seq1 = pF1KB5035.tfa, 576 bp
seq2 = pF1KB5035/gi568815588f_110128224.tfa (gi568815588f:110128224_110384984), 256761 bp

>pF1KB5035 576
>gi568815588f:110128224_110384984 (Chr10)

1-98  (100001-100098)   100% ->
99-128  (116605-116634)   100% ->
129-243  (150957-151071)   100% ->
244-415  (151691-151862)   100% ->
416-576  (156601-156761)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGAGCCCCCGACTGCAGCATTCAAAGCCCCCACGGAGGTTGAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGAGCCCCCGACTGCAGCATTCAAAGCCCCCACGGAGGTTGAGCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCACAGAAACACAGCAGCGGGAGCAGCAACACCAGCACTGCCAACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100051 GGCACAGAAACACAGCAGCGGGAGCAGCAACACCAGCACTGCCAACAGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     99        ATCTACACACAATGAGCTGGAAAAGAATCG         ACGA
        >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100101 A...TAGATCTACACACAATGAGCTGGAAAAGAATCGGTG...TAGACGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GCTCATCTGCGCCTTTGTTTAGAACGCTTAAAAGTTCTGATTCCACTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150961 GCTCATCTGCGCCTTTGTTTAGAACGCTTAAAAGTTCTGATTCCACTAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ACCAGACTGCACCCGGCACACAACACTTGGTTTGCTCAACAAAGCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151011 ACCAGACTGCACCCGGCACACAACACTTGGTTTGCTCAACAAAGCCAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CACACATCAAG         AAACTTGAAGAAGCTGAAAGAAAAAGCCAG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 151061 CACACATCAAGGTG...CAGAAACTTGAAGAAGCTGAAAGAAAAAGCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CACCAGCTCGAGAATTTGGAACGAGAACAGAGATTTTTAAAGTGGCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151721 CACCAGCTCGAGAATTTGGAACGAGAACAGAGATTTTTAAAGTGGCGACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGAACAGCTGCAGGGTCCTCAGGAGATGGAACGAATACGAATGGACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151771 GGAACAGCTGCAGGGTCCTCAGGAGATGGAACGAATACGAATGGACAGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTGGATCAACTATTTCTTCAGATCGTTCTGATTCAGAGCGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 151821 TTGGATCAACTATTTCTTCAGATCGTTCTGATTCAGAGCGAGGTA...CA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    416  AGGAGATTGAAGTGGATGTTGAAAGCACAGAGTTCTCCCATGGAGAAGT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156600 GAGGAGATTGAAGTGGATGTTGAAAGCACAGAGTTCTCCCATGGAGAAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGACAATATAAGTACCACCAGCATCAGTGACATTGATGACCACAGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156650 GGACAATATAAGTACCACCAGCATCAGTGACATTGATGACCACAGCAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGCCGAGTATTGGGAGTGACGAGGGTTACTCCAGTGCCAGTGTCAAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156700 TGCCGAGTATTGGGAGTGACGAGGGTTACTCCAGTGCCAGTGTCAAACTT

    600     .    :
    565 TCATTCACTTCA
        ||||||||||||
 156750 TCATTCACTTCA