seq1 = pF1KB5081.tfa, 1623 bp
seq2 = pF1KB5081/gi568815579r_46675513.tfa (gi568815579r:46675513_46887965), 212453 bp

>pF1KB5081 1623
>gi568815579r:46675513_46887965 (Chr19)

(complement)

1-566  (100001-100566)   100% ->
567-609  (103407-103449)   100% ->
610-657  (103822-103869)   100% ->
658-824  (105417-105583)   100% ->
825-1058  (109058-109291)   100% ->
1059-1253  (110561-110755)   99% ->
1254-1388  (110857-110991)   100% ->
1389-1623  (112219-112453)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGGCCGATCCTCCTCGAGACTCCAAGGGGCTCGCAGCGGCGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGGCCGATCCTCCTCGAGACTCCAAGGGGCTCGCAGCGGCGGAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCGCCAACGGGGGCCTGGCGCTGGCCTCCATCGAGGACCAAGGCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCGCCAACGGGGGCCTGGCGCTGGCCTCCATCGAGGACCAAGGCGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGCAGGCGGCTACTGCGGTTCCCGGGACCAGGTGCGCCGCTGCCTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGCAGGCGGCTACTGCGGTTCCCGGGACCAGGTGCGCCGCTGCCTTCGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCAACCTGCTTGTGCTGCTGACAGTGGTGGCCGTGGTGGCCGGCGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCAACCTGCTTGTGCTGCTGACAGTGGTGGCCGTGGTGGCCGGCGTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGGGACTGGGGGTGTCGGGGGCCGGGGGTGCGCTGGCGTTGGGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGGGACTGGGGGTGTCGGGGGCCGGGGGTGCGCTGGCGTTGGGCCCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCGCTTGAGCGCCTTCGTCTTCCCGGGCGAGCTGCTGCTGCGTCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCGCTTGAGCGCCTTCGTCTTCCCGGGCGAGCTGCTGCTGCGTCTGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGGATGATCATCTTGCCGCTGGTGGTGTGCAGCTTGATCGGCGGCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGGATGATCATCTTGCCGCTGGTGGTGTGCAGCTTGATCGGCGGCGCCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGCCTGGACCCCGGCGCGCTCGGCCGTCTGGGCGCCTGGGCGCTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGCCTGGACCCCGGCGCGCTCGGCCGTCTGGGCGCCTGGGCGCTGCTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTTTCCTGGTCACCACGCTGCTGGCGTCGGCGCTCGGAGTGGGCTTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTTTCCTGGTCACCACGCTGCTGGCGTCGGCGCTCGGAGTGGGCTTGGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGGCTCTGCAGCCGGGCGCCGCCTCCGCCGCCATCAACGCCTCCGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGGCTCTGCAGCCGGGCGCCGCCTCCGCCGCCATCAACGCCTCCGTGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGCCGCGGGCAGTGCCGAAAATGCCCCCAGCAAGGAGGTGCTCGATTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGCCGCGGGCAGTGCCGAAAATGCCCCCAGCAAGGAGGTGCTCGATTCGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCTGGATCTTGCGAG         AAATATCTTCCCTTCCAACCTGGTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100551 TCCTGGATCTTGCGAGGTC...CAGAAATATCTTCCCTTCCAACCTGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TCAGCAGCCTTTCGCTCA         TACTCTACCACCTATGAAGAGAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 103432 TCAGCAGCCTTTCGCTCAGTG...CAGTACTCTACCACCTATGAAGAGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GAATATCACCGGAACCAGGGTGAAG         GTGCCCGTGGGGCAGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 103845 GAATATCACCGGAACCAGGGTGAAGGTG...CAGGTGCCCGTGGGGCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGGTGGAGGGGATGAACATCCTGGGCTTGGTAGTGTTTGCCATCGTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105433 AGGTGGAGGGGATGAACATCCTGGGCTTGGTAGTGTTTGCCATCGTCTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GGTGTGGCGCTGCGGAAGCTGGGGCCTGAAGGGGAGCTGCTTATCCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105483 GGTGTGGCGCTGCGGAAGCTGGGGCCTGAAGGGGAGCTGCTTATCCGCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CTTCAACTCCTTCAATGAGGCCACCATGGTTCTGGTCTCCTGGATCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105533 CTTCAACTCCTTCAATGAGGCCACCATGGTTCTGGTCTCCTGGATCATGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 G         GTACGCCCCTGTGGGCATCATGTTCCTGGTGGCTGGCAAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105583 GGTA...CAGGTACGCCCCTGTGGGCATCATGTTCCTGGTGGCTGGCAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ATCGTGGAGATGGAGGATGTGGGTTTACTCTTTGCCCGCCTTGGCAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109098 ATCGTGGAGATGGAGGATGTGGGTTTACTCTTTGCCCGCCTTGGCAAGTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CATTCTGTGCTGCCTGCTGGGTCACGCCATCCATGGGCTCCTGGTACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109148 CATTCTGTGCTGCCTGCTGGGTCACGCCATCCATGGGCTCCTGGTACTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CCCTCATCTACTTCCTCTTCACCCGCAAAAACCCCTACCGCTTCCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109198 CCCTCATCTACTTCCTCTTCACCCGCAAAAACCCCTACCGCTTCCTGTGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GGCATCGTGACGCCGCTGGCCACTGCCTTTGGGACCTCTTCCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 109248 GGCATCGTGACGCCGCTGGCCACTGCCTTTGGGACCTCTTCCAGGTA...

