seq1 = pF1KB5144.tfa, 2190 bp
seq2 = pF1KB5144/gi568815586r_84761635.tfa (gi568815586r:84761635_84992120), 230486 bp

>pF1KB5144 2190
>gi568815586r:84761635_84992120 (Chr12)

(complement)

1-289  (100001-100289)   100% ->
290-447  (106053-106210)   100% ->
448-574  (106560-106686)   100% ->
575-756  (108081-108262)   100% ->
757-867  (115514-115624)   100% ->
868-1109  (118793-119034)   100% ->
1110-1302  (119327-119519)   100% ->
1303-1495  (121451-121643)   100% ->
1496-1655  (124928-125087)   100% ->
1656-1818  (128520-128682)   100% ->
1819-2190  (130115-130486)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCAAAAATAGCAAGGTGGTAAAAAGAGAATTAGATGATGATGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCAAAAATAGCAAGGTGGTAAAAAGAGAATTAGATGATGATGTTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAGTCTGTCAAAGACCTTCTTTCCAATGAAGACGCAGCTGATGATGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGAGTCTGTCAAAGACCTTCTTTCCAATGAAGACGCAGCTGATGATGCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTAAGACAAGTGAACTAATTGTTGATGGCCAGGAAGAGAAAGATACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTAAGACAAGTGAACTAATTGTTGATGGCCAGGAAGAGAAAGATACAGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTTGAAGAAGGATCTGAAGTCGAAGATGAAAGACCAGCTTGGAACAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTTGAAGAAGGATCTGAAGTCGAAGATGAAAGACCAGCTTGGAACAGTAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACTACAATACATCCTGGCCCAAGTTGGATTTTCTGTAGGTTTAGGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACTACAATACATCCTGGCCCAAGTTGGATTTTCTGTAGGTTTAGGAAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTGGCGATTTCCATACCTATGTCAGAAGAATGGGGGCG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100251 TGTGGCGATTTCCATACCTATGTCAGAAGAATGGGGGCGGTA...TAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCATATCTTTTACCATATTTAATACTACTTATGGTAATAGGTATTCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106055 GCATATCTTTTACCATATTTAATACTACTTATGGTAATAGGTATTCCCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TTTTTTCTTGGAACTCTCTGTGGGTCAAAGAATTCGGCGAGGCAGCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106105 TTTTTTCTTGGAACTCTCTGTGGGTCAAAGAATTCGGCGAGGCAGCATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GTGTATGGAATTACATAAGCCCTAAACTGGGCGGGATTGGATTTGCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106155 GTGTATGGAATTACATAAGCCCTAAACTGGGCGGGATTGGATTTGCAAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TGTGTA         GTGTGCTATTTTGTAGCTCTCTACTACAACGTCAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106205 TGTGTAGTA...CAGGTGTGCTATTTTGTAGCTCTCTACTACAACGTCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CATTGGCTGGAGTTTGTTTTATTTTTCTCAGTCTTTTCAGCAACCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106595 CATTGGCTGGAGTTTGTTTTATTTTTCTCAGTCTTTTCAGCAACCCCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTTGGGATCAGTGTCCTTTGGTGAAAAATGCTTCACACACTT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 106645 CTTGGGATCAGTGTCCTTTGGTGAAAAATGCTTCACACACTTGTA...CA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    575  TTGTAGAACCAGAATGTGAACAAAGTTCTGCCACCACCTATTACTGGTA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108080 GTTGTAGAACCAGAATGTGAACAAAGTTCTGCCACCACCTATTACTGGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAGGGAAGCACTGAATATTTCAAGTTCCATTTCTGAAAGTGGGGGCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108130 CAGGGAAGCACTGAATATTTCAAGTTCCATTTCTGAAAGTGGGGGCTTAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACTGGAAGATGACCATCTGCTTGTTGGCTGCCTGGGTCATGGTTTGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108180 ACTGGAAGATGACCATCTGCTTGTTGGCTGCCTGGGTCATGGTTTGCTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GCTATGATCAAAGGCATTCAGTCTTCTGGAAAA         ATCATATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 108230 GCTATGATCAAAGGCATTCAGTCTTCTGGAAAAGTT...CAGATCATATA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TTTTAGTTCTCTGTTTCCATATGTGGTACTTATTTGCTTCCTCATCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115522 TTTTAGTTCTCTGTTTCCATATGTGGTACTTATTTGCTTCCTCATCAGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CATTCCTTTTAAATGGTTCAATTGATGGCATTCGCCACATGTTTACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115572 CATTCCTTTTAAATGGTTCAATTGATGGCATTCGCCACATGTTTACCCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AAG         CTTGAAATAATGCTGGAGCCCAAGGTCTGGAGAGAAGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115622 AAGGTA...CAGCTTGAAATAATGCTGGAGCCCAAGGTCTGGAGAGAAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGCTACTCAAGTGTTCTTTGCCTTAGGTCTGGGATTTGGTGGTGTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118831 TGCTACTCAAGTGTTCTTTGCCTTAGGTCTGGGATTTGGTGGTGTCATTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCTTTTCAAGCTACAACAAGAGAGACAACAACTGCCACTTTGATGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118881 CCTTTTCAAGCTACAACAAGAGAGACAACAACTGCCACTTTGATGCTGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CTGGTGTCCTTCATCAATTTTTTCACTTCTGTCCTGGCAACATTGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118931 