seq1 = pF1KB5091.tfa, 1812 bp
seq2 = pF1KB5091/gi568815597r_186574356.tfa (gi568815597r:186574356_186780290), 205935 bp

>pF1KB5091 1812
>gi568815597r:186574356_186780290 (Chr1)

(complement)

1-52  (100001-100052)   100% ->
53-169  (100853-100969)   100% ->
170-313  (101090-101233)   100% ->
314-457  (101887-102030)   100% ->
458-639  (102461-102642)   100% ->
640-723  (103375-103458)   100% ->
724-970  (103578-103824)   100% ->
971-1257  (104107-104393)   100% ->
1258-1405  (104895-105042)   100% ->
1406-1812  (105529-105935)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCGCCCGCGCCCTGCTGCTGTGCGCGGTCCTGGCGCTCAGCCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTCGCCCGCGCCCTGCTGCTGTGCGCGGTCCTGGCGCTCAGCCATAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AG         CAAATCCTTGCTGTTCCCACCCATGTCAAAACCGAGGTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGTG...CAGCAAATCCTTGCTGTTCCCACCCATGTCAAAACCGAGGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TATGTATGAGTGTGGGATTTGACCAGTATAAGTGCGATTGTACCCGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100892 TATGTATGAGTGTGGGATTTGACCAGTATAAGTGCGATTGTACCCGGACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGATTCTATGGAGAAAACTGCTCAACAC         CGGAATTTTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100942 GGATTCTATGGAGAAAACTGCTCAACACGTA...CAGCGGAATTTTTGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AAGAATAAAATTATTTCTGAAACCCACTCCAAACACAGTGCACTACATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101103 AAGAATAAAATTATTTCTGAAACCCACTCCAAACACAGTGCACTACATAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTACCCACTTCAAGGGATTTTGGAACGTTGTGAATAACATTCCCTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101153 TTACCCACTTCAAGGGATTTTGGAACGTTGTGAATAACATTCCCTTCCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGAAATGCAATTATGAGTTATGTGTTGACAT         CCAGATCACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101203 CGAAATGCAATTATGAGTTATGTGTTGACATGTA...CAGCCAGATCACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTTGATTGACAGTCCACCAACTTACAATGCTGACTATGGCTACAAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101897 TTTGATTGACAGTCCACCAACTTACAATGCTGACTATGGCTACAAAAGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGGAAGCCTTCTCTAACCTCTCCTATTATACTAGAGCCCTTCCTCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101947 GGGAAGCCTTCTCTAACCTCTCCTATTATACTAGAGCCCTTCCTCCTGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCTGATGATTGCCCGACTCCCTTGGGTGTCAAAG         GTAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101997 CCTGATGATTGCCCGACTCCCTTGGGTGTCAAAGGTG...CAGGTAAAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCAGCTTCCTGATTCAAATGAGATTGTGGAAAAATTGCTTCTAAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102468 GCAGCTTCCTGATTCAAATGAGATTGTGGAAAAATTGCTTCTAAGAAGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGTTCATCCCTGATCCCCAGGGCTCAAACATGATGTTTGCATTCTTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102518 AGTTCATCCCTGATCCCCAGGGCTCAAACATGATGTTTGCATTCTTTGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAGCACTTCACGCATCAGTTTTTCAAGACAGATCATAAGCGAGGGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102568 CAGCACTTCACGCATCAGTTTTTCAAGACAGATCATAAGCGAGGGCCAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTTCACCAACGGGCTGGGCCATGGG         GTGGACTTAAATCATA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102618 TTTCACCAACGGGCTGGGCCATGGGGTA...TAGGTGGACTTAAATCATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTTACGGTGAAACTCTGGCTAGACAGCGTAAACTGCGCCTTTTCAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103391 TTTACGGTGAAACTCTGGCTAGACAGCGTAAACTGCGCCTTTTCAAGGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GGAAAAATGAAATATCAG         ATAATTGATGGAGAGATGTATCC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 103441 GGAAAAATGAAATATCAGGTA...TAGATAATTGATGGAGAGATGTATCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TCCCACAGTCAAAGATACTCAGGCAGAGATGATCTACCCTCCTCAAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103601 TCCCACAGTCAAAGATACTCAGGCAGAGATGATCTACCCTCCTCAAGTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CTGAGCATCTACGGTTTGCTGTGGGGCAGGAGGTCTTTGGTCTGGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103651 