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1059    TTCCGCCACGCTGCCGCTGATGATGAAGTGCGTGGAGGAGAATAATG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110558 CAGTTCCGCCACGCTGCCGCTGATGATGAAGTGCGTGGAGGAGAATAATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GCGTGGTCAAGCACATCAGCCGTTTCATCCTGCCCATCGGCGCCACCGTC
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110608 GCGTGGCCAAGCACATCAGCCGTTTCATCCTGCCCATCGGCGCCACCGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 AACATGGACGGTGCCGCGCTCTTCCAGTGCGTGGCCGCAGTGTTCATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110658 AACATGGACGGTGCCGCGCTCTTCCAGTGCGTGGCCGCAGTGTTCATTGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 ACAGCTCAGCCAGCAGTCCTTGGACTTCGTAAAGATCATCACCATCCT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 110708 ACAGCTCAGCCAGCAGTCCTTGGACTTCGTAAAGATCATCACCATCCTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1254        GGTCACGGCCACAGCGTCCAGCGTGGGGGCAGCGGGCATCCCT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110758 G...CAGGGTCACGGCCACAGCGTCCAGCGTGGGGGCAGCGGGCATCCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GCTGGAGGTGTCCTCACTCTGGCCATCATCCTCGAAGCAGTCAACCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110900 GCTGGAGGTGTCCTCACTCTGGCCATCATCCTCGAAGCAGTCAACCTCCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 GGTCGACCATATCTCCTTGATCCTGGCTGTGGACTGGCTAGT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 110950 GGTCGACCATATCTCCTTGATCCTGGCTGTGGACTGGCTAGTGTG...TA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1389  CGACCGGTCCTGTACCGTCCTCAATGTAGAAGGTGACGCTCTGGGGGCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112218 GCGACCGGTCCTGTACCGTCCTCAATGTAGAAGGTGACGCTCTGGGGGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 GGACTCCTCCAAAATTACGTGGACCGTACGGAGTCGAGAAGCACAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112268 GGACTCCTCCAAAATTACGTGGACCGTACGGAGTCGAGAAGCACAGAGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 TGAGTTGATACAAGTGAAGAGTGAGCTGCCCCTGGATCCGCTGCCACTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 112318 TGAGTTGATACAAGTGAAGAGTGAGCTGCCCCTGGATCCGCTGCCAGTCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 CCACTGAGGAAGGAAACCCCCTCCTCAAACACTATCGGGGGCCCGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112368 CCACTGAGGAAGGAAACCCCCTCCTCAAACACTATCGGGGGCCCGCAGGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .
   1588 GATGCCACGGTCGCCTCTGAGAAGGAATCAGTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112418 GATGCCACGGTCGCCTCTGAGAAGGAATCAGTCATG