seq1 = pF1KB5126.tfa, 1026 bp
seq2 = pF1KB5126/gi568815597r_111341233.tfa (gi568815597r:111341233_111549169), 207937 bp

>pF1KB5126 1026
>gi568815597r:111341233_111549169 (Chr1)

(complement)

1-115  (100001-100115)   100% ->
116-301  (100366-100551)   100% ->
302-443  (101594-101735)   100% ->
444-493  (102026-102075)   100% ->
494-564  (105046-105116)   100% ->
565-619  (105249-105303)   100% ->
620-691  (105776-105847)   100% ->
692-800  (106409-106517)   100% ->
801-869  (107077-107145)   100% ->
870-1026  (107781-107937)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGGAAGGAAACCCCACCCCCCCTAGTGCCCCCGGCGGCCCGGGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGGAAGGAAACCCCACCCCCCCTAGTGCCCCCGGCGGCCCGGGAGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAATCTTCCCCCAAATGCGCCCGCCTGCATGGAACGGCAGTTGGAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAATCTTCCCCCAAATGCGCCCGCCTGCATGGAACGGCAGTTGGAGGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCGGTACCGGTCCG         ATGGGGCGCTTCTCCTCGGGGCCTCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCGGTACCGGTCCGGTG...TAGATGGGGCGCTTCTCCTCGGGGCCTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGCCTGAGTGGGCGCTGCTGGGCCGGCTCCCTCTGGCTTTTTAAGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100392 AGCCTGAGTGGGCGCTGCTGGGCCGGCTCCCTCTGGCTTTTTAAGGACCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGTGCCGCCCCCAACGAAGGCTTCTGCTCCGCCGGAGTCCAAACGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100442 CTGTGCCGCCCCCAACGAAGGCTTCTGCTCCGCCGGAGTCCAAACGGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGGAGTGGCTGACCTCACTTGGGTTGGGGAGAGAGGTATTCTAGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100492 CTGGAGTGGCTGACCTCACTTGGGTTGGGGAGAGAGGTATTCTAGTGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCCGATTCAG         GTGCTGTTGAATTGTGGGAACTAGATGAGAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100542 TCCGATTCAGGTG...CAGGTGCTGTTGAATTGTGGGAACTAGATGAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGAGACACTTATTGTCAGCAAGTTCTGCAAGTATGAGCATGATGACATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101625 TGAGACACTTATTGTCAGCAAGTTCTGCAAGTATGAGCATGATGACATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGTCTACAGTCAGTGTCTTGAGCTCTGGCACACAAGCTGTCAGTGGTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101675 TGTCTACAGTCAGTGTCTTGAGCTCTGGCACACAAGCTGTCAGTGGTAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAAGACATCTG         CATCAAGGTTTGGGACCTTGCTCAGCAGGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101725 AAAGACATCTGGTG...TAGCATCAAGGTTTGGGACCTTGCTCAGCAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGTACTGAGTTCATACCGAG         CTCATGCTGCTCAGGTCACTT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 102056 GGTACTGAGTTCATACCGAGGTG...TAGCTCATGCTGCTCAGGTCACTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTGTTGCTGCCTCTCCTCACAAGGACTCTGTGTTTCTTTCATGCAGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105067 GTGTTGCTGCCTCTCCTCACAAGGACTCTGTGTTTCTTTCATGCAGCGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565          GACAATAGAATTTTACTCTGGGATACCCGCTGTCCCAAGCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105117 GTA...TAGGACAATAGAATTTTACTCTGGGATACCCGCTGTCCCAAGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGCATCACAGATTG         GCTGCAGTGCGCCTGGCTACCTTCCTA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 105290 AGCATCACAGATTGGTG...CAGGCTGCAGTGCGCCTGGCTACCTTCCTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CCTCGCTGGCTTGGCATCCTCAGCAAAGTGAAGTCTTTGTCTTTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 105803 CCTCGCTGGCTTGGCATCCTCAGCAAAGTGAAGTCTTTGTCTTTGGTA..

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692     GTGATGAGAATGGGACAGTCTCCCTTGTGGACACCAAGAGTACAAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105853 .CAGGTGATGAGAATGGGACAGTCTCCCTTGTGGACACCAAGAGTACAAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CTGTGTCCTGAGCTCAGCTGTACACTCCCAGTGTGTCACTGGGCTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106455 CTGTGTCCTGAGCTCAGCTGTACACTCCCAGTGTGTCACTGGGCTGGTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TCTCCCCACACAG         TGTTCCCTTCCTGGCCTCTCTCAGTGAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 106505 TCTCCCCACACAGGTA...TAGTGTTCCCTTCCTGGCCTCTCTCAGTGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GACTGCTCACTTGCTGTGCTGGACTCAAGCCTTTCTGAGTT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 107105 GACTGCTCACTTGCTGTGCTGGACTCAAGCCTTTCTGAGTTGTA...TAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 GTTTAGAAGCCAAGCCCACAGAGACTTTGTGAGAGATGCGACTTGGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107781 GTTTAGAAGCCAAGCCCACAGAGACTTTGTGAGAGATGCGACTTGGTCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 CGCTCAATCACTCCCTGCTTACCACAGTGGGCTGGGACCATCAGGTCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107831 CGCTCAATCACTCCCTGCTTACCACAGTGGGCTGGGACCATCAGGTCGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CACCACGTTGTGCCCACAGAACCTCTCCCAGCCCCTGGACCTGCAAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107881 CACCACGTTGTGCCCACAGAACCTCTCCCAGCCCCTGGACCTGCAAGTGT

   1100     .
   1020 TACTGAG
        |||||||
 107931 TACTGAG