seq1 = pF1KB5161.tfa, 1389 bp
seq2 = pF1KB5161/gi568815585r_47843374.tfa (gi568815585r:47843374_48101269), 257896 bp

>pF1KB5161 1389
>gi568815585r:47843374_48101269 (Chr13)

(complement)

1-90  (100001-100090)   100% ->
91-271  (104247-104427)   100% ->
272-371  (112289-112388)   100% ->
372-534  (112567-112729)   100% ->
535-663  (127878-128006)   99% ->
664-802  (132537-132675)   100% ->
803-964  (146713-146874)   100% ->
965-1107  (146988-147130)   100% ->
1108-1228  (151667-151787)   100% ->
1229-1317  (152242-152330)   100% ->
1318-1389  (157825-157896)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCTCCATGTTCTACGGCAGGCTAGTGGCCGTGGCCACCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCTCCATGTTCTACGGCAGGCTAGTGGCCGTGGCCACCCTTCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAACCACCGGCCTCGGACGGCCCAGCGGGCTGCTGCTCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100051 GAACCACCGGCCTCGGACGGCCCAGCGGGCTGCTGCTCAGGTA...TAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTCTGGGAAGTTCTGGATTGTTTAATAACCATGGACTCCAAGTACAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104248 TTCTGGGAAGTTCTGGATTGTTTAATAACCATGGACTCCAAGTACAGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAACAGCAAAGGAATCTCTCACTACATGAATACATGAGTATGGAATTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104298 CAACAGCAAAGGAATCTCTCACTACATGAATACATGAGTATGGAATTATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCAAGAAGCTGGTGTCTCCGTTCCCAAAGGATATGTGGCAAAGTCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104348 GCAAGAAGCTGGTGTCTCCGTTCCCAAAGGATATGTGGCAAAGTCACCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGAAGCTTATGCAATTGCCAAAAAATTAG         GTTCAAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 104398 ATGAAGCTTATGCAATTGCCAAAAAATTAGGTA...TAGGTTCAAAAGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTCGTGATAAAGGCACAGGTTTTAGCTGGTGGTAGAGGAAAAGGAACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112300 GTCGTGATAAAGGCACAGGTTTTAGCTGGTGGTAGAGGAAAAGGAACATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGAAAGTGGCCTCAAAGGAGGAGTGAAGATAGTTTTCTC         TC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 112350 TGAAAGTGGCCTCAAAGGAGGAGTGAAGATAGTTTTCTCGTA...TAGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CAGAAGAAGCAAAAGCTGTTTCTTCACAAATGATTGGGAAAAAATTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112569 CAGAAGAAGCAAAAGCTGTTTCTTCACAAATGATTGGGAAAAAATTGTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACCAAGCAAACGGGAGAAAAGGGCAGAATATGCAATCAAGTATTGGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112619 ACCAAGCAAACGGGAGAAAAGGGCAGAATATGCAATCAAGTATTGGTCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGAGCGAAAATATCCCAGGAGAGAATACTACTTTGCAATAACAATGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112669 TGAGCGAAAATATCCCAGGAGAGAATACTACTTTGCAATAACAATGGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGTCATTTCAA         GGTCCTGTATTAATAGGAAGTTCACATGGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 112719 GGTCATTTCAAGTG...CAGGGTCCTGTATTAATAGGAAGTTCACATGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGTGTCAACATTGAAGATGTTGCTGCTGAGACTCCTGAAGCAATAATTAA
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 127908 GGTGTCAACATTGAAGATGTTGCTGCTGAGTCTCCTGAAGCAATAATTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGAACCTATTGATATTGAAGAAGGCATCAAAAAGGAACAAGCTCTCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 127958 AGAACCTATTGATATTGAAGAAGGCATCAAAAAGGAACAAGCTCTCCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    664         CTTGCACAGAAGATGGGATTTCCACCTAATATTGTGGAATCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128008 TA...CAGCTTGCACAGAAGATGGGATTTCCACCTAATATTGTGGAATCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCAGCAGAAAACATGGTCAAGCTTTACAGCCTTTTTCTGAAATACGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132579 GCAGCAGAAAACATGGTCAAGCTTTACAGCCTTTTTCTGAAATACGATGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AACCATGATAGAAATAAATCCAATGGTGGAAGATTCAGATGGAGCTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 132629 AACCATGATAGAAATAAATCCAATGGTGGAAGATTCAGATGGAGCTGGTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    803       TATTGTGTATGGATGCAAAGATCAATTTTGACTCTAATTCAGCC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132679 ...AAGTATTGTGTATGGATGCAAAGATCAATTTTGACTCTAATTCAGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TATCGCCAAAAGAAAATCTTTGATCTACAGGACTGGACCCAGGAAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146757 TATCGCCAAAAGAAAATCTTTGATCTACAGGACTGGACCCAGGAAGATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AAGGGACAAAGATGCTGCTAAGGCAAATCTCAACTACATTGGCCTCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146807 AAGGGACAAAGATGCTGCTAAGGCAAATCTCAACTACATTGGCCTCGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GAAATATAGGCTGCCTAG         TAAATGGTGCTGGTTTGGCTATG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 146857 GAAATATAGGCTGCCTAGGTA...TAGTAAATGGTGCTGGTTTGGCTATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GCCACAATGGATATAATAAAACTTCATGGAGGGACTCCAGCCAACTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147011 GCCACAATGGATATAATAAAACTTCATGGAGGGACTCCAGCCAACTTCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGATGTTGGTGGTGGTGCTACAGTCCATCAAGTAACAGAAGCATTTAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147061 TGATGTTGGTGGTGGTGCTACAGTCCATCAAGTAACAGAAGCATTTAAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TTATCACTTCAGATAAAAAG         GTACTGGCTATTCTGGTCAAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 147111 TTATCACTTCAGATAAAAAGGTA...TAGGTACTGGCTATTCTGGTCAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 ATTTTTGGAGGAATCATGCGCTGTGATGTTATTGCACAGGGTATAGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151688 ATTTTTGGAGGAATCATGCGCTGTGATGTTATTGCACAGGGTATAGTCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GGCAGTAAAAGACTTGGAAATTAAAATACCTGTTGTGGTACGGTTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151738 GGCAGTAAAAGACTTGGAAATTAAAATACCTGTTGTGGTACGGTTACAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229          GTACACGAGTCGATGATGCTAAGGCACTGATAGCGGACAGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151788 GTG...CAGGTACACGAGTCGATGATGCTAAGGCACTGATAGCGGACAGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GGACTTAAAATACTTGCTTGTGATGACTTGGATGAAGCTGCTAGAATG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 152283 GGACTTAAAATACTTGCTTGTGATGACTTGGATGAAGCTGCTAGAATGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1318        GTTGTAAAGCTCTCTGAAATAGTGACCTTAGCGAAGCAAGCAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152333 A...TAGGTTGTAAAGCTCTCTGAAATAGTGACCTTAGCGAAGCAAGCAC

   1450     .    :    .    :    .
   1361 ATGTGGATGTGAAATTTCAGTTGCCAATA
        |||||||||||||||||||||||||||||
 157868 ATGTGGATGTGAAATTTCAGTTGCCAATA