seq1 = pF1KB5110.tfa, 1914 bp
seq2 = pF1KB5110/gi568815587r_126163919.tfa (gi568815587r:126163919_126368804), 204886 bp

>pF1KB5110 1914
>gi568815587r:126163919_126368804 (Chr11)

(complement)

1-117  (100001-100117)   100% ->
118-201  (100719-100802)   100% ->
202-365  (101093-101256)   100% ->
366-526  (101470-101630)   100% ->
527-686  (101883-102042)   100% ->
687-840  (102176-102329)   100% ->
841-932  (102527-102618)   100% ->
933-1051  (102724-102842)   100% ->
1052-1138  (102982-103068)   100% ->
1139-1311  (103365-103537)   100% ->
1312-1525  (103633-103846)   100% ->
1526-1689  (104266-104429)   100% ->
1690-1788  (104516-104614)   100% ->
1789-1914  (104761-104886)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCGACTTCTTCACCATTTTCTCCAAGGGCGGGCTTGTGCTCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTCGACTTCTTCACCATTTTCTCCAAGGGCGGGCTTGTGCTCTGGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCCAGGGCGTTAGCGACTCATGCACCGGACCCGTTAACGCGTTGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCCAGGGCGTTAGCGACTCATGCACCGGACCCGTTAACGCGTTGATTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTTCCGTGCTGCTGCAG         GAACGGGGAGGTAACAACTCCTTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100101 GTTCCGTGCTGCTGCAGGTA...CAGGAACGGGGAGGTAACAACTCCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCCATGAGGCACTCACACTCAAGTATAAACTGGACAACCAGTTTGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100743 ACCCATGAGGCACTCACACTCAAGTATAAACTGGACAACCAGTTTGAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGTGTTTGTG         GTTGGTTTTCAGAAGATCCTGACACTGACAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100793 GGTGTTTGTGGTA...CAGGTTGGTTTTCAGAAGATCCTGACACTGACAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGTAGACAAATTGATAGATGACGTGCATCGGCTGTTTCGGGACAAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101124 ATGTAGACAAATTGATAGATGACGTGCATCGGCTGTTTCGGGACAAGTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGCACAGAGATCCAACAGCAAAGTGCTTTAAGTTTATTAAATGGCACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101174 CGCACAGAGATCCAACAGCAAAGTGCTTTAAGTTTATTAAATGGCACTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGATTTCCAAAATGACTTCCTGCGGCTCCTTCG         TGAAGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101224 TGATTTCCAAAATGACTTCCTGCGGCTCCTTCGGTG...TAGTGAAGCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGAGAGCAGTAAGATCCGTGCTCCCACTACCATGAAGAAATTTGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101478 AGGAGAGCAGTAAGATCCGTGCTCCCACTACCATGAAGAAATTTGAAGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCTGAAAAGGCCAAGAAACCTGTGAGGTCCATGATTGAGACACGGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101528 TCTGAAAAGGCCAAGAAACCTGTGAGGTCCATGATTGAGACACGGGGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AAAGCCCAAGGAAAAAGCAAAGAATAGCAAAAAAAAGGGGGCCAAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101578 AAAGCCCAAGGAAAAAGCAAAGAATAGCAAAAAAAAGGGGGCCAAGAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAG         GTTCTGATGGTCCTTTGGCTACCAGCAAACCAGTCCCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101628 AAGGCA...CAGGTTCTGATGGTCCTTTGGCTACCAGCAAACCAGTCCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCAGAAAAGTCAGGTCTTCCAGTGGGTCCTGAGAACGGAGTAGAACTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101921 GCAGAAAAGTCAGGTCTTCCAGTGGGTCCTGAGAACGGAGTAGAACTTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAAAGAGGAGCTGATCCGCAGGAAGCGCGAGGAGTTCATTCAGAAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101971 CAAAGAGGAGCTGATCCGCAGGAAGCGCGAGGAGTTCATTCAGAAGCATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GGAGGGGTATGGAGAAGTCCAA         CAAGTCCACGAAGTCAGAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 102021 GGAGGGGTATGGAGAAGTCCAAGTG...CAGCAAGTCCACGAAGTCAGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCTCCAAAGGAGAAGGGCAAAAAAGCACCCCGGGTGTGGGAACTGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102195 GCTCCAAAGGAGAAGGGCAAAAAAGCACCCCGGGTGTGGGAACTGGGTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTGTGCTAACAAAGAAGTGTTGGATTACAGTACTCCCACCACCAATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102245 CTGTGCTAACAAAGAAGTGTTGGATTACAGTACTCCCACCACCAATGGAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCCCTGAGGCTGCCTTGTCTGAGGACATCAACCTG         ATTCGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 102295 CCCCTGAGGCTGCCTTGTCTGAGGACATCAACCTGGTA...CAGATTCGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGGACTGGGTCTGGGGGGCAGCTTCAGGATCTGGACTGCAGCAGCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102533 