CTGGTGTCCTTCATCAATTTTTTCACTTCTGTCCTGGCAACATTGGTGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GTTTGCAGTTCTGGGCTTCAAAGCAAATGTCATAAATGAGAAATGCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118981 GTTTGCAGTTCTGGGCTTCAAAGCAAATGTCATAAATGAGAAATGCATTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CACA         AAATTCAGAGACGATCATGAAATTTTTGAAAATGGGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119031 CACAGTA...CAGAAATTCAGAGACGATCATGAAATTTTTGAAAATGGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 AACATTAGTCAGGATATTATTCCCCATCATATCAACCTTTCAACTGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119364 AACATTAGTCAGGATATTATTCCCCATCATATCAACCTTTCAACTGTTAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TGCAGAAGATTATCATTTAGTTTATGACATCATTCAAAAAGTGAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119414 TGCAGAAGATTATCATTTAGTTTATGACATCATTCAAAAAGTGAAAGAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 AAGAGTTTCCTGCTCTTCATCTCAATTCCTGTAAAATTGAAGAAGAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119464 AAGAGTTTCCTGCTCTTCATCTCAATTCCTGTAAAATTGAAGAAGAGCTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 AATAAA         GCTGTTCAGGGGACCGGCTTAGCTTTTATTGCCTT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119514 AATAAAGTT...CAGGCTGTTCAGGGGACCGGCTTAGCTTTTATTGCCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 TACAGAAGCGATGACACATTTTCCTGCATCTCCCTTCTGGTCAGTGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121486 TACAGAAGCGATGACACATTTTCCTGCATCTCCCTTCTGGTCAGTGATGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TTTTCCTCATGCTGGTCAATCTAGGCCTTGGCAGTATGTTTGGAACCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121536 TTTTCCTCATGCTGGTCAATCTAGGCCTTGGCAGTATGTTTGGAACCATT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 GAAGGGATTGTCACGCCTATTGTGGACACTTTCAAAGTGAGGAAAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121586 GAAGGGATTGTCACGCCTATTGTGGACACTTTCAAAGTGAGGAAAGAAAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 TCTTACTG         TTATCTGTTGTCTTCTGGCATTTTGTATTGGCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 121636 TCTTACTGGTG...TAGTTATCTGTTGTCTTCTGGCATTTTGTATTGGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 TGATATTTGTGCAACGCTCTGGAAATTACTTTGTTACAATGTTTGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124961 TGATATTTGTGCAACGCTCTGGAAATTACTTTGTTACAATGTTTGATGAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 TATTCTGCTACACTGCCTCTGCTAATTGTAGTCATTTTGGAGAATATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125011 TATTCTGCTACACTGCCTCTGCTAATTGTAGTCATTTTGGAGAATATTGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 TGTATGCTTTGTTTATGGCATAGATAA         GTTTATGGAAGACC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 125061 TGTATGCTTTGTTTATGGCATAGATAAGTA...CAGGTTTATGGAAGACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 TAAAAGATATGCTGGGCTTTGCTCCCAGCAGATATTACTACTATATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128534 TAAAAGATATGCTGGGCTTTGCTCCCAGCAGATATTACTACTATATGTGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 AAATATATTTCTCCTCTAATGCTATTATCATTGCTAATAGCTAGTGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128584 AAATATATTTCTCCTCTAATGCTATTATCATTGCTAATAGCTAGTGTTGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 GAATATGGGATTAAGTCCTCCTGGCTATAACGCATGGATTGAAGATAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 128634 GAATATGGGATTAAGTCCTCCTGGCTATAACGCATGGATTGAAGATAAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1819         GCATCTGAAGAATTTCTGAGCTATCCAACATGGGGACTGGTT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128684 TA...CAGGCATCTGAAGAATTTCTGAGCTATCCAACATGGGGACTGGTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 GTTTGTGTCTCTCTGGTTGTCTTTGCAATACTCCCAGTCCCTGTAGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130157 GTTTGTGTCTCTCTGGTTGTCTTTGCAATACTCCCAGTCCCTGTAGTTTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 CATTGTTCGTCGCTTCAACCTTATAGATGATAGTTCTGGTAATTTAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130207 CATTGTTCGTCGCTTCAACCTTATAGATGATAGTTCTGGTAATTTAGCAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 CTGTGACCTATAAGAGAGGAAGGGTCCTGAAAGAGCCTGTGAACTTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130257 CTGTGACCTATAAGAGAGGAAGGGTCCTGAAAGAGCCTGTGAACTTAGAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 GGCGATGATACAAGCCTCATTCACGGAAAAATACCGAGCGAGATGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130307 GGCGATGATACAAGCCTCATTCACGGAAAAATACCGAGCGAGATGCCATC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 TCCAAATTTTGGTAAAAATATTTATCGAAAACAGAGTGGATCCCCAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130357 TCCAAATTTTGGTAAAAATATTTATCGAAAACAGAGTGGATCCCCAACTC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 TGGATACTGCTCCCAATGGACGGTATGGAATAGGGTACTTGATGGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130407 TGGATACTGCTCCCAATGGACGGTATGGAATAGGGTACTTGATGGCAGAT

   2250     .    :    .    :    .    :
   2161 ATTATGCCAGATATGCCAGAATCTGATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 130457 ATTATGCCAGATATGCCAGAATCTGATTTG