seq1 = pF1KB5063.tfa, 2325 bp
seq2 = pF1KB5063/gi568815595r_48996032.tfa (gi568815595r:48996032_49204733), 208702 bp

>pF1KB5063 2325
>gi568815595r:48996032_49204733 (Chr3)

(complement)

1-117  (100001-100117)   99% ->
118-265  (100263-100410)   100% ->
266-375  (100762-100871)   100% ->
376-451  (101028-101103)   100% ->
452-516  (101325-101389)   100% ->
517-570  (102262-102315)   100% ->
571-631  (102469-102529)   100% ->
632-703  (102835-102906)   100% ->
704-789  (103029-103114)   100% ->
790-876  (103293-103379)   100% ->
877-976  (104060-104159)   100% ->
977-1055  (104276-104354)   100% ->
1056-1164  (104436-104544)   100% ->
1165-1295  (104643-104773)   100% ->
1296-1388  (104881-104973)   100% ->
1389-1526  (105087-105224)   100% ->
1527-1614  (105303-105390)   100% ->
1615-1758  (105481-105624)   100% ->
1759-1863  (105745-105849)   100% ->
1864-1956  (106042-106134)   100% ->
1957-2084  (106254-106381)   100% ->
2085-2151  (106476-106542)   100% ->
2152-2277  (106617-106742)   100% ->
2278-2325  (108655-108702)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCTCTAGACTCCCTGTCGCTCTTCACTAGCCTCGGCCTGAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCTCTAGACTCCCTGTCGCTCTTCACTAGCCTCGGCCTGAGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGAAGGCCCGCGAGACGCTCAAGAACTCGGCTCTGAGCGCGCAGCTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 100051 GCAGAAGGCCCGCGAGACGCTCAAGAACTCGGCTCTGAGCGCGCAGCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGAGGCCGCTACTCAG         GCTCAGCAGACCCTGGGTTCCACC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGAGGCCGCTACTCAGGTG...CAGGCTCAGCAGACCCTGGGTTCCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTGACAAAGCTACCGGGATCCTGTTATATGGCTTGGCCTCCCGACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100287 ATTGACAAAGCTACCGGGATCCTGTTATATGGCTTGGCCTCCCGACTCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGATACCCGGCGTCTCTCCTTCCTTGTAAGCTACATAGCCAGTAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100337 GGATACCCGGCGTCTCTCCTTCCTTGTAAGCTACATAGCCAGTAAGAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCACACTGAGCCCCAGCTAAGCG         CTGCCCTTGAGTATGTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100387 TCCACACTGAGCCCCAGCTAAGCGGTG...CAGCTGCCCTTGAGTATGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGGAGTCACCCCTTGGACCCCATCGACACTGTGGACTTCGAGCGGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100779 CGGAGTCACCCCTTGGACCCCATCGACACTGTGGACTTCGAGCGGGAATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGCGTGGGTGTCATTGTGACCCCAGAGCAGATTGAGGAGGCT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100829 TGGCGTGGGTGTCATTGTGACCCCAGAGCAGATTGAGGAGGCTGTG...C

