seq1 = pF1KB5030.tfa, 852 bp
seq2 = pF1KB5030/gi568815576r_43726004.tfa (gi568815576r:43726004_43962382), 236379 bp

>pF1KB5030 852
>gi568815576r:43726004_43962382 (Chr22)

(complement)

1-169  (100001-100169)   100% ->
170-300  (120451-120581)   100% ->
301-381  (122358-122438)   100% ->
382-508  (123390-123516)   100% ->
509-603  (128649-128743)   100% ->
604-742  (133185-133323)   100% ->
743-852  (136270-136379)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGAGCGAGGCCGAGACCCCCAGCACCCCGGGGGAGTTCGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAGAGCGAGGCCGAGACCCCCAGCACCCCGGGGGAGTTCGAGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGTACTTCGAGTTCCATGGCGTGCGGCTGCCGCCCTTCTGCCGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGTACTTCGAGTTCCATGGCGTGCGGCTGCCGCCCTTCTGCCGCGGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGATGGAGGAGATCGCCAACTTCCCGGTGCGGCCCAGCGACGTGTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGATGGAGGAGATCGCCAACTTCCCGGTGCGGCCCAGCGACGTGTGGATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCACCTACCCCAAGTCCG         GCACCAGCTTGCTGCAGGAGGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100151 GTCACCTACCCCAAGTCCGGTG...CAGGCACCAGCTTGCTGCAGGAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGTCTACTTGGTGAGCCAGGGCGCTGACCCCGATGAGATCGGCTTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120473 GGTCTACTTGGTGAGCCAGGGCGCTGACCCCGATGAGATCGGCTTGATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACATCGACGAGCAGCTCCCGGTCCTGGAGTACCCACAGCCGGGCCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120523 ACATCGACGAGCAGCTCCCGGTCCTGGAGTACCCACAGCCGGGCCTGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATCATCAAG         GAACTGACCTCTCCCCGCCTCATCAAGAGCCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 120573 ATCATCAAGGTA...CAGGAACTGACCTCTCCCCGCCTCATCAAGAGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTGCCCTACCGCTTTCTGCCCTCTGACCTCCACAATGGAGACTCCAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 122390 CCTGCCCTACCGCTTTCTGCCCTCTGACCTCCACAATGGAGACTCCAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    382         GTCATCTATATGGCTCGCAACCCCAAGGATCTGGTGGTGTCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122440 TA...CAGGTCATCTATATGGCTCGCAACCCCAAGGATCTGGTGGTGTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TATTATCAGTTCCACCGCTCTCTGCGGACCATGAGCTACCGAGGCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123432 TATTATCAGTTCCACCGCTCTCTGCGGACCATGAGCTACCGAGGCACCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCAAGAATTCTGCCGGAGGTTTATGAATGATAAGC         TGGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 123482 TCAAGAATTCTGCCGGAGGTTTATGAATGATAAGCGTG...CAGTGGGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACGGCTCCTGGTTTGAGCACGTGCAGGAGTTCTGGGAGCACCGCATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128655 ACGGCTCCTGGTTTGAGCACGTGCAGGAGTTCTGGGAGCACCGCATGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCGAACGTGCTTTTTCTCAAGTATGAAGACATGCATCGG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 128705 TCGAACGTGCTTTTTCTCAAGTATGAAGACATGCATCGGGTG...CAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCTGGTGACGATGGTGGAGCAGCTGGCCAGATTCCTGGGGGTGTCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133187 CCTGGTGACGATGGTGGAGCAGCTGGCCAGATTCCTGGGGGTGTCCTGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACAAGGCCCAGCTGGAAGCCCTGACGGAGCACTGCCACCAGCTGGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133237 ACAAGGCCCAGCTGGAAGCCCTGACGGAGCACTGCCACCAGCTGGTGGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CAGTGCTGCAACGCTGAGGCCCTGCCCGTGGGCCGGG         GAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 133287 CAGTGCTGCAACGCTGAGGCCCTGCCCGTGGGCCGGGGTA...CAGGAAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AGTTGGGCTGTGGAAGGACATCTTCACCGTCTCCATGAATGAGAAGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136274 AGTTGGGCTGTGGAAGGACATCTTCACCGTCTCCATGAATGAGAAGTTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACTTGGTGTATAAACAGAAGATGGGAAAGTGTGACCTCACGTTTGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136324 ACTTGGTGTATAAACAGAAGATGGGAAAGTGTGACCTCACGTTTGACTTT

    900     .
    847 TATTTA
        ||||||
 136374 TATTTA