CTGAGCATCTACGGTTTGCTGTGGGGCAGGAGGTCTTTGGTCTGGTGCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGTCTGATGATGTATGCCACAATCTGGCTGCGGGAACACAACAGAGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103701 GGTCTGATGATGTATGCCACAATCTGGCTGCGGGAACACAACAGAGTATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CGATGTGCTTAAACAGGAGCATCCTGAATGGGGTGATGAGCAGTTGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103751 CGATGTGCTTAAACAGGAGCATCCTGAATGGGGTGATGAGCAGTTGTTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AGACAAGCAGGCTAATACTGATAG         GAGAGACTATTAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 103801 AGACAAGCAGGCTAATACTGATAGGTA...TAGGAGAGACTATTAAGATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GTGATTGAAGATTATGTGCAACACTTGAGTGGCTATCACTTCAAACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104124 GTGATTGAAGATTATGTGCAACACTTGAGTGGCTATCACTTCAAACTGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 ATTTGACCCAGAACTACTTTTCAACAAACAATTCCAGTACCAAAATCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104174 ATTTGACCCAGAACTACTTTTCAACAAACAATTCCAGTACCAAAATCGTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TTGCTGCTGAATTTAACACCCTCTATCACTGGCATCCCCTTCTGCCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104224 TTGCTGCTGAATTTAACACCCTCTATCACTGGCATCCCCTTCTGCCTGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ACCTTTCAAATTCATGACCAGAAATACAACTATCAACAGTTTATCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104274 ACCTTTCAAATTCATGACCAGAAATACAACTATCAACAGTTTATCTACAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CAACTCTATATTGCTGGAACATGGAATTACCCAGTTTGTTGAATCATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104324 CAACTCTATATTGCTGGAACATGGAATTACCCAGTTTGTTGAATCATTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CCAGGCAAATTGCTGGCAGG         GTTGCTGGTGGTAGGAATGTT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 104374 CCAGGCAAATTGCTGGCAGGGTA...CAGGTTGCTGGTGGTAGGAATGTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CCACCCGCAGTACAGAAAGTATCACAGGCTTCCATTGACCAGAGCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104916 CCACCCGCAGTACAGAAAGTATCACAGGCTTCCATTGACCAGAGCAGGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GATGAAATACCAGTCTTTTAATGAGTACCGCAAACGCTTTATGCTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104966 GATGAAATACCAGTCTTTTAATGAGTACCGCAAACGCTTTATGCTGAAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CCTATGAATCATTTGAAGAACTTACAG         GAGAAAAGGAAATG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 105016 CCTATGAATCATTTGAAGAACTTACAGGTA...CAGGAGAAAAGGAAATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TCTGCAGAGTTGGAAGCACTCTATGGTGACATCGATGCTGTGGAGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105543 TCTGCAGAGTTGGAAGCACTCTATGGTGACATCGATGCTGTGGAGCTGTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TCCTGCCCTTCTGGTAGAAAAGCCTCGGCCAGATGCCATCTTTGGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105593 TCCTGCCCTTCTGGTAGAAAAGCCTCGGCCAGATGCCATCTTTGGTGAAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CCATGGTAGAAGTTGGAGCACCATTCTCCTTGAAAGGACTTATGGGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105643 CCATGGTAGAAGTTGGAGCACCATTCTCCTTGAAAGGACTTATGGGTAAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GTTATATGTTCTCCTGCCTACTGGAAGCCAAGCACTTTTGGTGGAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105693 GTTATATGTTCTCCTGCCTACTGGAAGCCAAGCACTTTTGGTGGAGAAGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 GGGTTTTCAAATCATCAACACTGCCTCAATTCAGTCTCTCATCTGCAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105743 GGGTTTTCAAATCATCAACACTGCCTCAATTCAGTCTCTCATCTGCAATA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 ACGTGAAGGGCTGTCCCTTTACTTCATTCAGTGTTCCAGATCCAGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105793 ACGTGAAGGGCTGTCCCTTTACTTCATTCAGTGTTCCAGATCCAGAGCTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 ATTAAAACAGTCACCATCAATGCAAGTTCTTCCCGCTCCGGACTAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105843 ATTAAAACAGTCACCATCAATGCAAGTTCTTCCCGCTCCGGACTAGATGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 TATCAATCCCACAGTACTACTAAAAGAACGTTCGACTGAACTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105893 TATCAATCCCACAGTACTACTAAAAGAACGTTCGACTGAACTG