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    376   GTGGAGGCTGCTATTAACAGGCACCGGCCCCAGCTCCTGGTGGAACGT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101026 AGGTGGAGGCTGCTATTAACAGGCACCGGCCCCAGCTCCTGGTGGAACGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TACCATTTCAACATGGGGCTGCTGATGG         GAGAGGCTCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101076 TACCATTTCAACATGGGGCTGCTGATGGGTG...TAGGAGAGGCTCGGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGTGCTGAAGTGGGCAGATGGCAAAATGATCAAGAATGAAGTGGACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101338 TGTGCTGAAGTGGGCAGATGGCAAAATGATCAAGAATGAAGTGGACATGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AG         GTCCTCCACCTTCTGGGCCCCAAGTTGGAGGCTGATCTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101388 AGGTG...CAGGTCCTCCACCTTCTGGGCCCCAAGTTGGAGGCTGATCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAGAAGAAGTTCAAG         GTGGCAAAAGCTCGGCTAGAAGAAAC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 102301 GAGAAGAAGTTCAAGGTA...CAGGTGGCAAAAGCTCGGCTAGAAGAAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AGACCGGAGGACGGCAAAGGATGTGGTGGAGAATG         GCGAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 102495 AGACCGGAGGACGGCAAAGGATGTGGTGGAGAATGGTG...CAGGCGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 CTGCTGACCAGACCCTGTCTCTGATGGAGCAGCTCCGGGGGGAGGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102841 CTGCTGACCAGACCCTGTCTCTGATGGAGCAGCTCCGGGGGGAGGCCCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 AAGTTCCACAAGCCTG         GTGAGAACTACAAGACCCCAGGCTA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102891 AAGTTCCACAAGCCTGGTT...CAGGTGAGAACTACAAGACCCCAGGCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TGTGGTCACTCCACACACCATGAATCTACTAAAGCAGCACCTGGAGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103054 TGTGGTCACTCCACACACCATGAATCTACTAAAGCAGCACCTGGAGATTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CTGGTGGGCAG         GTACGTACCCGGTTCCCGCCAGAACCCAAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 103104 CTGGTGGGCAGGTG...TAGGTACGTACCCGGTTCCCGCCAGAACCCAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 GGAATCCTGCATATTGGACATGCCAAAGCCATCAATTTCAACTTTGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103323 GGAATCCTGCATATTGGACATGCCAAAGCCATCAATTTCAACTTTGGCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 TGCCAAG         GCCAACAATGGCATCTGTTTTCTGCGTTTTGATG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103373 TGCCAAGGTA...TAGGCCAACAATGGCATCTGTTTTCTGCGTTTTGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 ACACCAACCCTGAGAAGGAGGAAGCAAAGTTCTTCACGGCCATCTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104094 ACACCAACCCTGAGAAGGAGGAAGCAAAGTTCTTCACGGCCATCTGTGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 ATGGTAGCCTGGCTAG         GCTACACACCTTACAAAGTCACATA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 104144 ATGGTAGCCTGGCTAGGTA...CAGGCTACACACCTTACAAAGTCACATA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 TGCGTCTGACTATTTTGACCAGCTATATGCGTGGGCTGTGGAGCTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104301 TGCGTCTGACTATTTTGACCAGCTATATGCGTGGGCTGTGGAGCTCATCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 GCAG         GGGTCTGGCTTATGTGTGCCACCAGCGAGGAGAGGAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104351 GCAGGTA...CAGGGGTCTGGCTTATGTGTGCCACCAGCGAGGAGAGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 CTCAAAGGCCATAATACTCTGCCTTCACCCTGGAGAGACCGTCCCATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104473 CTCAAAGGCCATAATACTCTGCCTTCACCCTGGAGAGACCGTCCCATGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 GGAGTCACTGCTGCTCTTTGAG         GCAATGCGCAAGGGCAAGT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 104523 GGAGTCACTGCTGCTCTTTGAGGTG...CAGGCAATGCGCAAGGGCAAGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 TTTCAGAGGGCGAGGCCACACTACGGATGAAGCTGGTGATGGAGGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104662 TTTCAGAGGGCGAGGCCACACTACGGATGAAGCTGGTGATGGAGGATGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 AAGATGGACCCTGTAGCCTATCGAGTCAAGTATACACCACACCACCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104712 AAGATGGACCCTGTAGCCTATCGAGTCAAGTATACACCACACCACCGCAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 AGGGGACAAATG         GTGCATCTATCCCACCTACGACTACACAC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 104762 AGGGGACAAATGGTG...CAGGTGCATCTATCCCACCTACGACTACACAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 ACTGCCTCTGTGACTCCATCGAGCACATCACTCACTCACTCTGCACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104910 