCAGCTGGTCAAGGAGGTGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156299 GGGGGAGCTGGCACCCAGGGGCCTGTGCAGCTGGTCAAGGAGGTGGTGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CGAGGATGGCACCGTGGTCACCATTAAGCAGGTGCTCACCGCGCCAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156349 CGAGGATGGCACCGTGGTCACCATTAAGCAGGTGCTCACCGCGCCAGGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CGGCGGGGCAGCCCCGGTCTGAGGACGAAGACAGCCTTGAGGAGGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156399 CGGCGGGGCAGCCCCGGTCTGAGGACGAAGACAGCCTTGAGGAGGCCGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AGCCCCGCACCTGGGCCGTGTCCACGCTCCAACGCCATGCTGGCTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156449 AGCCCCGCACCTGGGCCGTGTCCACGCTCCAACGCCATGCTGGCTGTGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GCATGGGGTGCTCTACGTCTATGGGGGCATGTTTGAGGCCGGCGACCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156499 GCATGGGGTGCTCTACGTCTATGGGGGCATGTTTGAGGCCGGCGACCGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AGGTCACCCTCAGCGACCTGCACTGCCTGGACCTGCACAGGATGGAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156549 AGGTCACCCTCAGCGACCTGCACTGCCTGGACCTGCACAGGATGGAGGCG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TGGAAGGCCTTGGTGGAGATGGACCCAG         AAACTCAGGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 156599 TGGAAGGCCTTGGTGGAGATGGACCCAGGTG...AAGAAACTCAGGAGTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GCTGGAGGAGACGGACTCGGAAGAGGACAGTGAGGAGGTTGAGGGCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157438 GCTGGAGGAGACGGACTCGGAAGAGGACAGTGAGGAGGTTGAGGGCGCCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 AGGGTGGGGTCGACGACGAAGACAGCGGAGAGGAGAGCGGTGCGGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157488 AGGGTGGGGTCGACGACGAAGACAGCGGAGAGGAGAGCGGTGCGGAGGAC