GGGACTGGGTCTGGGGGGCAGCTTCAGGATCTGGACTGCAGCAGCTCTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGACGAAGGGGCTGCTCAAAACTCTACCAAACCTAG         TGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 102583 TGACGAAGGGGCTGCTCAAAACTCTACCAAACCTAGGTA...CAGTGCGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCAAGGGAACACTGGGTGGCATGTTTGGTATGCTGAAGGGCCTTGTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102729 CCAAGGGAACACTGGGTGGCATGTTTGGTATGCTGAAGGGCCTTGTGGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TCAAAGAGCTTGAGTCGTGAAGACATGGAATCTGTGCTGGACAAGATGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102779 TCAAAGAGCTTGAGTCGTGAAGACATGGAATCTGTGCTGGACAAGATGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGATCATCTCATTG         CTAAGAACGTGGCTGCAGACATTGCCG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 102829 TGATCATCTCATTGGTA...CAGCTAAGAACGTGGCTGCAGACATTGCCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TCCAGCTCTGTGAATCTGTTGCCAACAAGTTGGAAGGGAAGGTGATGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103009 TCCAGCTCTGTGAATCTGTTGCCAACAAGTTGGAAGGGAAGGTGATGGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 ACGTTCAGCA         CGGTGACTTCCACAGTAAAGCAAGCCCTACA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 103059 ACGTTCAGCAGTA...CAGCGGTGACTTCCACAGTAAAGCAAGCCCTACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GGAGTCCCTGGTGCAGATTCTGCAGCCACAGCGTCGTGTAGACATGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103396 GGAGTCCCTGGTGCAGATTCTGCAGCCACAGCGTCGTGTAGACATGCTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GGGACATCATGGATGCCCAGCGTCGCCAGCGCCCTTATGTCGTCACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103446 GGGACATCATGGATGCCCAGCGTCGCCAGCGCCCTTATGTCGTCACCTTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TGCGGCGTTAATGGAGTGGGGAAATCTACTAATCTTGCCAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 103496 TGCGGCGTTAATGGAGTGGGGAAATCTACTAATCTTGCCAAGGTC...CA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1312  ATTTCCTTCTGGTTGTTAGAGAATGGCTTCAGTGTCCTCATTGCTGCCT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103632 GATTTCCTTCTGGTTGTTAGAGAATGGCTTCAGTGTCCTCATTGCTGCCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GTGATACATTTCGTGCTGGGGCCGTGGAGCAGCTGCGTACACACACCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103682 GTGATACATTTCGTGCTGGGGCCGTGGAGCAGCTGCGTACACACACCCGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CGTTTGAGTGCCCTACACCCTCCAGAGAAGCATGGTGGCCGCACCATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103732 CGTTTGAGTGCCCTACACCCTCCAGAGAAGCATGGTGGCCGCACCATGGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GCAGTTGTTTGAAAAGGGCTATGGCAAGGATGCTGCTGGCATTGCCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103782 GCAGTTGTTTGAAAAGGGCTATGGCAAGGATGCTGCTGGCATTGCCATGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 AAGCCATTGCTTTTG         CACGTAACCAAGGCTTTGACGTGGTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 103832 AAGCCATTGCTTTTGGTA...TAGCACGTAACCAAGGCTTTGACGTGGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CTGGTGGACACGGCAGGCCGCATGCAAGACAATGCCCCTCTGATGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104292 CTGGTGGACACGGCAGGCCGCATGCAAGACAATGCCCCTCTGATGACTGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CCTGGCCAAACTCATTACTGTCAATACACCTGATTTGGTGCTGTTTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104342 CCTGGCCAAACTCATTACTGTCAATACACCTGATTTGGTGCTGTTTGTAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 GAGAAGCCTTAGTAGGCAATGAAGCCGTGGACCAGCTG         GTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 104392 GAGAAGCCTTAGTAGGCAATGAAGCCGTGGACCAGCTGGTG...CAGGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AAGTTCAACAGAGCCTTGGCTGACCATTCTATGGCTCAGACACCTCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104519 AAGTTCAACAGAGCCTTGGCTGACCATTCTATGGCTCAGACACCTCGGCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CATTGATGGCATTGTTCTTACCAAATTTGATACCATTGATGACAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 104569 CATTGATGGCATTGTTCTTACCAAATTTGATACCATTGATGACAAGGTA.

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1789      GTGGGAGCTGCTATTTCTATGACGTACATCACAAGCAAACCCATC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104619 ..TAGGTGGGAGCTGCTATTTCTATGACGTACATCACAAGCAAACCCATC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GTCTTTGTGGGCACCGGCCAGACCTACTGTGACCTACGCAGCCTCAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104806 GTCTTTGTGGGCACCGGCCAGACCTACTGTGACCTACGCAGCCTCAATGC

   2000     .    :    .    :    .    :
   1884 CAAGGCTGTGGTGGCTGCCCTCATGAAGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 104856 CAAGGCTGTGGTGGCTGCCCTCATGAAGGCT