ACTGCCTCTGTGACTCCATCGAGCACATCACTCACTCACTCTGCACCAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 GAATTCCAGGCCCG         ACGCTCTTCCTACTTCTGGCTTTGCAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 104960 GAATTCCAGGCCCGGTG...CAGACGCTCTTCCTACTTCTGGCTTTGCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 TGCACTGGACGTCTATTGCCCTGTGCAGTGGGAGTATGGCCGCCTCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105114 TGCACTGGACGTCTATTGCCCTGTGCAGTGGGAGTATGGCCGCCTCAACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 TGCACTATGCTGTTGTCTCTAAGAGGAAGATCCTCCAGCTTGTAGCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105164 TGCACTATGCTGTTGTCTCTAAGAGGAAGATCCTCCAGCTTGTAGCAACT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 GGTGCTGTGCG         GGACTGGGATGACCCACGGCTCTTTACACT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105214 GGTGCTGTGCGGTA...CAGGGACTGGGATGACCCACGGCTCTTTACACT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1557 CACGGCCCTGCGACGGCGGGGCTTCCCACCTGAGGCCATCAACAACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105333 CACGGCCCTGCGACGGCGGGGCTTCCCACCTGAGGCCATCAACAACTTCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 GTGCCCGG         GTGGGAGTGACTGTGGCACAAACCACAATGGAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 105383 GTGCCCGGGTA...CAGGTGGGAGTGACTGTGGCACAAACCACAATGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1648 CCACATCTTCTAGAAGCCTGTGTGCGTGATGTGCTGAATGACACAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105514 CCACATCTTCTAGAAGCCTGTGTGCGTGATGTGCTGAATGACACAGCCCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1698 ACGAGCCATGGCTGTGCTGGAGTCACTACGGGTCATCATCACCAACTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105564 ACGAGCCATGGCTGTGCTGGAGTCACTACGGGTCATCATCACCAACTTTC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1748 CTGCTGCCAAG         TCCTTGGACATCCAGGTGCCCAACTTCCCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105614 CTGCTGCCAAGGTG...TAGTCCTTGGACATCCAGGTGCCCAACTTCCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1789 GCTGATGAGACCAAAGGCTTCCATCAGGTTCCCTTTGCACCCATTGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105775 GCTGATGAGACCAAAGGCTTCCATCAGGTTCCCTTTGCACCCATTGTCTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1839 CATTGAGAGGACTGACTTCAAGGAG         GAGCCAGAGCCAGGAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 105825 CATTGAGAGGACTGACTTCAAGGAGGTA...TAGGAGCCAGAGCCAGGAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1880 TTAAGCGCCTGGCTTGGGGCCAGCCTGTGGGCCTGAGGCATACAGGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106058 TTAAGCGCCTGGCTTGGGGCCAGCCTGTGGGCCTGAGGCATACAGGCTAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1930 GTCATTGAGCTGCAGCATGTTGTCAAG         GGCCCCAGTGGTTG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 106108 GTCATTGAGCTGCAGCATGTTGTCAAGGTG...CAGGGCCCCAGTGGTTG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1971 TGTAGAGAGTCTGGAGGTGACCTGCAGACGGGCAGATGCTGGAGAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106268 TGTAGAGAGTCTGGAGGTGACCTGCAGACGGGCAGATGCTGGAGAGAAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2021 CAAAGGCCTTTATTCACTGGGTGTCACAGCCTTTGATGTGTGAGGTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106318 CAAAGGCCTTTATTCACTGGGTGTCACAGCCTTTGATGTGTGAGGTTCGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2071 CTCTATGAGCGACT         ATTCCAGCACAAGAACCCTGAAGATCC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 106368 CTCTATGAGCGACTGTG...CAGATTCCAGCACAAGAACCCTGAAGATCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2112 TACTGAGGTGCCTGGTGGATTTTTAAGTGACCTGAACCTG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 106503 TACTGAGGTGCCTGGTGGATTTTTAAGTGACCTGAACCTGGTA...CAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2153 CATCACTACACGTGGTGGATGCAGCATTAGTGGACTGCTCTGTGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106618 CATCACTACACGTGGTGGATGCAGCATTAGTGGACTGCTCTGTGGCCCTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2203 GCAAAACCCTTCGACAAGTTCCAGTTTGAGCGTCTTGGATATTTCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106668 GCAAAACCCTTCGACAAGTTCCAGTTTGAGCGTCTTGGATATTTCTCCGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2253 GGATCCAGACAGCCATCAGGGAAAG         CTTGTCTTTAACCGAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 106718 GGATCCAGACAGCCATCAGGGAAAGGTG...CAGCTTGTCTTTAACCGAA

   2500     .    :    .    :    .    :
   2294 CTGTCACACTGAAGGAAGACCCAGGAAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 108671 CTGTCACACTGAAGGAAGACCCAGGAAAGGTG