seq1 = pF1KB5164.tfa, 1281 bp
seq2 = pF1KB5164/gi568815579r_49559651.tfa (gi568815579r:49559651_49764838), 205188 bp

>pF1KB5164 1281
>gi568815579r:49559651_49764838 (Chr19)

(complement)

1-165  (100001-100165)   100% ->
166-337  (101325-101496)   100% ->
338-408  (101581-101651)   100% ->
409-601  (102222-102414)   100% ->
602-982  (102511-102891)   100% ->
983-1098  (104011-104126)   100% ->
1099-1281  (105006-105188)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAACCCCAAAGCCACGGATCCTGCCCTGGCTGGTGTCGCAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAACCCCAAAGCCACGGATCCTGCCCTGGCTGGTGTCGCAGCTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGGGCAACTGGAGGGCGTGGCCTGGGTGAACAAGAGCCGCACGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGGGCAACTGGAGGGCGTGGCCTGGGTGAACAAGAGCCGCACGCGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCGCATCCCTTGGAAGCACGGCCTACGGCAGGATGCACAGCAGGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCGCATCCCTTGGAAGCACGGCCTACGGCAGGATGCACAGCAGGAGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCGGAATCTTCCAG         GCCTGGGCCGAGGCCACTGGTGCATA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCGGAATCTTCCAGGTG...CAGGCCTGGGCCGAGGCCACTGGTGCATA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGTTCCCGGGAGGGATAAGCCAGACCTGCCAACCTGGAAGAGGAATTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TGTTCCCGGGAGGGATAAGCCAGACCTGCCAACCTGGAAGAGGAATTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCTCTGCCCTCAACCGCAAAGAAGGGTTGCGTTTAGCAGAGGACCGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GCTCTGCCCTCAACCGCAAAGAAGGGTTGCGTTTAGCAGAGGACCGGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGGACCCTCACGACCCACATAAAATCTACGAGTTTGTGAACTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 101451 AAGGACCCTCACGACCCACATAAAATCTACGAGTTTGTGAACTCAGGTC.

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    338      GAGTTGGGGACTTTTCCCAGCCAGACACCTCTCCGGACACCAATG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 ..CAGGAGTTGGGGACTTTTCCCAGCCAGACACCTCTCCGGACACCAATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTGGAGGCAGTACTTCTGATACCCAG         GAAGACATTCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101626 GTGGAGGCAGTACTTCTGATACCCAGGTG...CAGGAAGACATTCTGGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGTTACTGGGTAACATGGTGTTGGCCCCACTCCCAGATCCGGGACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102237 GAGTTACTGGGTAACATGGTGTTGGCCCCACTCCCAGATCCGGGACCCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AAGCCTGGCTGTAGCCCCTGAGCCCTGCCCTCAGCCCCTGCGGAGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102287 AAGCCTGGCTGTAGCCCCTGAGCCCTGCCCTCAGCCCCTGCGGAGCCCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCTTGGACAATCCCACTCCCTTCCCAAACCTGGGGCCCTCTGAGAACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102337 GCTTGGACAATCCCACTCCCTTCCCAAACCTGGGGCCCTCTGAGAACCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGAAGCGGCTGTTGGTGCCGGGGGAAG         AGTGGGAGTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102387 CTGAAGCGGCTGTTGGTGCCGGGGGAAGGTG...CAGAGTGGGAGTTCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGTGACAGCCTTCTACCGGGGCCGCCAAGTCTTCCAGCAGACCATCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102524 GGTGACAGCCTTCTACCGGGGCCGCCAAGTCTTCCAGCAGACCATCTCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GCCCGGAGGGCCTGCGGCTGGTGGGGTCCGAAGTGGGAGACAGGACGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102574 GCCCGGAGGGCCTGCGGCTGGTGGGGTCCGAAGTGGGAGACAGGACGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CCTGGATGGCCAGTCACACTGCCAGACCCTGGCATGTCCCTGACAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102624 CCTGGATGGCCAGTCACACTGCCAGACCCTGGCATGTCCCTGACAGACAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GGGAGTGATGAGCTACGTGAGGCATGTGCTGAGCTGCCTGGGTGGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102674 GGGAGTGATGAGCTACGTGAGGCATGTGCTGAGCTGCCTGGGTGGGGGAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGGCTCTCTGGCGGGCCGGGCAGTGGCTCTGGGCCCAGCGGCTGGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102724 TGGCTCTCTGGCGGGCCGGGCAGTGGCTCTGGGCCCAGCGGCTGGGGCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TGCCACACATACTGGGCAGTGAGCGAGGAGCTGCTCCCCAACAGCGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102774 TGCCACACATACTGGGCAGTGAGCGAGGAGCTGCTCCCCAACAGCGGGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TGGGCCTGATGGCGAGGTCCCCAAGGACAAGGAAGGAGGCGTGTTTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102824 TGGGCCTGATGGCGAGGTCCCCAAGGACAAGGAAGGAGGCGTGTTTGACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TGGGGCCCTTCATTGTAG         ATCTGATTACCTTCACGGAAGGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102874 TGGGGCCCTTCATTGTAGGTG...CAGATCTGATTACCTTCACGGAAGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 AGCGGACGCTCACCACGCTATGCCCTCTGGTTCTGTGTGGGGGAGTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104034 AGCGGACGCTCACCACGCTATGCCCTCTGGTTCTGTGTGGGGGAGTCATG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GCCCCAGGACCAGCCGTGGACCAAGAGGCTCGTGATGGTCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 104084 GCCCCAGGACCAGCCGTGGACCAAGAGGCTCGTGATGGTCAAGGTG...C

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1099   GTTGTGCCCACGTGCCTCAGGGCCTTGGTAGAAATGGCCCGGGTAGGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105004 AGGTTGTGCCCACGTGCCTCAGGGCCTTGGTAGAAATGGCCCGGGTAGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GGTGCCTCCTCCCTGGAGAATACTGTGGACCTGCACATTTCCAACAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105054 GGTGCCTCCTCCCTGGAGAATACTGTGGACCTGCACATTTCCAACAGCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CCCACTCTCCCTCACCTCCGACCAGTACAAGGCCTACCTGCAGGACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105104 CCCACTCTCCCTCACCTCCGACCAGTACAAGGCCTACCTGCAGGACTTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .
   1247 TGGAGGGCATGGATTTCCAGGGCCCTGGGGAGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105154 TGGAGGGCATGGATTTCCAGGGCCCTGGGGAGAGC