seq1 = pF1KB5163.tfa, 624 bp
seq2 = pF1KB5163/gi568815587r_73577901.tfa (gi568815587r:73577901_73860635), 282735 bp

>pF1KB5163 624
>gi568815587r:73577901_73860635 (Chr11)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-129  (129813-129871)   100% ->
130-183  (139737-139790)   100% ->
184-289  (141918-142023)   100% ->
290-401  (144274-144385)   100% ->
402-495  (153123-153216)   100% ->
496-562  (180916-180982)   100% ->
563-624  (182674-182735)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCACGGGCGGAGACTTCGGGAATCCGCTGAGGAAATTCAAGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCACGGGCGGAGACTTCGGGAATCCGCTGAGGAAATTCAAGCTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTCCTGGGGGAGCAAAGCG         TTGGAAAGACATCTTTGATCA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 GTTCCTGGGGGAGCAAAGCGGTG...CAGTTGGAAAGACATCTTTGATCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCAGATTCATGTATGACAGTTTTGACAACACCTATCAG         GCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 129834 CCAGATTCATGTATGACAGTTTTGACAACACCTATCAGGTA...CAGGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ACAATTGGCATTGACTTTTTATCAAAAACTATGTACTTGGAGGATCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139740 ACAATTGGCATTGACTTTTTATCAAAAACTATGTACTTGGAGGATCGAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 A         GTACGATTGCAATTATGGGACACAGCAGGTCAAGAGCGGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139790 AGTG...TAGGTACGATTGCAATTATGGGACACAGCAGGTCAAGAGCGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TCAGGAGCTTGATTCCTAGCTACATTCGTGACTCCACTGTGGCAGTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141958 TCAGGAGCTTGATTCCTAGCTACATTCGTGACTCCACTGTGGCAGTTGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTTTATGATATCACAA         ATGTTAACTCATTCCAGCAAACTAC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 142008 GTTTATGATATCACAAGTG...TAGATGTTAACTCATTCCAGCAAACTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 AAAGTGGATTGATGATGTCAGAACAGAAAGAGGAAGTGATGTTATCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144299 AAAGTGGATTGATGATGTCAGAACAGAAAGAGGAAGTGATGTTATCATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGCTAGTAGGAAATAAAACAGATCTTGCTGACAAGAG         GCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 144349 TGCTAGTAGGAAATAAAACAGATCTTGCTGACAAGAGGTA...CAGGCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GTGTCAATTGAGGAGGGAGAGAGGAAAGCCAAAGAGCTGAATGTTATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153127 GTGTCAATTGAGGAGGGAGAGAGGAAAGCCAAAGAGCTGAATGTTATGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TATTGAAACTAGTGCAAAAGCTGGATACAATGTAAAGCAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 153177 TATTGAAACTAGTGCAAAAGCTGGATACAATGTAAAGCAGGTA...CAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TCTTTCGACGTGTAGCAGCAGCTTTGCCGGGAATGGAAAGCACACAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180917 TCTTTCGACGTGTAGCAGCAGCTTTGCCGGGAATGGAAAGCACACAGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AGAAGCAGAGAAGATA         TGATTGACATAAAACTGGAAAAGCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 180967 AGAAGCAGAGAAGATAGTA...CAGTGATTGACATAAAACTGGAAAAGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .
    588 TCAGGAGCAACCAGTCAGTGAAGGAGGCTGTTCCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182699 TCAGGAGCAACCAGTCAGTGAAGGAGGCTGTTCCTGC